More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3476 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3476  integrase family protein  100 
 
 		 174 aa  359  1e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1673  integrase family protein  27.1 
 
 		 374 aa  73.9  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000152851  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4322  phage integrase family protein  29.12 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.205034  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5577  phage integrase  32.7 
 
 		 344 aa  67.8  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5980  phage integrase family protein  32.7 
 
 		 364 aa  67.4  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.409193 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1704  phage integrase family protein  32.7 
 
 		 364 aa  67.4  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1839  phage integrase family protein  26.84 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.637517  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1075  integrase family protein  27.72 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0500  integrase family protein  27.32 
 
 		 188 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2812  integrase family protein  26.78 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2946  phage integrase family protein  28.42 
 
 		 190 aa  62  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.329988 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0401  integrase family protein  29.05 
 
 		 310 aa  61.6  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2246  integrase family protein  25 
 
 		 382 aa  60.8  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0989454  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1288  integrase family protein  25 
 
 		 382 aa  60.8  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00250501  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.56 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.56 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.56 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.56 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.56 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  31.08 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.51 
 
 		 299 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.51 
 
 		 299 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0081  integrase family protein  27.03 
 
 		 189 aa  57.4  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.97 
 
 		 299 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4385  integrase family protein  28.86 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4540  transposase A  28.05 
 
 		 361 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2982  integrase family protein  28.86 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4359  integrase family protein  28.86 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.97 
 
 		 299 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1217  integrase family protein  28.86 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.66 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0140  hypothetical protein  28.02 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2782  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  29.51 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20700  site-specific recombinase, integrase family  29.7 
 
 		 395 aa  55.8  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06590  site-specific recombinase, integrase family  29.7 
 
 		 312 aa  55.8  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0527476  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  29.73 
 
 		 307 aa  55.5  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0076  integrase family protein  26.09 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.2 
 
 		 299 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  27.89 
 
 		 300 aa  55.5  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1224  Tn554, transposase A  26.38 
 
 		 361 aa  55.1  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0995985  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1347  Tn554, transposase A  26.38 
 
 		 361 aa  55.1  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.444384  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2506  transposase A  26.38 
 
 		 361 aa  55.1  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0043  phage integrase family protein  26.38 
 
 		 361 aa  55.1  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1717  phage integrase family protein  26.38 
 
 		 361 aa  55.1  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0043  phage integrase family protein  26.38 
 
 		 361 aa  55.1  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1751  phage integrase family protein  26.38 
 
 		 361 aa  55.1  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.252007  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  24.46 
 
 		 310 aa  54.7  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  29.73 
 
 		 307 aa  54.3  0.0000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  30.52 
 
 		 284 aa  53.9  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  29.03 
 
 		 295 aa  54.3  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4150  integrase family protein  37.8 
 
 		 373 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.333103 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1994  integrase family protein  26.17 
 
 		 315 aa  53.9  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000947418  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0163  integrase family protein  29.1 
 
 		 189 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  28.65 
 
 		 307 aa  54.3  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  29.14 
 
 		 322 aa  53.9  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5939  phage integrase family protein  33.55 
 
 		 395 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  29.45 
 
 		 296 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0971  integrase family protein  36.67 
 
 		 328 aa  53.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1227  integrase family protein  25.64 
 
 		 305 aa  53.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.842173  decreased coverage  0.000216705 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2063  phage integrase family protein  25.85 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.668188  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0626  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.41 
 
 		 315 aa  52.8  0.000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  29.82 
 
 		 293 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5165  integrase family protein  25.57 
 
 		 291 aa  52.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0777  integrase family protein  28.31 
 
 		 425 aa  52.4  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000241017 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1205  integrase/recombinase XerD  28.49 
 
 		 274 aa  52.4  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3924  integrase family protein  26.22 
 
 		 321 aa  52  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.733894 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1484  phage integrase family protein  28.17 
 
 		 341 aa  51.6  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.269781  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  26.5 
 
 		 300 aa  51.6  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1689  phage integrase family protein  24.32 
 
 		 190 aa  51.6  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  27.92 
 
 		 302 aa  51.2  0.000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  26.9 
 
 		 302 aa  51.6  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1209  phage integrase family site specific recombinase  30.3 
 
 		 305 aa  51.2  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.764611  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2243  integrase family protein  23.56 
 
 		 634 aa  51.2  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00308356 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4358  phage integrase family protein  39.68 
 
 		 221 aa  50.8  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.436387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1915  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.35 
 
 		 345 aa  50.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279776  hitchhiker  0.00138491 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2900  phage integrase  27.92 
 
 		 391 aa  50.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1431  phage integrase  29.56 
 
 		 309 aa  50.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.145363  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0524  integrase family protein  24.74 
 
 		 407 aa  50.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.236803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.65 
 
 		 298 aa  50.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2992  tyrosine recombinase XerD  35.34 
 
 		 308 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1924  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.9 
 
 		 325 aa  49.7  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.239497 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3701  integrase family protein  26.37 
 
 		 392 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  28.49 
 
 		 392 aa  50.1  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.91 
 
 		 300 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3066  integrase family protein  29.37 
 
 		 390 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0221886  normal  0.652565 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.11 
 
 		 299 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  24.29 
 
 		 411 aa  49.7  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6953  integrase family protein  28.87 
 
 		 405 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4571  integrase family protein  36.51 
 
 		 221 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.624666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  26.8 
 
 		 397 aa  49.3  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2981  integrase family protein  24 
 
 		 307 aa  49.3  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0772  phage integrase  46.81 
 
 		 304 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  28.67 
 
 		 299 aa  48.9  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07060  site-specific recombinase XerD  32.26 
 
 		 315 aa  48.5  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.273434 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5304  site-specific recombinase, phage integrase family  25.93 
 
 		 322 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2844  integrase family protein  24.64 
 
 		 329 aa  48.5  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  30.91 
 
 		 305 aa  48.9  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.84 
 
 		 321 aa  48.1  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  27.59 
 
 		 300 aa  48.5  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>