More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1839 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1839  phage integrase family protein  100 
 
 		 193 aa  395  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.637517  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1689  phage integrase family protein  67.02 
 
 		 190 aa  268  5e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2812  integrase family protein  64.4 
 
 		 188 aa  258  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0500  integrase family protein  64.4 
 
 		 188 aa  254  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2063  phage integrase family protein  51.58 
 
 		 188 aa  202  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.668188  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1075  integrase family protein  49.47 
 
 		 190 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0081  integrase family protein  48.7 
 
 		 189 aa  188  5e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0076  integrase family protein  48.69 
 
 		 189 aa  186  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0163  integrase family protein  48.17 
 
 		 189 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2946  phage integrase family protein  46.6 
 
 		 190 aa  178  5.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.329988 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0140  hypothetical protein  38.3 
 
 		 194 aa  122  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4322  phage integrase family protein  34.87 
 
 		 193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.205034  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0123  hypothetical protein  68.18 
 
 		 71 aa  97.4  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.262124  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5700  integrase family protein  34.86 
 
 		 226 aa  97.1  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4571  integrase family protein  30.43 
 
 		 221 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.624666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5382  phage integrase  30.84 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.31221  hitchhiker  0.00239771 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4358  phage integrase family protein  25.96 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.436387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4647  integrase family protein  28.19 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6742  integrase family protein  29.49 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0872  integrase family protein  31.52 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4451  phage integrase  32.39 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1228  hypothetical protein  34.03 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  30.27 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3102  integrase family protein  29.59 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000184896  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4273  integrase family protein  25.38 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.42005  normal  0.068032 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2107  integrase family protein  25.38 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.26894 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0116  Phage integrase, N-terminal SAM- like  28.57 
 
 		 309 aa  68.9  0.00000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2815  integrase/recombinase XerD  29.74 
 
 		 311 aa  68.6  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  27.66 
 
 		 282 aa  68.6  0.00000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  29.03 
 
 		 313 aa  68.2  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  27.27 
 
 		 292 aa  67.8  0.00000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1821  integrase family protein  32.4 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0364742  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3701  integrase family protein  31.46 
 
 		 392 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0952  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.76 
 
 		 329 aa  66.6  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  30.27 
 
 		 277 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.79 
 
 		 299 aa  65.5  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  32.08 
 
 		 294 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1026  integrase family protein  28.18 
 
 		 283 aa  64.7  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319361  normal  0.791294 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3476  integrase family protein  26.84 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  27.57 
 
 		 290 aa  64.3  0.0000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1924  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.75 
 
 		 369 aa  64.3  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0242507  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1224  Tn554, transposase A  29.5 
 
 		 361 aa  63.9  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0995985  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1347  Tn554, transposase A  29.5 
 
 		 361 aa  63.9  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.444384  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2506  transposase A  29.5 
 
 		 361 aa  63.9  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0043  phage integrase family protein  29.5 
 
 		 361 aa  63.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0043  phage integrase family protein  29.5 
 
 		 361 aa  63.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1751  phage integrase family protein  29.5 
 
 		 361 aa  63.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.252007  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1717  phage integrase family protein  29.5 
 
 		 361 aa  63.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1918  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.75 
 
 		 369 aa  64.3  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.250204  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  29.32 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  29.08 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  28.48 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0306  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.11 
 
 		 366 aa  62.8  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  27.86 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.11 
 
 		 366 aa  62.8  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0978  phage integrase family protein  28.98 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5980  phage integrase family protein  30.56 
 
 		 364 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.409193 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1704  phage integrase family protein  30.56 
 
 		 364 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5577  phage integrase  30.56 
 
 		 344 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  29.28 
 
 		 301 aa  61.6  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.71 
 
 		 298 aa  61.6  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  32.6 
 
 		 313 aa  61.6  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  29.53 
 
 		 302 aa  61.6  0.000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  25.65 
 
 		 298 aa  61.6  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1659  tyrosine recombinase XerD  33.94 
 
 		 254 aa  61.2  0.000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3892  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.28 
 
 		 299 aa  61.6  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0920  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.52 
 
 		 299 aa  61.2  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0879  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.52 
 
 		 299 aa  61.2  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.201006  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  26.94 
 
 		 299 aa  61.2  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3847  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.52 
 
 		 299 aa  61.2  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.349121 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02726  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.66 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0798  tyrosine recombinase XerD  27.66 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.966972  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  27.88 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3027  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.66 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02689  hypothetical protein  27.66 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.364794  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3053  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.66 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3275  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.66 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.66 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  28.25 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4185  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.66 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0350  phage integrase family protein  28.75 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000105216  hitchhiker  0.0000498769 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1481  phage integrase family protein  27.32 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0281722  normal  0.205606 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0815  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.66 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.624778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3278  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.66 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3314  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.66 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  32.75 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3220  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.66 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3380  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.66 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0067  phage integrase family protein  29.81 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3200  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.66 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  27.88 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20700  site-specific recombinase, integrase family  28.5 
 
 		 395 aa  60.1  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0537  tyrosine recombinase XerD subunit  29.84 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06590  site-specific recombinase, integrase family  28.5 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0527476  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3980  phage integrase family protein  31.85 
 
 		 365 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  26.84 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3189  integrase family protein  28.9 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000247196  hitchhiker  0.000000000920932 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3426  tyrosine recombinase XerD  29.28 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  27.53 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0173  tyrosine recombinase XerD  25.41 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.861385  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>