More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0746 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0746  phage integrase family protein  100 
 
 		 384 aa  788    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  39.95 
 
 		 391 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  38.48 
 
 		 401 aa  268  1e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  38.54 
 
 		 397 aa  266  5e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  38.24 
 
 		 471 aa  242  7e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  37.33 
 
 		 414 aa  242  9e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  36.68 
 
 		 411 aa  239  5e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  38.4 
 
 		 412 aa  239  5e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  36.01 
 
 		 386 aa  236  4e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  38 
 
 		 435 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  35.99 
 
 		 407 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  33.94 
 
 		 407 aa  231  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  34.82 
 
 		 433 aa  225  1e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  34.55 
 
 		 392 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 392 aa  204  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  31.21 
 
 		 403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2393  phage integrase family site specific recombinase  28.43 
 
 		 412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.682709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  28.32 
 
 		 428 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  0.0000530695 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3069  integrase family protein  27.53 
 
 		 436 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2077  putative phage integrase  26.19 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0706  site-specific recombinase, phage integrase family protein  25.17 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0638  lipoprotein  25.17 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1783  Phage integrase  26.37 
 
 		 452 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.552394 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  31.29 
 
 		 390 aa  102  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  28.14 
 
 		 368 aa  101  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03390  hypothetical protein  36.77 
 
 		 169 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000152663  unclonable  2.59325e-22 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2082  site-specific recombinase, phage integrase family protein  26.09 
 
 		 260 aa  97.4  4e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  30.51 
 
 		 414 aa  95.9  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2377  phage integrase family protein  23.76 
 
 		 397 aa  94.7  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.101211  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  32.18 
 
 		 365 aa  94.4  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  25.14 
 
 		 402 aa  92.8  8e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  25.83 
 
 		 446 aa  92.8  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  25.06 
 
 		 446 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  24.86 
 
 		 401 aa  92.4  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  27.22 
 
 		 356 aa  92.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  25.06 
 
 		 430 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  28.93 
 
 		 397 aa  92  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  30.46 
 
 		 293 aa  90.5  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  25.56 
 
 		 426 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  25 
 
 		 431 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  25.54 
 
 		 375 aa  88.2  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  25.21 
 
 		 338 aa  88.2  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2319  integrase family protein  24.4 
 
 		 493 aa  87.4  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  27 
 
 		 381 aa  86.3  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  25.37 
 
 		 428 aa  85.9  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2325  phage integrase family protein  25.57 
 
 		 403 aa  85.9  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.633234  hitchhiker  0.0000214757 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  26.56 
 
 		 396 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01322  integrase  24.47 
 
 		 411 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2298  integrase family protein  24.47 
 
 		 411 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000253071  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  28.31 
 
 		 404 aa  82.8  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01332  hypothetical protein  24.47 
 
 		 411 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2118  integrative genetic element Gsu21, integrase  23.19 
 
 		 446 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  24.02 
 
 		 435 aa  80.9  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1995  integrase family protein  24.3 
 
 		 359 aa  80.9  0.00000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2465  putative pore-forming cytotoxin integrase  24.54 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.135007 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  24.43 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  26.07 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  24.46 
 
 		 398 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  25 
 
 		 370 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2497  integrase family protein  26.15 
 
 		 384 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.355652 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1181  integrase family protein  27.15 
 
 		 417 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588038 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  24.11 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01948  integrase  25.13 
 
 		 411 aa  76.6  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1356  phage integrase  25.62 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000418117  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  32.51 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  32.34 
 
 		 431 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  19.49 
 
 		 392 aa  73.9  0.000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  25.83 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4084  integrase family protein  30.87 
 
 		 356 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06819  integrase  28.52 
 
 		 341 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  25.25 
 
 		 379 aa  72.8  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  24.14 
 
 		 392 aa  72  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  25.97 
 
 		 383 aa  71.2  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  26.57 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  20.28 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5560  integrase family protein  30.35 
 
 		 273 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  23.89 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1985  phage integrase family protein  29.88 
 
 		 469 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0479  phage integrase  24.65 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00687154  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0926  integrase family protein  25.61 
 
 		 438 aa  67.4  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  25.27 
 
 		 454 aa  67.4  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  23.75 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  31.07 
 
 		 386 aa  66.6  0.0000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  27.27 
 
 		 374 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  27.27 
 
 		 374 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3063  integrase family protein  31.29 
 
 		 257 aa  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000494154  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.97 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.97 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  31.34 
 
 		 442 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  26.75 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  29.9 
 
 		 325 aa  66.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19160  site-specific recombinase XerD  22.95 
 
 		 356 aa  65.9  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  0.148917 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0800  Phage integrase  19.64 
 
 		 369 aa  65.5  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1996  bacteriophage integrase family protein  31.18 
 
 		 190 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0601499  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  29.29 
 
 		 402 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  31.23 
 
 		 379 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  31.96 
 
 		 370 aa  65.1  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  28.14 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  31.34 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  31.23 
 
 		 379 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>