More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2252 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  100 
 
 
305 aa  622  1e-177  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  56.42 
 
 
400 aa  315  7e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  49.33 
 
 
392 aa  268  1e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  46.38 
 
 
390 aa  262  4.999999999999999e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  46.96 
 
 
414 aa  255  6e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  46.62 
 
 
325 aa  236  3e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  39.73 
 
 
381 aa  222  7e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  41.89 
 
 
379 aa  219  3e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  42.18 
 
 
378 aa  214  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  42.47 
 
 
377 aa  211  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  40.69 
 
 
370 aa  207  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  39.15 
 
 
363 aa  207  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  41.72 
 
 
377 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  38.78 
 
 
477 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  38.05 
 
 
391 aa  205  6e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  40 
 
 
386 aa  203  3e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  39.19 
 
 
374 aa  192  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  39.19 
 
 
374 aa  192  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  39.86 
 
 
383 aa  192  5e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  36.91 
 
 
435 aa  191  1e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  34.6 
 
 
369 aa  191  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  39.01 
 
 
368 aa  187  2e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  34.26 
 
 
369 aa  186  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  38.08 
 
 
385 aa  186  4e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  34.72 
 
 
369 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  38.41 
 
 
370 aa  183  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  36.73 
 
 
426 aa  176  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  34.81 
 
 
387 aa  171  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  35.57 
 
 
392 aa  167  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  35.56 
 
 
383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  35.05 
 
 
378 aa  157  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  38.58 
 
 
471 aa  155  7e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  31.4 
 
 
373 aa  154  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  35.62 
 
 
371 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  38.58 
 
 
471 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  35.31 
 
 
379 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  35.31 
 
 
379 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  34.19 
 
 
443 aa  149  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  36.36 
 
 
391 aa  145  9e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  29.41 
 
 
416 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  34.66 
 
 
431 aa  140  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  31.09 
 
 
402 aa  139  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  31.99 
 
 
463 aa  139  7e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  35.08 
 
 
422 aa  138  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  27.67 
 
 
389 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  31 
 
 
386 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  32.05 
 
 
403 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  31.21 
 
 
381 aa  134  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  30.41 
 
 
381 aa  132  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  30.22 
 
 
413 aa  132  6e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0407  phage integrase  32.29 
 
 
503 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  31.54 
 
 
388 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  33.33 
 
 
409 aa  130  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  32.55 
 
 
393 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  32.55 
 
 
442 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0172  integrase family protein  28.62 
 
 
437 aa  128  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398776  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  33.2 
 
 
422 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6718  integrase family protein  30.82 
 
 
656 aa  124  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  29.94 
 
 
404 aa  124  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  32.17 
 
 
370 aa  122  7e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  28.61 
 
 
451 aa  122  8e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0644  integrase family protein  27.24 
 
 
406 aa  121  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15860  site-specific recombinase XerD  28.8 
 
 
398 aa  119  9e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0008266  hitchhiker  0.0000733221 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  26.01 
 
 
378 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  29.39 
 
 
391 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  29.49 
 
 
487 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  36.11 
 
 
209 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0993  phage integrase family protein  42.98 
 
 
121 aa  113  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6721  integrase family protein  29.46 
 
 
494 aa  113  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.917048  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3464  integrase family protein  30.27 
 
 
377 aa  112  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3350  integrase  29.39 
 
 
308 aa  112  9e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00359362  decreased coverage  0.00980373 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  31.62 
 
 
374 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4274  phage integrase  26.03 
 
 
407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  27.1 
 
 
506 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  27.27 
 
 
376 aa  106  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  28.21 
 
 
416 aa  105  8e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  27.68 
 
 
443 aa  104  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8572  DNA binding domain protein, excisionase family  26.05 
 
 
507 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167813  normal  0.0589685 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  27.27 
 
 
357 aa  101  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3743  integrase family protein  41.09 
 
 
445 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3794  integrase family protein  41.09 
 
 
445 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0397442 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  26.47 
 
 
384 aa  100  4e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3446  integrase family protein  29.38 
 
 
492 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  26.01 
 
 
376 aa  99.8  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2157  hypothetical protein  37.61 
 
 
120 aa  99  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00218836  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2095  phage integrase  37.61 
 
 
120 aa  99  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000441723  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2312  hypothetical protein  37.61 
 
 
120 aa  99  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.430324  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2337  hypothetical protein  37.61 
 
 
120 aa  99  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  26.2 
 
 
393 aa  97.4  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  29.01 
 
 
407 aa  97.1  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08320  site-specific recombinase XerD  33.5 
 
 
460 aa  95.9  8e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  25.74 
 
 
388 aa  95.5  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  27.21 
 
 
387 aa  94.7  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  28 
 
 
367 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  25.57 
 
 
454 aa  94.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  27.66 
 
 
423 aa  93.6  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  26.73 
 
 
404 aa  92.4  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0926  integrase family protein  29.6 
 
 
438 aa  92.4  9e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.98 
 
 
376 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3437  integrase family protein  29.73 
 
 
458 aa  91.7  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>