More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_1187 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  100 
 
 
370 aa  750    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  43.8 
 
 
369 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  42.98 
 
 
369 aa  306  3e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  43.53 
 
 
369 aa  295  7e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  44.39 
 
 
374 aa  290  4e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  44.39 
 
 
374 aa  290  4e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  40.05 
 
 
370 aa  267  2e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  36.98 
 
 
381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  38.61 
 
 
383 aa  246  4e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0993  phage integrase family protein  95.04 
 
 
121 aa  240  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  36.06 
 
 
463 aa  239  4e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  36.75 
 
 
383 aa  230  3e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  36.86 
 
 
390 aa  230  3e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  38.05 
 
 
379 aa  228  9e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  35.48 
 
 
391 aa  224  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  32.88 
 
 
477 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  34.83 
 
 
378 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  34.49 
 
 
378 aa  215  9e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  33.75 
 
 
363 aa  211  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  37.61 
 
 
414 aa  209  7e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  33.59 
 
 
385 aa  209  7e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  34.46 
 
 
435 aa  208  1e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  35.34 
 
 
400 aa  206  5e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  32.98 
 
 
386 aa  204  1e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  34.96 
 
 
368 aa  205  1e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  34.38 
 
 
387 aa  205  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  34.13 
 
 
373 aa  202  9e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  31.25 
 
 
389 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  32.87 
 
 
392 aa  195  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  34.13 
 
 
391 aa  195  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  33.33 
 
 
388 aa  193  5e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  36.9 
 
 
377 aa  193  5e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  33.8 
 
 
376 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  33.8 
 
 
376 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  38.41 
 
 
305 aa  183  4.0000000000000006e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  30.29 
 
 
377 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  37.26 
 
 
325 aa  182  7e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  29.76 
 
 
391 aa  179  7e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  31.69 
 
 
376 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  30.9 
 
 
426 aa  178  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  29.87 
 
 
413 aa  178  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  32.42 
 
 
376 aa  176  8e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  28.9 
 
 
442 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  32.4 
 
 
381 aa  169  5e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  31.95 
 
 
392 aa  167  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  32.12 
 
 
381 aa  167  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  31.16 
 
 
379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  31.16 
 
 
379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  28.94 
 
 
409 aa  162  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  28.33 
 
 
404 aa  158  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  28.84 
 
 
403 aa  158  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  32.57 
 
 
367 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  29.1 
 
 
384 aa  157  3e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  30.75 
 
 
416 aa  157  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  33.46 
 
 
393 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  28.61 
 
 
370 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  30.47 
 
 
378 aa  152  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  30.57 
 
 
374 aa  152  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  28.95 
 
 
371 aa  151  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  30.18 
 
 
357 aa  150  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  32.6 
 
 
362 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  29.92 
 
 
376 aa  144  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  28.64 
 
 
386 aa  143  4e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  27.68 
 
 
398 aa  142  9e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  26.81 
 
 
416 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  26.6 
 
 
443 aa  138  1e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  27.16 
 
 
451 aa  137  3.0000000000000003e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  26.34 
 
 
487 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  29.08 
 
 
402 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  28.65 
 
 
385 aa  134  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  26.93 
 
 
393 aa  133  5e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  28.74 
 
 
431 aa  132  6.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  31.01 
 
 
388 aa  132  6.999999999999999e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  29.97 
 
 
443 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  28.61 
 
 
422 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  28.76 
 
 
393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  33.63 
 
 
471 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  33.63 
 
 
471 aa  127  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0172  integrase family protein  28.48 
 
 
437 aa  122  8e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398776  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  28.62 
 
 
387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  27.98 
 
 
422 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  28.18 
 
 
365 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4274  phage integrase  27.39 
 
 
407 aa  119  7.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0424  phage integrase  25.53 
 
 
374 aa  118  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.743387  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1607  phage integrase family protein  27.08 
 
 
402 aa  119  9.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  24.85 
 
 
376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913824  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6718  integrase family protein  27.67 
 
 
656 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15860  site-specific recombinase XerD  26.65 
 
 
398 aa  116  5e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0008266  hitchhiker  0.0000733221 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  35 
 
 
209 aa  116  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6364  integrase family protein  27.4 
 
 
398 aa  115  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2505  integrase family protein  37.82 
 
 
201 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.355532 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  25.96 
 
 
380 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  25.38 
 
 
397 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2157  hypothetical protein  51.89 
 
 
120 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00218836  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2095  phage integrase  51.89 
 
 
120 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000441723  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2312  hypothetical protein  51.89 
 
 
120 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.430324  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2337  hypothetical protein  51.89 
 
 
120 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  27.36 
 
 
506 aa  113  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0644  integrase family protein  24.38 
 
 
406 aa  113  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  28.71 
 
 
368 aa  113  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>