203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4364 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4364  phage integrase family protein  100 
 
 		 373 aa  760    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3499  integrase family protein  45.05 
 
 		 368 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000340769  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2508  phage integrase family protein  42.55 
 
 		 385 aa  268  1e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  41.04 
 
 		 387 aa  255  9e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2218  phage integrase family protein  41.15 
 
 		 388 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12675  phiRv2 prophage integrase  40.91 
 
 		 375 aa  241  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000114455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3899  phage integrase family protein  42.7 
 
 		 379 aa  235  7e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  36.54 
 
 		 394 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0058  phage integrase family protein  32.45 
 
 		 395 aa  167  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  30.19 
 
 		 370 aa  138  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2351  integrase family protein  32.06 
 
 		 427 aa  132  6.999999999999999e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.226368  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  29.58 
 
 		 365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0039  integrase family protein  40.1 
 
 		 451 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  28.14 
 
 		 377 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0014  integrase family protein  29.84 
 
 		 367 aa  109  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  28.9 
 
 		 397 aa  106  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  26.94 
 
 		 407 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  28.92 
 
 		 390 aa  102  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  31 
 
 		 379 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  25.85 
 
 		 435 aa  98.6  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  29.87 
 
 		 357 aa  95.5  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4448  phage integrase family protein  27.09 
 
 		 424 aa  94  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1419  integrase family protein  29.36 
 
 		 390 aa  94  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.447287  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  28.08 
 
 		 383 aa  90.9  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0956  site-specific recombinase, phage integrase family  26.46 
 
 		 323 aa  90.1  5e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  25.93 
 
 		 392 aa  86.3  8e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23910  site-specific recombinase XerD  26.73 
 
 		 402 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.075478  normal  0.15395 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  25.66 
 
 		 368 aa  84.7  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  25.32 
 
 		 368 aa  84.3  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  25.88 
 
 		 378 aa  84  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  24.83 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913824  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  26.9 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  26.15 
 
 		 325 aa  81.6  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4828  phage integrase  25 
 
 		 433 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281268  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  23.44 
 
 		 389 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0424  phage integrase  24 
 
 		 374 aa  79  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.743387  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  25.29 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  28.91 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0121  integrase family protein  27.2 
 
 		 422 aa  76.6  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3648  phage integrase family protein  26.75 
 
 		 503 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.215294  normal  0.165741 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  25.27 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  27.71 
 
 		 385 aa  75.9  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5293  integrase family protein  26.7 
 
 		 399 aa  75.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  25.47 
 
 		 378 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  28.13 
 
 		 377 aa  75.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03080  site-specific recombinase XerC  30.48 
 
 		 381 aa  74.7  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0299404  hitchhiker  1.02879e-24 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  24.07 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  25.41 
 
 		 409 aa  74.3  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  25.23 
 
 		 396 aa  73.9  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  27.09 
 
 		 404 aa  73.9  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19160  site-specific recombinase XerD  24.93 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  0.148917 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2927  phage integrase family protein  26.25 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  28.24 
 
 		 363 aa  73.2  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  26.69 
 
 		 378 aa  72.4  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  23.81 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  24.92 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  25.98 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1985  phage integrase family protein  26.86 
 
 		 469 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1691  phage integrase family protein  27.62 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  22.68 
 
 		 373 aa  69.3  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2625  phage integrase family protein  25.3 
 
 		 409 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0300817  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  27.62 
 
 		 454 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3323  integrase family protein  29.29 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0924  integrase family protein  23.83 
 
 		 399 aa  67  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  24.84 
 
 		 383 aa  66.2  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  22.97 
 
 		 388 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1527  integrase family protein  24.3 
 
 		 357 aa  65.9  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.115316 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  22.93 
 
 		 369 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  27.04 
 
 		 374 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  27.04 
 
 		 374 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  22.71 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  26.87 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  21.79 
 
 		 369 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8918  integrase family protein  26.61 
 
 		 492 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0126697  normal  0.144879 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  26.06 
 
 		 396 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  22.07 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1795  Integrase  24.47 
 
 		 407 aa  63.5  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  23.08 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  25.29 
 
 		 403 aa  63.5  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  23.62 
 
 		 392 aa  62.8  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5393  integrase family protein  24.68 
 
 		 304 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1451  integrase family protein  26.73 
 
 		 371 aa  62.4  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  30.37 
 
 		 385 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  26.91 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  27.68 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  27.12 
 
 		 477 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  25.77 
 
 		 443 aa  60.8  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1922  integrase family protein  25 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.612381  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5370  integrase family protein  25 
 
 		 498 aa  60.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.987782 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6364  integrase family protein  25 
 
 		 398 aa  60.1  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  27.27 
 
 		 294 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2073  integrase family protein  25.73 
 
 		 451 aa  58.9  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.087873  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  25.83 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  27.53 
 
 		 416 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  25.23 
 
 		 370 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  26.65 
 
 		 386 aa  57.8  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  22.48 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3701  integrase family protein  28.72 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3873  integrase family protein  29.05 
 
 		 439 aa  57.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00124247  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2767  integrase family protein  23.99 
 
 		 453 aa  57.8  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000543052  hitchhiker  0.000268456 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>