More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0479 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0479  phage integrase  100 
 
 		 357 aa  735    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00687154  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  34.34 
 
 		 396 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  35.16 
 
 		 356 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  30.26 
 
 		 375 aa  140  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2325  phage integrase family protein  30.77 
 
 		 403 aa  133  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.633234  hitchhiker  0.0000214757 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  32.13 
 
 		 401 aa  129  9.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  31.8 
 
 		 402 aa  127  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2465  putative pore-forming cytotoxin integrase  28.34 
 
 		 381 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.135007 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06819  integrase  34.14 
 
 		 341 aa  105  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  27.09 
 
 		 401 aa  100  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  26.67 
 
 		 411 aa  100  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1995  integrase family protein  30.2 
 
 		 359 aa  99  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  26.73 
 
 		 428 aa  97.4  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  26.78 
 
 		 414 aa  97.4  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01948  integrase  29.62 
 
 		 411 aa  96.7  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  28.24 
 
 		 398 aa  94  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  28.24 
 
 		 426 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  28.24 
 
 		 431 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  27.94 
 
 		 403 aa  92.4  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  27.41 
 
 		 430 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  27.41 
 
 		 446 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  27.41 
 
 		 446 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1958  integrase family protein  27.48 
 
 		 431 aa  85.9  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00797743  normal  0.0944215 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  26.09 
 
 		 435 aa  85.9  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2393  phage integrase family site specific recombinase  30.52 
 
 		 412 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.682709  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01322  integrase  27.86 
 
 		 411 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2298  integrase family protein  27.86 
 
 		 411 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000253071  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01332  hypothetical protein  27.86 
 
 		 411 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1996  bacteriophage integrase family protein  36.13 
 
 		 190 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0601499  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  27.53 
 
 		 428 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  0.0000530695 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2315  integrase family protein  28.98 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1181  integrase family protein  25.26 
 
 		 417 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588038 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  23.81 
 
 		 397 aa  83.6  0.000000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  27.06 
 
 		 471 aa  82.8  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  26.07 
 
 		 276 aa  82.4  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  27.67 
 
 		 433 aa  81.6  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  26.29 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  26.6 
 
 		 407 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2000  integrase family protein  24.03 
 
 		 430 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000276307  normal  0.758982 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1951  phage integrase family protein  24.03 
 
 		 430 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000646207  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  25.08 
 
 		 391 aa  79  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  24.83 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2497  integrase family protein  29.65 
 
 		 384 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.355652 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  24.24 
 
 		 407 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0638  lipoprotein  26.33 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0706  site-specific recombinase, phage integrase family protein  26.33 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  26.17 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4084  integrase family protein  27.13 
 
 		 356 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5560  integrase family protein  28.25 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  24.03 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0800  Phage integrase  28.11 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  26.37 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  22.97 
 
 		 369 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  23.49 
 
 		 338 aa  69.7  0.00000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  22.49 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2077  putative phage integrase  30 
 
 		 302 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3499  integrase family protein  26.62 
 
 		 368 aa  68.9  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000340769  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  22.19 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  22.98 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  28.01 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  24.12 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  22.49 
 
 		 369 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0746  phage integrase family protein  24.65 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2937  integrase, putative  47.83 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.456202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2082  site-specific recombinase, phage integrase family protein  29.63 
 
 		 260 aa  67  0.0000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  25.09 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0067  phage integrase family protein  24.03 
 
 		 328 aa  65.9  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  24.52 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2508  phage integrase family protein  29.34 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3235  Phage integrase  24.31 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  22.88 
 
 		 402 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  24.54 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  25.47 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1885  phage integrase-like SAM-like  28.24 
 
 		 190 aa  65.1  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.618174  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3350  integrase  23.19 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00359362  decreased coverage  0.00980373 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  24.74 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2093  integrase family protein  27.44 
 
 		 385 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.379176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24051  hypothetical protein  28.64 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  25.24 
 
 		 388 aa  62.8  0.000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  25.54 
 
 		 292 aa  62  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  26.05 
 
 		 251 aa  62.4  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  27.92 
 
 		 454 aa  62  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  22.9 
 
 		 377 aa  62.4  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  25.85 
 
 		 354 aa  62.4  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  24.08 
 
 		 412 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  29.32 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  29.11 
 
 		 303 aa  62  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646575 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0135  bacteriophage-related integrase  28.1 
 
 		 385 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.566608  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1451  integrase family protein  23.31 
 
 		 371 aa  62  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  22.56 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  23.4 
 
 		 390 aa  62  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1462  Phage integrase  25.38 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  27.56 
 
 		 370 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  22.22 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  25.34 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3092  Phage integrase  30.48 
 
 		 386 aa  61.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000712508  normal  0.602347 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  23 
 
 		 482 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0927  tyrosine recombinase XerD  24.05 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0145  integrase family protein  27.51 
 
 		 363 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0766756 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03202  phage integrase  25.3 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000402051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>