113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2377 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2377  phage integrase family protein  100 
 
 		 397 aa  823    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.101211  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1783  Phage integrase  47.04 
 
 		 452 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.552394 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3063  integrase family protein  63.27 
 
 		 257 aa  296  5e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000494154  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3069  integrase family protein  42.08 
 
 		 436 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2271  hypothetical protein  48.66 
 
 		 337 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000219474  hitchhiker  0.000127881 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2118  integrative genetic element Gsu21, integrase  30.25 
 
 		 446 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2319  integrase family protein  31.61 
 
 		 493 aa  180  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  28.73 
 
 		 386 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  27.15 
 
 		 433 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  27.64 
 
 		 391 aa  119  9e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  26.6 
 
 		 412 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  28.69 
 
 		 414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  25.73 
 
 		 407 aa  107  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  26.17 
 
 		 397 aa  107  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  25.9 
 
 		 401 aa  107  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  24.93 
 
 		 411 aa  104  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  26.32 
 
 		 471 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  25.54 
 
 		 407 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  25.34 
 
 		 392 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  25.82 
 
 		 392 aa  97.1  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  22.55 
 
 		 435 aa  97.1  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0746  phage integrase family protein  23.76 
 
 		 384 aa  87  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  27.4 
 
 		 368 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  26.12 
 
 		 403 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  24.3 
 
 		 401 aa  76.6  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1995  integrase family protein  25.48 
 
 		 359 aa  75.9  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  24.02 
 
 		 402 aa  74.3  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  25.8 
 
 		 396 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3161  integrase family protein  25.52 
 
 		 403 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  25.47 
 
 		 365 aa  68.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4324  integrase family protein  31.78 
 
 		 396 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03202  phage integrase  26.89 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000402051  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  24.84 
 
 		 383 aa  65.1  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2325  phage integrase family protein  24.47 
 
 		 403 aa  64.7  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.633234  hitchhiker  0.0000214757 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2497  integrase family protein  22.61 
 
 		 384 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.355652 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4084  integrase family protein  25.79 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  26.5 
 
 		 276 aa  62.8  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  22.46 
 
 		 446 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03390  hypothetical protein  28.25 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000152663  unclonable  2.59325e-22 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  22.46 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  22.46 
 
 		 446 aa  60.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1590  phage integrase family protein  28.31 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  24.6 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  24.6 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2393  phage integrase family site specific recombinase  21.61 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.682709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2093  integrase family protein  25.14 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.379176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  22.6 
 
 		 397 aa  57  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  27.75 
 
 		 293 aa  57  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6364  integrase family protein  22.16 
 
 		 398 aa  56.6  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0800  Phage integrase  25.3 
 
 		 369 aa  56.2  0.0000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1189  integrase family protein  25.42 
 
 		 297 aa  55.8  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203109  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01948  integrase  21.08 
 
 		 411 aa  55.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  25 
 
 		 356 aa  53.9  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  28.07 
 
 		 396 aa  53.9  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  23.33 
 
 		 375 aa  53.5  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2621  integrase family protein  24.29 
 
 		 382 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000432273  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4448  phage integrase family protein  21.28 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0017  integrase family protein  25.91 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2315  integrase family protein  25.37 
 
 		 255 aa  52  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  41.18 
 
 		 428 aa  51.6  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  21.52 
 
 		 414 aa  50.4  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  23.26 
 
 		 407 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0045  phage integrase family site specific recombinase  22.36 
 
 		 456 aa  48.5  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.869382  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2846  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  25.19 
 
 		 344 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.24 
 
 		 296 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  38 
 
 		 428 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  0.0000530695 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  36.67 
 
 		 398 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  21.29 
 
 		 454 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  36.67 
 
 		 426 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  36.67 
 
 		 431 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0145  integrase family protein  24.18 
 
 		 363 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0766756 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  22.22 
 
 		 361 aa  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  21.08 
 
 		 404 aa  47.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  21.73 
 
 		 451 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  25.94 
 
 		 312 aa  47.8  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.62 
 
 		 296 aa  47.4  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.24 
 
 		 296 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.24 
 
 		 296 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01322  integrase  42.55 
 
 		 411 aa  47  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2298  integrase family protein  42.55 
 
 		 411 aa  47  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000253071  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  23.89 
 
 		 381 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3449  tyrosine recombinase XerD  23.42 
 
 		 300 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01332  hypothetical protein  42.55 
 
 		 411 aa  47  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  27.51 
 
 		 320 aa  46.6  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.24 
 
 		 296 aa  46.6  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.24 
 
 		 296 aa  46.6  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2832  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  25.19 
 
 		 344 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.206304  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.24 
 
 		 296 aa  46.6  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0843  tyrosine recombinase XerD  23.42 
 
 		 309 aa  46.6  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  27.63 
 
 		 451 aa  46.6  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.24 
 
 		 296 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  21.28 
 
 		 393 aa  46.2  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.86 
 
 		 296 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.86 
 
 		 296 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2582  integrase  25.17 
 
 		 349 aa  46.2  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000812443  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  22.52 
 
 		 303 aa  46.2  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646575 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.86 
 
 		 296 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  21.25 
 
 		 392 aa  45.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  21.6 
 
 		 451 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3665  integrase family protein  28.3 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211751 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>