98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4571 on replicon NC_009998
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009998  Sbal195_4571  integrase family protein  100 
 
 
221 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.624666  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4358  phage integrase family protein  84.62 
 
 
221 aa  403  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.436387  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5700  integrase family protein  34.13 
 
 
226 aa  122  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5382  phage integrase  32.57 
 
 
228 aa  118  9e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.31221  hitchhiker  0.00239771 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4451  phage integrase  35.23 
 
 
229 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6742  integrase family protein  35.96 
 
 
236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1839  phage integrase family protein  30.43 
 
 
193 aa  90.1  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.637517  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2063  phage integrase family protein  31.07 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.668188  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0081  integrase family protein  30.33 
 
 
189 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2812  integrase family protein  28.85 
 
 
188 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2946  phage integrase family protein  25.84 
 
 
190 aa  74.7  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.329988 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1075  integrase family protein  26.94 
 
 
190 aa  73.9  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0500  integrase family protein  28.57 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1689  phage integrase family protein  27.67 
 
 
190 aa  72.4  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0163  integrase family protein  27.49 
 
 
189 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2245  hypothetical protein  28.4 
 
 
314 aa  69.7  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.468605 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0076  integrase family protein  27.96 
 
 
189 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0140  hypothetical protein  26.92 
 
 
194 aa  63.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4322  phage integrase family protein  26.92 
 
 
193 aa  56.2  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.205034  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2565  hypothetical protein  27.16 
 
 
317 aa  55.5  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.420603 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3470  integrase family protein  41.18 
 
 
182 aa  52  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1565  phage integrase family protein  21.43 
 
 
317 aa  50.1  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210846  normal  0.0264198 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3476  integrase family protein  36.51 
 
 
174 aa  49.3  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  28.89 
 
 
391 aa  48.9  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3427  integron integrase  33.33 
 
 
327 aa  48.5  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1547  phage integrase family protein  28.57 
 
 
336 aa  48.1  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.268843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3619  phage integrase family protein  24.3 
 
 
309 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.215155  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1137  phage integrase  25.98 
 
 
296 aa  47  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5342  integrase/recombinase  24.39 
 
 
337 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3661  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.67 
 
 
311 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0900  integrase  31.25 
 
 
322 aa  46.2  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000819417  hitchhiker  0.000000626468 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1434  phage integrase family protein  31.25 
 
 
322 aa  46.2  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0977  integron integrase  24.41 
 
 
329 aa  46.2  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5002  hypothtical protein  30.61 
 
 
308 aa  45.8  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0748381  hitchhiker  0.0000000255834 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1457  integrase family protein  34.33 
 
 
326 aa  45.8  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0067  integrase/recombinase  24.88 
 
 
337 aa  45.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.325485 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0143  integrase IntI1 for transposon Tn21  24.88 
 
 
337 aa  45.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0120  integrase/recombinase  24.88 
 
 
337 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.400978 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2933  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.33 
 
 
313 aa  45.8  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.83049  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0012  Phage integrase  25.12 
 
 
320 aa  45.1  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  26.39 
 
 
305 aa  45.1  0.0008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.85 
 
 
324 aa  45.1  0.0009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0872  phage integrase family protein  28.12 
 
 
324 aa  45.1  0.0009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0666  Phage integrase, N-terminal SAM- like  36.11 
 
 
310 aa  44.3  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.555034  n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5582  integrase family protein  35.09 
 
 
313 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1844  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.33 
 
 
315 aa  44.3  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.104424  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2809  phage integrase family protein  33.85 
 
 
311 aa  44.7  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.25 
 
 
313 aa  44.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1177  integrase family protein  33.33 
 
 
329 aa  45.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.151473 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0410  integron integrase  24.14 
 
 
334 aa  44.3  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.761535  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0553  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.82 
 
 
329 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172687  normal  0.167276 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  33.33 
 
 
411 aa  45.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2501  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.82 
 
 
312 aa  44.3  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  0.936606 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2249  putative transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 
325 aa  43.5  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3124  integrase family protein  34.85 
 
 
323 aa  43.9  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3960  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.34 
 
 
311 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011638  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0196  integrase family protein  29.23 
 
 
328 aa  43.9  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000565414 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0177  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.82 
 
 
323 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4062  tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 
353 aa  43.5  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.159612  normal  0.47475 
 
 
-
 
NC_004310  BR1916  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.84 
 
 
315 aa  43.9  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.391518  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2194  integrase family protein  31.25 
 
 
317 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0271  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.82 
 
 
351 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28022  normal  0.462537 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1030  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.88 
 
 
307 aa  43.9  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1695  phage integrase family protein  26.6 
 
 
296 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.363626  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0401  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.5 
 
 
324 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.145415 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  27.05 
 
 
293 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  24.77 
 
 
302 aa  43.5  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1556  site-specific recombinase, phage integrase family  33.33 
 
 
331 aa  43.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0536  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.43 
 
 
300 aa  43.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.538013  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03738  putative integrase  28.81 
 
 
322 aa  43.5  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4591  integrase family protein  38.6 
 
 
316 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000000427706  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1145  putative transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 
408 aa  43.5  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.239655 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0942  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.84 
 
 
315 aa  43.5  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1113  integrase  27.27 
 
 
407 aa  43.1  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3006  integron integrase  26.59 
 
 
334 aa  43.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.976928  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1271  integrase family protein  33.33 
 
 
331 aa  43.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.828065  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1799  integron integrase  26.89 
 
 
462 aa  43.1  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.174616  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0779  integron integrase  29.9 
 
 
320 aa  42.7  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000312296  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.09 
 
 
321 aa  42.7  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  32.35 
 
 
308 aa  42.7  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2241  integrase family protein  26.6 
 
 
296 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000667129 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4114  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.34 
 
 
322 aa  42.4  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1178  integrase family protein  25.97 
 
 
329 aa  42.4  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.801835  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  33.93 
 
 
443 aa  42.4  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0563  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.54 
 
 
306 aa  42.4  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.792208  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2215  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.54 
 
 
306 aa  42.4  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5364  integrase  29.03 
 
 
332 aa  42  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2576  integron integrase  32.86 
 
 
453 aa  42  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00600674  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  35.09 
 
 
313 aa  41.6  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0341  phage integrase family site specific recombinase  33.33 
 
 
311 aa  41.6  0.009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1412  integrase family protein  29.58 
 
 
323 aa  41.6  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2803  integron integrase  32.86 
 
 
449 aa  41.6  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000270824  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6892  phage integrase family protein  31.09 
 
 
618 aa  41.6  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0426  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.94 
 
 
321 aa  41.6  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  25 
 
 
298 aa  41.6  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1220  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.43 
 
 
330 aa  41.6  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  33.33 
 
 
397 aa  41.6  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1915  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.84 
 
 
345 aa  41.6  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279776  hitchhiker  0.00138491 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>