More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0959 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  100 
 
 
392 aa  807    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  43.88 
 
 
393 aa  334  2e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  43.31 
 
 
390 aa  307  3e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  27.11 
 
 
338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  31.92 
 
 
276 aa  133  6e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0966  integrase family protein  29.46 
 
 
346 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1995  integrase family protein  30.45 
 
 
359 aa  125  1e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  27.85 
 
 
378 aa  122  7e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  26.26 
 
 
390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  35.79 
 
 
403 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  26.13 
 
 
378 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  27.31 
 
 
401 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  28.66 
 
 
369 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  28.35 
 
 
369 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  27.1 
 
 
402 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  26.2 
 
 
414 aa  103  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  26.73 
 
 
391 aa  101  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2465  putative pore-forming cytotoxin integrase  25.49 
 
 
381 aa  102  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.135007 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  25.19 
 
 
397 aa  100  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  23.76 
 
 
363 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  24.01 
 
 
383 aa  100  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  26.1 
 
 
368 aa  100  6e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  26.75 
 
 
407 aa  100  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  23.76 
 
 
412 aa  99.8  7e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  25.08 
 
 
369 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  27.54 
 
 
413 aa  99.4  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  23.75 
 
 
391 aa  99  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  26.43 
 
 
385 aa  99.4  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  27.1 
 
 
388 aa  99  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  27.5 
 
 
435 aa  97.4  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  26.81 
 
 
389 aa  97.1  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  26.07 
 
 
370 aa  96.7  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  27.27 
 
 
401 aa  95.9  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06819  integrase  26.9 
 
 
341 aa  95.5  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  25.07 
 
 
381 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  24.25 
 
 
471 aa  95.1  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  26.82 
 
 
454 aa  95.1  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  26.43 
 
 
379 aa  95.1  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  26.32 
 
 
370 aa  94.4  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  29.57 
 
 
293 aa  94.4  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  22.44 
 
 
414 aa  94.4  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  26.04 
 
 
409 aa  93.6  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  24.22 
 
 
407 aa  93.6  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  27.25 
 
 
376 aa  92.8  8e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  24.86 
 
 
387 aa  92.8  8e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0135  bacteriophage-related integrase  30.21 
 
 
385 aa  92.8  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.566608  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  24.09 
 
 
377 aa  92  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03202  phage integrase  27.31 
 
 
292 aa  91.7  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000402051  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  25.38 
 
 
386 aa  91.3  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2077  putative phage integrase  29.09 
 
 
302 aa  91.3  3e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2315  integrase family protein  26.83 
 
 
255 aa  91.3  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  27.17 
 
 
411 aa  90.5  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1958  integrase family protein  26.69 
 
 
431 aa  90.9  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00797743  normal  0.0944215 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01322  integrase  26.04 
 
 
411 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  25.28 
 
 
435 aa  90.1  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  26.33 
 
 
391 aa  90.1  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01332  hypothetical protein  26.04 
 
 
411 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2298  integrase family protein  26.04 
 
 
411 aa  90.1  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000253071  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  27.56 
 
 
275 aa  90.1  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  24.8 
 
 
383 aa  89.7  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0706  site-specific recombinase, phage integrase family protein  29.3 
 
 
297 aa  89.7  8e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0638  lipoprotein  29.3 
 
 
297 aa  89.7  8e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2082  site-specific recombinase, phage integrase family protein  29.57 
 
 
260 aa  89.7  8e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  27.17 
 
 
392 aa  89.7  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  25.88 
 
 
384 aa  89  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  26.79 
 
 
392 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.93 
 
 
374 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.93 
 
 
374 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  26.1 
 
 
367 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  27.39 
 
 
393 aa  88.6  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1690  integrase  30.4 
 
 
348 aa  88.6  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  24.71 
 
 
403 aa  88.2  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  24.44 
 
 
386 aa  87.8  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  26.74 
 
 
381 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  32.52 
 
 
423 aa  87.4  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  23.32 
 
 
391 aa  85.5  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  28.42 
 
 
396 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  25.87 
 
 
402 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1951  phage integrase family protein  24.26 
 
 
430 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000646207  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2000  integrase family protein  24.26 
 
 
430 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000276307  normal  0.758982 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  26.22 
 
 
381 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  25.74 
 
 
385 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1356  phage integrase  26.9 
 
 
388 aa  84.3  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000418117  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  30.37 
 
 
376 aa  84  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  30.37 
 
 
376 aa  84  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0800  Phage integrase  30.66 
 
 
369 aa  83.6  0.000000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  24.4 
 
 
477 aa  83.6  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  27.06 
 
 
397 aa  83.6  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  23.67 
 
 
305 aa  83.2  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  24.26 
 
 
365 aa  83.2  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  23.81 
 
 
392 aa  82.8  0.000000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0939  integrase family protein  24.62 
 
 
357 aa  82.8  0.000000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0828563 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  22.67 
 
 
357 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  26.3 
 
 
325 aa  82.4  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  29.02 
 
 
376 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  24.92 
 
 
400 aa  81.6  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  28.57 
 
 
376 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  25.67 
 
 
433 aa  80.9  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1181  integrase family protein  24.11 
 
 
417 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.588038 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  25 
 
 
377 aa  80.5  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>