More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_0500 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_0500  integrase family protein  100 
 
 		 188 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2812  integrase family protein  94.68 
 
 		 188 aa  368  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1839  phage integrase family protein  64.4 
 
 		 193 aa  254  4e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.637517  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1689  phage integrase family protein  58.85 
 
 		 190 aa  237  5.999999999999999e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2063  phage integrase family protein  56.38 
 
 		 188 aa  228  5e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.668188  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0076  integrase family protein  53.44 
 
 		 189 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1075  integrase family protein  51.58 
 
 		 190 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0081  integrase family protein  51.85 
 
 		 189 aa  197  7e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2946  phage integrase family protein  50.26 
 
 		 190 aa  191  5e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.329988 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0163  integrase family protein  48.68 
 
 		 189 aa  187  5.999999999999999e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0140  hypothetical protein  39.25 
 
 		 194 aa  137  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4322  phage integrase family protein  36.65 
 
 		 193 aa  120  8e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.205034  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0123  hypothetical protein  71.21 
 
 		 71 aa  95.5  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.262124  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  36.54 
 
 		 294 aa  91.3  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5700  integrase family protein  34.03 
 
 		 226 aa  90.1  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5382  phage integrase  32.11 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.31221  hitchhiker  0.00239771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1228  hypothetical protein  37.14 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  32.05 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  31.61 
 
 		 332 aa  75.5  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4451  phage integrase  34.03 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3102  integrase family protein  29.84 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000184896  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3458  tyrosine recombinase XerD  34.27 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4571  integrase family protein  28.57 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.624666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4647  integrase family protein  28.26 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4358  phage integrase family protein  27.14 
 
 		 221 aa  72  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.436387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 		 313 aa  71.6  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  30.13 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.38 
 
 		 298 aa  68.2  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0684  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.04 
 
 		 324 aa  67  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.631001  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  32.79 
 
 		 277 aa  67  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0772  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.04 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2992  tyrosine recombinase XerD  33.94 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  33.53 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1519  integrase family protein  31.07 
 
 		 279 aa  65.5  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959361  decreased coverage  3.1361700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  28.3 
 
 		 304 aa  65.5  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.34 
 
 		 321 aa  65.1  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3476  integrase family protein  27.32 
 
 		 174 aa  64.3  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2107  integrase family protein  28.22 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.26894 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  31.68 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4273  integrase family protein  28.22 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.42005  normal  0.068032 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  31.1 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  32.05 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5643  tyrosine recombinase XerD  32.05 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.776137 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6742  integrase family protein  29.41 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  30.19 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0519  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.27 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0998774  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3218  phage integrase family protein  28.65 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000104017 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0537  tyrosine recombinase XerD subunit  31.84 
 
 		 302 aa  61.6  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3665  integrase family protein  32.14 
 
 		 313 aa  61.2  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211751 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2544  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.49 
 
 		 308 aa  61.2  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  29.51 
 
 		 282 aa  61.2  0.000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  24.48 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  29.22 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  29.44 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  31.41 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2260  integrase family protein  32.32 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.46728  normal  0.0539974 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2127  tyrosine recombinase XerD  31.85 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  29.12 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3884  phage integrase family site specific recombinase  28.65 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00295  site-specific recombinase, phage integrase family protein  30 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2976  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  29.35 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0607408  normal  0.0219571 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0563  phage integrase family protein  27.32 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.00000738062  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0945  phage integrase family protein  27.32 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.237394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  30.43 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3109  cointegrate resolution protein S  29.35 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00637573  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1659  tyrosine recombinase XerD  32.69 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  30.82 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.38 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1205  integrase/recombinase XerD  28.22 
 
 		 274 aa  58.5  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5304  site-specific recombinase, phage integrase family  29.73 
 
 		 322 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3558  phage integrase family protein  28.42 
 
 		 311 aa  58.5  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1335  Integrase  29.14 
 
 		 351 aa  58.5  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.128026  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1146  tyrosine recombinase XerD  32.96 
 
 		 286 aa  58.5  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1806  Integrase  29.14 
 
 		 351 aa  58.5  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0548075  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0030  Integrase  29.14 
 
 		 351 aa  58.5  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0264646  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3191  tyrosine recombinase XerD subunit  31.61 
 
 		 300 aa  58.5  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0310  Integrase  29.14 
 
 		 351 aa  58.5  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.004878  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  32.48 
 
 		 295 aa  58.5  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  30.72 
 
 		 295 aa  58.5  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0577  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.79 
 
 		 305 aa  58.2  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0855221  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0163  integrase family protein  30.07 
 
 		 342 aa  58.2  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.70922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2124  phage integrase family protein  27.42 
 
 		 301 aa  58.2  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.308322  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5218  integrase family protein  27.54 
 
 		 326 aa  58.2  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  26.75 
 
 		 302 aa  58.2  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02665  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.79 
 
 		 336 aa  58.2  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  29.52 
 
 		 292 aa  58.2  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  28.8 
 
 		 298 aa  58.2  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  27.81 
 
 		 302 aa  57.8  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  31.29 
 
 		 297 aa  57.8  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3426  tyrosine recombinase XerD  30.94 
 
 		 299 aa  57.8  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  30.65 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  30.13 
 
 		 302 aa  57  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2567  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.73 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  33.12 
 
 		 296 aa  57  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0971  integrase family protein  33.33 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1723  Phage integrase  26.2 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  32.05 
 
 		 324 aa  57  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1196  tyrosine recombinase XerD  30.17 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0670859  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1695  phage integrase family protein  29.55 
 
 		 296 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.363626  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  30.57 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>