More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0447 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0447  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 
307 aa  628  1e-179  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0752  phage integrase family site specific recombinase  42.71 
 
 
309 aa  255  6e-67  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.232674  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0341  phage integrase family site specific recombinase  40.67 
 
 
311 aa  238  1e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0666  Phage integrase, N-terminal SAM- like  40.33 
 
 
310 aa  231  8.000000000000001e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.555034  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1220  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.55 
 
 
330 aa  223  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4114  site-specific tyrosine recombinase XerC  40.2 
 
 
322 aa  219  5e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1916  site-specific tyrosine recombinase XerC  40.75 
 
 
315 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.391518  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1844  site-specific tyrosine recombinase XerC  40.75 
 
 
315 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.104424  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0942  site-specific tyrosine recombinase XerC  41.78 
 
 
315 aa  215  8e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2933  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.59 
 
 
313 aa  210  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.83049  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2381  site-specific tyrosine recombinase XerC  40.6 
 
 
311 aa  211  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3960  site-specific tyrosine recombinase XerC  41.08 
 
 
311 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011638  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1457  integrase family protein  39.38 
 
 
326 aa  209  5e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5002  hypothtical protein  39.13 
 
 
308 aa  206  3e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0748381  hitchhiker  0.0000000255834 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3661  site-specific tyrosine recombinase XerC  40.07 
 
 
311 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2501  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.93 
 
 
312 aa  203  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  0.936606 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1030  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.53 
 
 
307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3403  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.71 
 
 
313 aa  195  7e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1222  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.02 
 
 
306 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.120622 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0083  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.42 
 
 
322 aa  193  3e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0177  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.97 
 
 
323 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4655  tyrosine recombinase XerC  37.34 
 
 
365 aa  192  5e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.223284 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2064  phage integrase  39.8 
 
 
297 aa  192  5e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4288  tyrosine recombinase XerC  37.34 
 
 
365 aa  192  7e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.710874 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4805  tyrosine recombinase XerC  38.26 
 
 
367 aa  192  8e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104736  normal  0.146847 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0271  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.18 
 
 
351 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28022  normal  0.462537 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0553  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.31 
 
 
329 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172687  normal  0.167276 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0401  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.33 
 
 
324 aa  188  8e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.145415 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.31 
 
 
313 aa  188  8e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2809  phage integrase family protein  40.07 
 
 
311 aa  188  8e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0563  site-specific tyrosine recombinase XerC  40 
 
 
306 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.792208  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0928  integrase family protein  38.97 
 
 
326 aa  188  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.669409 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2215  site-specific tyrosine recombinase XerC  40 
 
 
306 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0247  integrase family protein  38.62 
 
 
322 aa  186  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121071  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0163  integrase family protein  36.6 
 
 
342 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.70922  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3124  integrase family protein  35.86 
 
 
323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3189  integrase family protein  38.83 
 
 
320 aa  183  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00303256 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1177  integrase family protein  38.21 
 
 
329 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.151473 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0238  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.46 
 
 
306 aa  181  9.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0625179  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0180  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.33 
 
 
324 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0536  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.07 
 
 
300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.538013  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.06 
 
 
324 aa  177  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0426  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.85 
 
 
321 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0259  phage integrase  37.59 
 
 
297 aa  159  7e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.389161 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  33.79 
 
 
335 aa  157  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0222  phage integrase family protein  36.65 
 
 
308 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.64 
 
 
296 aa  153  4e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.64 
 
 
296 aa  151  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.64 
 
 
296 aa  151  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.64 
 
 
296 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.3 
 
 
296 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.3 
 
 
296 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.3 
 
 
296 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.77 
 
 
296 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.77 
 
 
296 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.77 
 
 
296 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.3 
 
 
296 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  31.37 
 
 
307 aa  150  3e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  34.98 
 
 
307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  33.94 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  33.57 
 
 
290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  31.65 
 
 
317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  33.44 
 
 
295 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1585  site-specific recombinase XerD-like  32.8 
 
 
332 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.264485  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0967  integrase family protein  33.44 
 
 
373 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  30.79 
 
 
298 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6023  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.76 
 
 
303 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  33.99 
 
 
304 aa  143  4e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  31.91 
 
 
296 aa  143  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  33.68 
 
 
304 aa  142  9e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  30.1 
 
 
295 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  34.33 
 
 
332 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  29.43 
 
 
302 aa  140  3e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  32.4 
 
 
312 aa  140  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  32.09 
 
 
305 aa  140  3e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  29.08 
 
 
302 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69710  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.74 
 
 
303 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.737312  normal  0.478185 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  33.68 
 
 
296 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  29.77 
 
 
295 aa  139  7e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  29.77 
 
 
295 aa  139  7e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  34.59 
 
 
314 aa  139  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  29.08 
 
 
302 aa  139  8.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  33.22 
 
 
296 aa  138  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  32.43 
 
 
308 aa  138  1e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15230  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.21 
 
 
316 aa  138  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0614301  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  33.45 
 
 
294 aa  137  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  30.39 
 
 
303 aa  137  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  34.23 
 
 
299 aa  137  2e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  31.37 
 
 
309 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  32.87 
 
 
295 aa  137  2e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  32.87 
 
 
306 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  34.52 
 
 
295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  32.01 
 
 
343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  31.99 
 
 
293 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  31.85 
 
 
295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.76 
 
 
299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  35.4 
 
 
301 aa  136  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  32.01 
 
 
343 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  30.33 
 
 
307 aa  136  4e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  31.16 
 
 
310 aa  136  4e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>