More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1689 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1689  integrase family protein  100 
 
 		 292 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0836065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  61.2 
 
 		 304 aa  377  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0722  phage integrase family protein  56.91 
 
 		 306 aa  352  4e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0599364 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1201  phage integrase  55.71 
 
 		 301 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0529826  normal  0.150621 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0787  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E-like protein  49.66 
 
 		 320 aa  301  1e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00453269  unclonable  0.000000000000100471 
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  32.13 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  29 
 
 		 305 aa  140  3e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  31.72 
 
 		 300 aa  139  7e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  29.9 
 
 		 302 aa  139  7.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  32.51 
 
 		 295 aa  139  7.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  31.7 
 
 		 307 aa  139  7.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  31.29 
 
 		 296 aa  138  8.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  31.54 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3550  integrase family protein  29.7 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0318  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.07 
 
 		 300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.36 
 
 		 299 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6023  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.52 
 
 		 303 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  32.87 
 
 		 301 aa  135  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0222  integrase/recombinase XerC  30.14 
 
 		 299 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  32.07 
 
 		 312 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0736  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.38 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  31.13 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69710  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.71 
 
 		 303 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.737312  normal  0.478185 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.31 
 
 		 300 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  30.2 
 
 		 304 aa  132  6.999999999999999e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  30.64 
 
 		 310 aa  132  7.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.31 
 
 		 300 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2036  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.31 
 
 		 300 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0541579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0825  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.06 
 
 		 277 aa  132  9e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104756  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  29.19 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5501  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.61 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345753  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5230  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.39 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.4 
 
 		 300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0727  tyrosine recombinase XerD  31 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0242  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.39 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.322874  normal  0.826572 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47730  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.34 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0435757  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  30.67 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  31.23 
 
 		 306 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4127  tyrosine recombinase XerC  28.47 
 
 		 301 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.442069 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0497  tyrosine recombinase XerC  30.04 
 
 		 324 aa  129  6e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.237269  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.38 
 
 		 296 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.38 
 
 		 296 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.38 
 
 		 296 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.38 
 
 		 296 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  30.72 
 
 		 302 aa  129  7.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.69 
 
 		 298 aa  129  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.38 
 
 		 296 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.38 
 
 		 296 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.38 
 
 		 296 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3474  site-specific tyrosine recombinase XerC  30 
 
 		 296 aa  129  9.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5291  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.62 
 
 		 299 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5139  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.68 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.38 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.93 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  29.37 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.38 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  32.63 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  32.23 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  29.43 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0234  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.2 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2391  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.28 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  30.11 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.03 
 
 		 296 aa  127  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3643  tyrosine recombinase XerD  30.74 
 
 		 309 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  30.51 
 
 		 295 aa  127  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.69 
 
 		 296 aa  127  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  30.14 
 
 		 303 aa  127  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646575 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  29.94 
 
 		 313 aa  127  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3012  tyrosine recombinase XerD subunit  29.05 
 
 		 295 aa  126  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146868  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  30.51 
 
 		 295 aa  127  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  30.53 
 
 		 304 aa  126  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  33.33 
 
 		 302 aa  127  3e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0890  tyrosine recombinase XerD  31.8 
 
 		 300 aa  127  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.267893  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3524  tyrosine recombinase XerD  30.14 
 
 		 309 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.59 
 
 		 298 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4805  tyrosine recombinase XerC  28.66 
 
 		 367 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104736  normal  0.146847 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.87 
 
 		 299 aa  126  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  32.39 
 
 		 295 aa  126  5e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0184  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.67 
 
 		 303 aa  126  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.72736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  30.04 
 
 		 294 aa  125  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2544  tyrosine recombinase XerC  28.05 
 
 		 318 aa  125  6e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.774585  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  29.93 
 
 		 301 aa  125  6e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0401  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.13 
 
 		 324 aa  125  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.145415 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4277  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.73 
 
 		 300 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3449  tyrosine recombinase XerD  30.14 
 
 		 300 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1023  integrase family protein  30.47 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0854512  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4229  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.73 
 
 		 300 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4336  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.73 
 
 		 300 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4159  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.73 
 
 		 300 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.937296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0247  integrase family protein  32.6 
 
 		 322 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121071  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  28.57 
 
 		 291 aa  124  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2567  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.67 
 
 		 313 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0843  tyrosine recombinase XerD  30.14 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0273  tyrosine recombinase XerC  29.23 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.007038  normal  0.809464 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3312  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.17 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  30.45 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.91 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4009  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.8 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0543  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.8 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4288  tyrosine recombinase XerC  29.66 
 
 		 365 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.710874 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>