More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2946 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2946  phage integrase family protein  100 
 
 		 190 aa  393  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.329988 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0500  integrase family protein  50.26 
 
 		 188 aa  191  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2812  integrase family protein  51.05 
 
 		 188 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1839  phage integrase family protein  46.6 
 
 		 193 aa  178  4.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.637517  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1689  phage integrase family protein  42.93 
 
 		 190 aa  165  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2063  phage integrase family protein  42.86 
 
 		 188 aa  161  6e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.668188  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0076  integrase family protein  43.68 
 
 		 189 aa  158  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0081  integrase family protein  42.11 
 
 		 189 aa  156  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0163  integrase family protein  38.42 
 
 		 189 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1075  integrase family protein  37.7 
 
 		 190 aa  142  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0140  hypothetical protein  35.48 
 
 		 194 aa  115  5e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4322  phage integrase family protein  31.09 
 
 		 193 aa  94  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.205034  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5382  phage integrase  29.11 
 
 		 228 aa  92.4  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.31221  hitchhiker  0.00239771 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5700  integrase family protein  32.24 
 
 		 226 aa  92.4  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4647  integrase family protein  31.02 
 
 		 223 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6742  integrase family protein  27.27 
 
 		 236 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4273  integrase family protein  28.99 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.42005  normal  0.068032 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2107  integrase family protein  28.99 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.26894 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0043  phage integrase family protein  30.21 
 
 		 361 aa  76.6  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1751  phage integrase family protein  30.21 
 
 		 361 aa  76.6  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.252007  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1224  Tn554, transposase A  30.21 
 
 		 361 aa  76.6  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0995985  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1347  Tn554, transposase A  30.21 
 
 		 361 aa  76.6  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.444384  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2506  transposase A  30.21 
 
 		 361 aa  76.6  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0043  phage integrase family protein  30.21 
 
 		 361 aa  76.6  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1717  phage integrase family protein  30.21 
 
 		 361 aa  76.6  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4451  phage integrase  27.32 
 
 		 229 aa  74.7  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4571  integrase family protein  25.84 
 
 		 221 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.624666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5304  site-specific recombinase, phage integrase family  31.49 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  29.41 
 
 		 300 aa  68.9  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2124  phage integrase family protein  27.37 
 
 		 301 aa  68.2  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.308322  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  27.84 
 
 		 295 aa  67.8  0.00000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  29.24 
 
 		 304 aa  67  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5582  integrase family protein  25.13 
 
 		 313 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4540  transposase A  29.02 
 
 		 361 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  31.89 
 
 		 411 aa  66.2  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  28.02 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0123  hypothetical protein  45.45 
 
 		 71 aa  65.9  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.262124  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4358  phage integrase family protein  22.64 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.436387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  27.93 
 
 		 284 aa  64.7  0.0000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0027  integrase/recombinase  27.32 
 
 		 325 aa  64.7  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000824478  normal  0.490771 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  29.26 
 
 		 397 aa  62.4  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  26.86 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3476  integrase family protein  28.42 
 
 		 174 aa  62  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1185  phage integrase family protein  24.86 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00690161  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  27.27 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.02 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1519  integrase family protein  26.49 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959361  decreased coverage  3.1361700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0026  Phage integrase  28.21 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4020  phage integrase family protein  28.5 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  29.03 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3829  site-specific recombinase, phage integrase family  24.31 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000329942 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0998  phage integrase family protein  24.19 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00570052  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  24.32 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00295  site-specific recombinase, phage integrase family protein  27.85 
 
 		 297 aa  58.2  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2237  site-specific recombinase XerD-like  30.34 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0311543  normal  0.392069 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0431  phage integrase  29.94 
 
 		 291 aa  57.8  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.173073 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4897  integrase family protein  28.26 
 
 		 336 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.89 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1673  integrase family protein  27.71 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000152851  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1586  phage integrase family site specific recombinase  24.31 
 
 		 176 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.645051  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1370  phage integrase family site specific recombinase  24.86 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1343  phage integrase family site specific recombinase  24.31 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.311312  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1622  site-specific recombinase, phage integrase family  24.31 
 
 		 176 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1342  phage integrase family site specific recombinase  24.31 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1553  site-specific recombinase, phage integrase family  24.31 
 
 		 176 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100783 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  25.91 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1481  phage integrase family site specific recombinase  24.86 
 
 		 176 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  28.25 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1516  site-specific recombinase, phage integrase family  24.31 
 
 		 176 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3558  phage integrase family protein  29.94 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1023  integrase family protein  25.84 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0854512  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0722  phage integrase family protein  26.49 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0599364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3794  integrase family protein  29.03 
 
 		 445 aa  57  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0397442 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3743  integrase family protein  29.03 
 
 		 445 aa  57  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  26.14 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  27.78 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3884  phage integrase family site specific recombinase  27.75 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1689  integrase family protein  25.77 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0836065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0872  integrase family protein  23.96 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3139  phage integrase family protein  29.83 
 
 		 344 aa  57  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424721  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  30.43 
 
 		 311 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5625  integrase family protein  23.6 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3218  phage integrase family protein  27.75 
 
 		 310 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000104017 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1148  phage integrase family protein  25.98 
 
 		 376 aa  57  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000721683  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.89 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.89 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.89 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.89 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4851  integrase family protein  24.28 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.89 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.89 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  27.22 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4229  phage integrase family protein  25 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3407  integrase family protein  26.94 
 
 		 325 aa  55.8  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.89 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1891  phage integrase family protein  26.55 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  28.49 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1384  integrase family protein  23.76 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.334457  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.89 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.89 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>