More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_03080 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_03080  site-specific recombinase XerC  100 
 
 
381 aa  786    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0299404  hitchhiker  1.02879e-24 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  27.18 
 
 
378 aa  116  7.999999999999999e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  25.6 
 
 
392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  26.54 
 
 
390 aa  110  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  25.97 
 
 
389 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  25.43 
 
 
373 aa  108  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  29.26 
 
 
363 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  29.79 
 
 
377 aa  106  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  28.53 
 
 
370 aa  106  8e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  24.16 
 
 
435 aa  105  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  26.72 
 
 
369 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  26.17 
 
 
369 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  26.5 
 
 
376 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2625  phage integrase family protein  26.97 
 
 
409 aa  101  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0300817  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  24.69 
 
 
388 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.14 
 
 
376 aa  99.4  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.14 
 
 
376 aa  99.4  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  27.82 
 
 
387 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  27.22 
 
 
385 aa  97.8  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  29.73 
 
 
376 aa  97.4  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913824  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  27.53 
 
 
387 aa  97.1  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.53 
 
 
374 aa  96.7  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.53 
 
 
374 aa  96.7  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  26.3 
 
 
393 aa  95.9  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  27.35 
 
 
357 aa  95.1  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  27.38 
 
 
370 aa  93.2  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  27.79 
 
 
378 aa  92.8  9e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  25.61 
 
 
369 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  27.56 
 
 
394 aa  90.1  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  24.12 
 
 
381 aa  89.7  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  23.45 
 
 
381 aa  89.4  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  25.41 
 
 
381 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  26.34 
 
 
383 aa  89  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  25 
 
 
413 aa  88.2  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  22.82 
 
 
370 aa  88.6  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  24.3 
 
 
451 aa  88.2  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0424  phage integrase  24.13 
 
 
374 aa  87.8  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.743387  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  25.35 
 
 
376 aa  87.4  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2927  phage integrase family protein  27.48 
 
 
391 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0058  phage integrase family protein  26.95 
 
 
395 aa  87.4  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251229  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  26.67 
 
 
463 aa  86.7  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  26.93 
 
 
416 aa  86.3  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19160  site-specific recombinase XerD  23.94 
 
 
356 aa  85.9  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  0.148917 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  28.37 
 
 
407 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12675  phiRv2 prophage integrase  27.01 
 
 
375 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000114455  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1451  integrase family protein  25.77 
 
 
371 aa  83.2  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  27.33 
 
 
368 aa  82.4  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0956  site-specific recombinase, phage integrase family  27.63 
 
 
323 aa  82.4  0.00000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  26.1 
 
 
414 aa  81.6  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  24.79 
 
 
391 aa  80.9  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0924  integrase family protein  22.99 
 
 
399 aa  80.9  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  23.48 
 
 
383 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  27.97 
 
 
397 aa  79.7  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  26.94 
 
 
385 aa  79.7  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  25.28 
 
 
379 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  25.28 
 
 
379 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  24.65 
 
 
477 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  27.25 
 
 
395 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  25.68 
 
 
409 aa  78.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3499  integrase family protein  27.27 
 
 
368 aa  76.6  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000340769  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  27.01 
 
 
377 aa  76.6  0.0000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  25.09 
 
 
325 aa  76.3  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  26.82 
 
 
379 aa  75.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  23.27 
 
 
443 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  24.33 
 
 
398 aa  75.5  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0768  integrase family protein  27.24 
 
 
397 aa  75.5  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6364  integrase family protein  24.51 
 
 
398 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4364  phage integrase family protein  30.48 
 
 
373 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  24.59 
 
 
376 aa  74.3  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1419  integrase family protein  25.25 
 
 
390 aa  74.7  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.447287  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  27.6 
 
 
365 aa  74.3  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  28.33 
 
 
471 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  28.75 
 
 
471 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  27.2 
 
 
370 aa  73.6  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  26.64 
 
 
402 aa  71.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  24.38 
 
 
391 aa  72  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  22.78 
 
 
367 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  24.65 
 
 
404 aa  71.2  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  21.98 
 
 
443 aa  71.2  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  26.97 
 
 
387 aa  70.9  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  24.92 
 
 
362 aa  70.9  0.00000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0039  integrase family protein  27.64 
 
 
451 aa  70.9  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  25.95 
 
 
368 aa  70.9  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  21.91 
 
 
506 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15950  site-specific recombinase XerD  25.23 
 
 
373 aa  70.5  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.182079  hitchhiker  0.000000384619 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  26.64 
 
 
401 aa  70.1  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0966  integrase family protein  24.59 
 
 
346 aa  69.7  0.00000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  22.41 
 
 
390 aa  69.7  0.00000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  25.21 
 
 
391 aa  69.3  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  28.57 
 
 
392 aa  68.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4448  phage integrase family protein  27.21 
 
 
424 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322677  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0121  integrase family protein  22.63 
 
 
422 aa  68.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534504  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1527  integrase family protein  25.21 
 
 
357 aa  68.6  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.115316 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3350  integrase  25 
 
 
308 aa  68.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00359362  decreased coverage  0.00980373 
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  23.32 
 
 
386 aa  68.2  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  23.3 
 
 
393 aa  67.8  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  23.2 
 
 
400 aa  67.4  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23910  site-specific recombinase XerD  26.92 
 
 
402 aa  66.6  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.075478  normal  0.15395 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  25.66 
 
 
403 aa  66.6  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  28.45 
 
 
378 aa  66.6  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>