More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1568 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  100 
 
 
357 aa  703    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  35.08 
 
 
387 aa  209  5e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  33.24 
 
 
390 aa  191  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  36.21 
 
 
363 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  34.14 
 
 
371 aa  167  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  31.54 
 
 
400 aa  166  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.73 
 
 
374 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.73 
 
 
374 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  30.57 
 
 
391 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  32.8 
 
 
374 aa  162  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  34.47 
 
 
414 aa  156  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  32.81 
 
 
378 aa  155  9e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  28.07 
 
 
373 aa  151  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  31.7 
 
 
435 aa  150  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  28.12 
 
 
392 aa  150  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  30.18 
 
 
370 aa  150  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  33.24 
 
 
378 aa  149  7e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  29.64 
 
 
369 aa  149  7e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  28.8 
 
 
389 aa  149  8e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  29.65 
 
 
381 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  27.43 
 
 
369 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  31.41 
 
 
383 aa  146  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  27.81 
 
 
369 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  31.4 
 
 
477 aa  145  9e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  32.28 
 
 
377 aa  144  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  31.55 
 
 
325 aa  143  5e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  31.11 
 
 
379 aa  142  8e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  31.95 
 
 
416 aa  139  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  33.87 
 
 
377 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  30.72 
 
 
368 aa  137  4e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  28.96 
 
 
391 aa  136  5e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  26.98 
 
 
370 aa  136  7.000000000000001e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  32.1 
 
 
383 aa  135  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  32.15 
 
 
391 aa  134  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  28.8 
 
 
385 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  30.39 
 
 
386 aa  132  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  31.22 
 
 
463 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  26.27 
 
 
413 aa  126  5e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  31.62 
 
 
387 aa  126  5e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  29.77 
 
 
379 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  29.77 
 
 
379 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  27.61 
 
 
388 aa  124  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  28.77 
 
 
376 aa  123  5e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  27.53 
 
 
431 aa  123  5e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  27.19 
 
 
381 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  26.79 
 
 
378 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  27.54 
 
 
422 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  29.3 
 
 
385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  26.88 
 
 
381 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  27.86 
 
 
422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  25.91 
 
 
392 aa  116  6e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3499  integrase family protein  30.15 
 
 
368 aa  116  6e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000340769  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  25.68 
 
 
388 aa  115  7.999999999999999e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  31.67 
 
 
387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  24.3 
 
 
376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913824  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  29.85 
 
 
409 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  30.03 
 
 
365 aa  113  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  33.98 
 
 
394 aa  112  7.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  29.93 
 
 
404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  27.9 
 
 
402 aa  109  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  32.08 
 
 
442 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  32.08 
 
 
393 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  31.19 
 
 
426 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  25.24 
 
 
376 aa  106  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1451  integrase family protein  29.62 
 
 
371 aa  106  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2625  phage integrase family protein  22.6 
 
 
409 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0300817  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  23.51 
 
 
398 aa  103  4e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  22.8 
 
 
393 aa  102  9e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2218  phage integrase family protein  28.75 
 
 
388 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  29.66 
 
 
397 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  24.85 
 
 
376 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0644  integrase family protein  30.03 
 
 
406 aa  101  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  27.27 
 
 
305 aa  101  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  29.33 
 
 
403 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  25.07 
 
 
393 aa  100  4e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  28.22 
 
 
370 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0058  phage integrase family protein  31.16 
 
 
395 aa  100  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251229  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  25.5 
 
 
367 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0956  site-specific recombinase, phage integrase family  27.7 
 
 
323 aa  98.2  2e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  24.69 
 
 
362 aa  98.2  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  25.86 
 
 
402 aa  97.4  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  24.22 
 
 
451 aa  97.1  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.18 
 
 
376 aa  96.7  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.18 
 
 
376 aa  96.7  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4274  phage integrase  26.95 
 
 
407 aa  96.3  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  28.24 
 
 
454 aa  95.9  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  25.52 
 
 
401 aa  95.5  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4364  phage integrase family protein  29.87 
 
 
373 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1691  phage integrase family protein  30.45 
 
 
402 aa  95.5  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  28.26 
 
 
416 aa  95.5  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03080  site-specific recombinase XerC  27.35 
 
 
381 aa  95.1  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0299404  hitchhiker  1.02879e-24 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  28.89 
 
 
404 aa  94  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  23.39 
 
 
384 aa  94  4e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  26.8 
 
 
506 aa  93.6  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19160  site-specific recombinase XerD  24.16 
 
 
356 aa  93.6  5e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  0.148917 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  31.16 
 
 
370 aa  92.4  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  27.88 
 
 
380 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3899  phage integrase family protein  29.43 
 
 
379 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7037  hypothetical protein  26.18 
 
 
387 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0864  phage integrase family protein  22.91 
 
 
349 aa  91.3  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0352184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>