More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1299 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  100 
 
 
276 aa  574  1.0000000000000001e-163  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  31.92 
 
 
392 aa  133  3e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  31.37 
 
 
393 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  29.6 
 
 
401 aa  111  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  31.97 
 
 
401 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  29.6 
 
 
402 aa  110  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0966  integrase family protein  32.29 
 
 
346 aa  106  4e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  30.04 
 
 
414 aa  106  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  28.3 
 
 
390 aa  105  8e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  33.61 
 
 
397 aa  104  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  32.48 
 
 
411 aa  101  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  33.04 
 
 
414 aa  101  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  31.28 
 
 
391 aa  99  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1995  integrase family protein  31.13 
 
 
359 aa  98.6  9e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  29.57 
 
 
471 aa  98.6  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  30.25 
 
 
412 aa  97.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  29.06 
 
 
435 aa  97.1  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  31.6 
 
 
403 aa  96.7  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  28.17 
 
 
325 aa  96.3  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  30.77 
 
 
433 aa  95.9  7e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2393  phage integrase family site specific recombinase  33 
 
 
412 aa  94.7  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.682709  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0706  site-specific recombinase, phage integrase family protein  30.81 
 
 
297 aa  92.8  6e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0638  lipoprotein  30.81 
 
 
297 aa  92.8  6e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  34.59 
 
 
392 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  31.36 
 
 
386 aa  91.3  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  34.05 
 
 
392 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01948  integrase  32.54 
 
 
411 aa  90.5  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  29.87 
 
 
407 aa  90.1  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  29.91 
 
 
428 aa  89.7  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  30.32 
 
 
407 aa  89.4  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  25.75 
 
 
383 aa  88.2  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  25.49 
 
 
376 aa  87.8  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  29.57 
 
 
390 aa  87.4  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  27.13 
 
 
363 aa  86.7  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  31.52 
 
 
392 aa  87  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2077  putative phage integrase  30.33 
 
 
302 aa  87  3e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2082  site-specific recombinase, phage integrase family protein  30.33 
 
 
260 aa  87  3e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0135  bacteriophage-related integrase  31.11 
 
 
385 aa  86.7  4e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.566608  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  29.09 
 
 
383 aa  86.3  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  28.57 
 
 
338 aa  86.3  5e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  25.29 
 
 
376 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01322  integrase  28.64 
 
 
411 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2298  integrase family protein  28.64 
 
 
411 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000253071  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01332  hypothetical protein  28.64 
 
 
411 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2465  putative pore-forming cytotoxin integrase  30.69 
 
 
381 aa  85.5  9e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.135007 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2621  integrase family protein  26.32 
 
 
382 aa  85.5  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000432273  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.29 
 
 
376 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.29 
 
 
376 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2315  integrase family protein  29.35 
 
 
255 aa  84  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0479  phage integrase  26.07 
 
 
357 aa  82.4  0.000000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00687154  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  31.53 
 
 
422 aa  82.4  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  28.69 
 
 
396 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  29.36 
 
 
293 aa  82  0.000000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  31.16 
 
 
422 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  31 
 
 
402 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  30.65 
 
 
397 aa  80.9  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0800  Phage integrase  29.9 
 
 
369 aa  80.9  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5560  integrase family protein  32.5 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  28.36 
 
 
377 aa  80.5  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  29.89 
 
 
400 aa  80.9  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  27.31 
 
 
387 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3350  integrase  28.2 
 
 
308 aa  79.7  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00359362  decreased coverage  0.00980373 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  28.26 
 
 
375 aa  79.7  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  25.9 
 
 
370 aa  79.3  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0746  phage integrase family protein  26.07 
 
 
384 aa  79.3  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  23.69 
 
 
413 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  28.51 
 
 
356 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  28 
 
 
435 aa  76.6  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  30.73 
 
 
365 aa  75.9  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  29.06 
 
 
431 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  24.5 
 
 
368 aa  74.7  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.68 
 
 
374 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.68 
 
 
374 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  29.56 
 
 
379 aa  73.9  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  29.02 
 
 
378 aa  74.7  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  30.41 
 
 
443 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  25.76 
 
 
385 aa  73.6  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  27.78 
 
 
416 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  27.59 
 
 
391 aa  73.9  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  27.19 
 
 
370 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  27.54 
 
 
386 aa  72.8  0.000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  26.47 
 
 
370 aa  73.2  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  29.07 
 
 
369 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  30.28 
 
 
381 aa  72.8  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  27.05 
 
 
446 aa  72.4  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  27.05 
 
 
430 aa  72  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  27.05 
 
 
446 aa  72  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.781225 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  24.88 
 
 
398 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  24.88 
 
 
426 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3499  integrase family protein  27.73 
 
 
368 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000340769  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  27.11 
 
 
428 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  0.0000530695 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  26.62 
 
 
377 aa  70.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  24.88 
 
 
431 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  25.19 
 
 
378 aa  70.5  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  25.44 
 
 
371 aa  70.5  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  25.6 
 
 
404 aa  70.5  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  28.37 
 
 
416 aa  68.9  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  26.87 
 
 
454 aa  68.9  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  26.87 
 
 
381 aa  68.9  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  26.64 
 
 
378 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>