More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1143 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  100 
 
 
412 aa  859    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  55.33 
 
 
435 aa  438  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  54.13 
 
 
411 aa  436  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  52.2 
 
 
401 aa  414  1e-114  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  52.03 
 
 
391 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  52.28 
 
 
433 aa  403  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  51.6 
 
 
397 aa  398  1e-109  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  52.85 
 
 
471 aa  397  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  51.91 
 
 
414 aa  394  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  49.62 
 
 
386 aa  387  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  49.23 
 
 
392 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  48.88 
 
 
407 aa  370  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  49.23 
 
 
392 aa  370  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  49.04 
 
 
407 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0746  phage integrase family protein  38.3 
 
 
384 aa  225  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  28.61 
 
 
402 aa  152  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  28.64 
 
 
401 aa  150  4e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03390  hypothetical protein  47.56 
 
 
169 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000152663  unclonable  2.59325e-22 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  27.36 
 
 
430 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  27.36 
 
 
446 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  27.12 
 
 
446 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  30.94 
 
 
403 aa  140  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  28.07 
 
 
428 aa  137  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  0.0000530695 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  26.98 
 
 
426 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  26.74 
 
 
431 aa  134  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01948  integrase  27.72 
 
 
411 aa  127  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1783  Phage integrase  29.31 
 
 
452 aa  120  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.552394 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2393  phage integrase family site specific recombinase  26.95 
 
 
412 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.682709  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  24.69 
 
 
428 aa  119  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  27.06 
 
 
398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2325  phage integrase family protein  26.92 
 
 
403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.633234  hitchhiker  0.0000214757 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  32.03 
 
 
338 aa  117  3e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3069  integrase family protein  26.27 
 
 
436 aa  116  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01322  integrase  27.64 
 
 
411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2298  integrase family protein  27.64 
 
 
411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000253071  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01332  hypothetical protein  27.64 
 
 
411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2465  putative pore-forming cytotoxin integrase  28.43 
 
 
381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.135007 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  29.68 
 
 
375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2000  integrase family protein  26.39 
 
 
430 aa  111  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000276307  normal  0.758982 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1951  phage integrase family protein  26.39 
 
 
430 aa  111  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000646207  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2377  phage integrase family protein  26.13 
 
 
397 aa  109  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.101211  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  26.7 
 
 
396 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  29.13 
 
 
379 aa  102  9e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  27.15 
 
 
356 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  23.76 
 
 
392 aa  99.8  7e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  27.8 
 
 
293 aa  99  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06819  integrase  27.7 
 
 
341 aa  98.6  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  29.41 
 
 
378 aa  98.2  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1356  phage integrase  26.6 
 
 
388 aa  97.8  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000418117  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2315  integrase family protein  26.34 
 
 
255 aa  97.4  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  30.25 
 
 
276 aa  97.1  6e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1996  bacteriophage integrase family protein  36.9 
 
 
190 aa  94.7  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0601499  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1995  integrase family protein  33.16 
 
 
359 aa  95.1  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2319  integrase family protein  24.22 
 
 
493 aa  94  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  30.39 
 
 
371 aa  93.2  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  27.76 
 
 
390 aa  92.8  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5560  integrase family protein  31.23 
 
 
273 aa  92.8  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  23.03 
 
 
393 aa  90.9  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  25.16 
 
 
368 aa  91.3  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  28.52 
 
 
370 aa  90.5  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  27.84 
 
 
365 aa  89.7  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1958  integrase family protein  24.27 
 
 
431 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00797743  normal  0.0944215 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0135  bacteriophage-related integrase  25.6 
 
 
385 aa  87.8  3e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.566608  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  29.53 
 
 
369 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  29.65 
 
 
369 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0706  site-specific recombinase, phage integrase family protein  25.42 
 
 
297 aa  86.3  9e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0638  lipoprotein  25.42 
 
 
297 aa  86.3  9e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03202  phage integrase  29.34 
 
 
292 aa  86.3  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000402051  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  29.15 
 
 
369 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  27.52 
 
 
414 aa  84.7  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  24.53 
 
 
376 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  23.96 
 
 
370 aa  84  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2077  putative phage integrase  25.42 
 
 
302 aa  83.2  0.000000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  25.62 
 
 
422 aa  83.2  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3063  integrase family protein  28.45 
 
 
257 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000494154  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  24.44 
 
 
402 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  25.47 
 
 
370 aa  82  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  27.53 
 
 
378 aa  82  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1181  integrase family protein  22.51 
 
 
417 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.588038 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4084  integrase family protein  30.13 
 
 
356 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  24.13 
 
 
384 aa  80.9  0.00000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  23.99 
 
 
422 aa  80.5  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  24.13 
 
 
376 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  26.23 
 
 
377 aa  79.7  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  22.41 
 
 
363 aa  79.7  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  26.34 
 
 
392 aa  79.7  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  24.7 
 
 
400 aa  78.6  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3161  integrase family protein  24.61 
 
 
403 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2093  integrase family protein  30.26 
 
 
385 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.379176  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  22.49 
 
 
381 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.81 
 
 
376 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.81 
 
 
376 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  24.85 
 
 
387 aa  78.2  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1927  phage integrase family protein  21.71 
 
 
424 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  28.39 
 
 
380 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24051  hypothetical protein  30 
 
 
368 aa  76.6  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2082  site-specific recombinase, phage integrase family protein  26.59 
 
 
260 aa  76.6  0.0000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2497  integrase family protein  25.06 
 
 
384 aa  76.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.355652 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  23.28 
 
 
325 aa  75.1  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  27.97 
 
 
379 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>