More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0288 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  100 
 
 		 403 aa  844    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  35.1 
 
 		 401 aa  169  7e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  34.68 
 
 		 386 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  34.55 
 
 		 391 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  32.71 
 
 		 411 aa  163  6e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  32.01 
 
 		 401 aa  160  4e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  34.64 
 
 		 392 aa  158  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  32.19 
 
 		 397 aa  158  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  31.68 
 
 		 402 aa  158  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  33.99 
 
 		 392 aa  156  6e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  34.65 
 
 		 433 aa  154  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  31.55 
 
 		 435 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  31.41 
 
 		 407 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  32.03 
 
 		 471 aa  153  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  29.29 
 
 		 407 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  33.33 
 
 		 414 aa  147  3e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0746  phage integrase family protein  31.21 
 
 		 384 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  30.94 
 
 		 412 aa  140  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  30.27 
 
 		 338 aa  119  9e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0800  Phage integrase  34.84 
 
 		 369 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  35.79 
 
 		 392 aa  113  7.000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
CP001509  ECD_01322  integrase  25.95 
 
 		 411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2298  integrase family protein  25.95 
 
 		 411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000253071  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  24.78 
 
 		 430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  24.78 
 
 		 446 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  24.78 
 
 		 446 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01332  hypothetical protein  25.95 
 
 		 411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1995  integrase family protein  27.54 
 
 		 359 aa  110  3e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  26.6 
 
 		 375 aa  110  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  26.62 
 
 		 393 aa  110  6e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01948  integrase  28.33 
 
 		 411 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1356  phage integrase  29.94 
 
 		 388 aa  106  9e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000418117  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2325  phage integrase family protein  27.11 
 
 		 403 aa  103  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.633234  hitchhiker  0.0000214757 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  25.29 
 
 		 431 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  25.29 
 
 		 398 aa  100  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  25 
 
 		 426 aa  99  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  27.12 
 
 		 390 aa  98.2  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2393  phage integrase family site specific recombinase  26.01 
 
 		 412 aa  97.4  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.682709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  31.6 
 
 		 276 aa  96.7  7e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2315  integrase family protein  25.73 
 
 		 255 aa  95.9  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1958  integrase family protein  25.67 
 
 		 431 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00797743  normal  0.0944215 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  26.22 
 
 		 428 aa  94.7  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1783  Phage integrase  27.91 
 
 		 452 aa  93.2  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.552394 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06819  integrase  26.59 
 
 		 341 aa  92.8  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0479  phage integrase  27.94 
 
 		 357 aa  92.4  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00687154  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  28.01 
 
 		 390 aa  91.3  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  26.11 
 
 		 414 aa  89  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  28.18 
 
 		 377 aa  87.8  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  25.31 
 
 		 428 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  0.0000530695 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  27.65 
 
 		 396 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  29.66 
 
 		 422 aa  86.3  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  25.62 
 
 		 371 aa  85.5  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  27.46 
 
 		 378 aa  85.1  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  26.12 
 
 		 363 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  27.13 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1996  bacteriophage integrase family protein  33.33 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0601499  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  28.81 
 
 		 402 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  28.81 
 
 		 422 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3063  integrase family protein  29.59 
 
 		 257 aa  82  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000494154  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  23.82 
 
 		 380 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  26.09 
 
 		 377 aa  81.3  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  24.57 
 
 		 454 aa  80.1  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2465  putative pore-forming cytotoxin integrase  22.58 
 
 		 381 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.135007 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  26.37 
 
 		 365 aa  79.7  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03202  phage integrase  27.62 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000402051  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2377  phage integrase family protein  26.12 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.101211  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3069  integrase family protein  25.08 
 
 		 436 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  27.71 
 
 		 373 aa  77.8  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  25.91 
 
 		 379 aa  77.4  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  26.86 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5560  integrase family protein  30.9 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  26.21 
 
 		 369 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  24.54 
 
 		 407 aa  76.3  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  25.93 
 
 		 383 aa  76.3  0.0000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1951  phage integrase family protein  24.35 
 
 		 430 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000646207  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2000  integrase family protein  24.35 
 
 		 430 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000276307  normal  0.758982 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  25.93 
 
 		 369 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0135  bacteriophage-related integrase  31.36 
 
 		 385 aa  75.5  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.566608  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  22.81 
 
 		 370 aa  75.5  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  26.44 
 
 		 400 aa  74.3  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  26.85 
 
 		 431 aa  74.3  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  25.32 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  27.84 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  24.92 
 
 		 477 aa  73.6  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  28.7 
 
 		 356 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  30.63 
 
 		 396 aa  73.2  0.000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  26.88 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  24.93 
 
 		 389 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0638  lipoprotein  27.15 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0706  site-specific recombinase, phage integrase family protein  27.15 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  25.9 
 
 		 325 aa  71.2  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4084  integrase family protein  28.11 
 
 		 356 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  25.73 
 
 		 435 aa  70.1  0.00000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  25.81 
 
 		 388 aa  70.1  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  28.08 
 
 		 392 aa  69.7  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  25.14 
 
 		 357 aa  69.7  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1691  phage integrase family protein  23.58 
 
 		 402 aa  69.3  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4324  integrase family protein  25.28 
 
 		 396 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  26.05 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  25.71 
 
 		 416 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>