More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1407 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  100 
 
 		 374 aa  751    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  33.51 
 
 		 392 aa  212  7.999999999999999e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  35.32 
 
 		 400 aa  209  8e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  36.84 
 
 		 390 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  35.93 
 
 		 387 aa  205  9e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  33.25 
 
 		 414 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  37.37 
 
 		 377 aa  192  7e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  31.2 
 
 		 391 aa  181  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  34.74 
 
 		 477 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  35.08 
 
 		 379 aa  170  4e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  35.25 
 
 		 377 aa  169  6e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  31.55 
 
 		 363 aa  166  9e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  33.42 
 
 		 378 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  32.8 
 
 		 357 aa  162  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  27.05 
 
 		 369 aa  159  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  26.78 
 
 		 369 aa  153  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  30.57 
 
 		 370 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  27.05 
 
 		 369 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.65 
 
 		 374 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.65 
 
 		 374 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  28.8 
 
 		 383 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  33.44 
 
 		 325 aa  145  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  27.87 
 
 		 370 aa  144  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  33.24 
 
 		 378 aa  143  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  29.28 
 
 		 416 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  32.21 
 
 		 379 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  33.09 
 
 		 426 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  32.21 
 
 		 379 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  28.46 
 
 		 435 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  28.27 
 
 		 373 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  32.37 
 
 		 416 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  30.71 
 
 		 431 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  30.87 
 
 		 463 aa  132  7.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  32.78 
 
 		 391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  30.58 
 
 		 368 aa  129  7.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  29.19 
 
 		 367 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  30.45 
 
 		 422 aa  127  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  28.75 
 
 		 381 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  30.62 
 
 		 383 aa  124  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  30.81 
 
 		 403 aa  124  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  30.31 
 
 		 385 aa  124  4e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  29.3 
 
 		 422 aa  122  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  28.17 
 
 		 386 aa  119  7.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  29.58 
 
 		 371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  26.29 
 
 		 389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  30.18 
 
 		 404 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  28.18 
 
 		 393 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  28.3 
 
 		 409 aa  113  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4274  phage integrase  28.43 
 
 		 407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  31.62 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  27.59 
 
 		 387 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  26.67 
 
 		 381 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  27.27 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  32.51 
 
 		 442 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  26.49 
 
 		 398 aa  107  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  32.51 
 
 		 393 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.7 
 
 		 376 aa  106  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.7 
 
 		 376 aa  106  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  28.87 
 
 		 402 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  25.41 
 
 		 376 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  26.05 
 
 		 384 aa  103  5e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  25.07 
 
 		 413 aa  103  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  26.35 
 
 		 381 aa  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  25.26 
 
 		 443 aa  99.4  9e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  25.7 
 
 		 378 aa  97.8  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  24.16 
 
 		 393 aa  97.8  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6718  integrase family protein  28.49 
 
 		 656 aa  97.4  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0644  integrase family protein  25.9 
 
 		 406 aa  97.1  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  23.36 
 
 		 388 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  27.51 
 
 		 376 aa  95.9  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  30.67 
 
 		 487 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0407  phage integrase  27.27 
 
 		 503 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0172  integrase family protein  27.19 
 
 		 437 aa  92.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398776  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  25.14 
 
 		 376 aa  92.4  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  26.48 
 
 		 392 aa  91.7  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  24.32 
 
 		 451 aa  90.5  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6721  integrase family protein  26.53 
 
 		 494 aa  89.7  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.917048  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  30.05 
 
 		 209 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  27.44 
 
 		 385 aa  87  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  29.81 
 
 		 370 aa  84.7  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  28.51 
 
 		 402 aa  83.2  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2505  integrase family protein  32.79 
 
 		 201 aa  82  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.355532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8572  DNA binding domain protein, excisionase family  25.61 
 
 		 507 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167813  normal  0.0589685 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3269  phage integrase family protein  28.28 
 
 		 465 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  26.6 
 
 		 392 aa  79.7  0.00000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_013595  Sros_7037  hypothetical protein  23.61 
 
 		 387 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  22.33 
 
 		 362 aa  79  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  26.41 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  25.34 
 
 		 370 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1247  phage integrase family site specific recombinase  23.89 
 
 		 399 aa  77.4  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.357571  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  31.49 
 
 		 471 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  25.4 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  31.49 
 
 		 471 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1386  integrase family protein  21.39 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.114707  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0848  phage integrase family protein  24.42 
 
 		 349 aa  75.9  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0864  phage integrase family protein  24.42 
 
 		 349 aa  75.9  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0352184  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2060  phage integrase family protein  23.08 
 
 		 345 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00257719  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2097  phage integrase family protein  23.08 
 
 		 345 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0806496  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  30.33 
 
 		 454 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2625  phage integrase family protein  23.7 
 
 		 409 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0300817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>