157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1783 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1783  Phage integrase  100 
 
 		 452 aa  931    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.552394 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2271  hypothetical protein  95.26 
 
 		 337 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000219474  hitchhiker  0.000127881 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3069  integrase family protein  48.17 
 
 		 436 aa  382  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2377  phage integrase family protein  47.04 
 
 		 397 aa  338  8e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.101211  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3063  integrase family protein  50.59 
 
 		 257 aa  268  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000494154  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2118  integrative genetic element Gsu21, integrase  33.42 
 
 		 446 aa  226  6e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2319  integrase family protein  32.76 
 
 		 493 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  26.9 
 
 		 471 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  29.31 
 
 		 412 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  28.57 
 
 		 435 aa  120  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  29.56 
 
 		 401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  26.41 
 
 		 407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  27.15 
 
 		 433 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  27.25 
 
 		 411 aa  111  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  27.17 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  26.03 
 
 		 407 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  26.87 
 
 		 386 aa  101  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  25.71 
 
 		 392 aa  100  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  26.56 
 
 		 397 aa  100  7e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  26.23 
 
 		 392 aa  98.2  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  25.71 
 
 		 391 aa  97.4  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  27.91 
 
 		 403 aa  93.2  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0746  phage integrase family protein  26.05 
 
 		 384 aa  90.9  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1995  integrase family protein  25.34 
 
 		 359 aa  90.5  5e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  27.03 
 
 		 454 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2077  putative phage integrase  28.45 
 
 		 302 aa  75.9  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2082  site-specific recombinase, phage integrase family protein  28.45 
 
 		 260 aa  75.5  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  26.64 
 
 		 365 aa  74.3  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  22.85 
 
 		 446 aa  73.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  22.85 
 
 		 446 aa  73.6  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  22.85 
 
 		 430 aa  73.6  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  29.38 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  31.65 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0638  lipoprotein  26.74 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0706  site-specific recombinase, phage integrase family protein  26.74 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2315  integrase family protein  26.24 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0800  Phage integrase  24.4 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  23.72 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  23.45 
 
 		 401 aa  67.8  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  22.55 
 
 		 370 aa  67.4  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  29.31 
 
 		 396 aa  67  0.0000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  22.93 
 
 		 370 aa  66.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  25.85 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  26.55 
 
 		 276 aa  65.9  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  22.17 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  23.63 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.19 
 
 		 374 aa  65.1  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.19 
 
 		 374 aa  65.1  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2497  integrase family protein  26.5 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.355652 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  23.15 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  22.01 
 
 		 390 aa  62.8  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01322  integrase  41.94 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2298  integrase family protein  41.94 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000253071  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01332  hypothetical protein  41.94 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  22.2 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  0.0000530695 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  34.5 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  34.5 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2393  phage integrase family site specific recombinase  23.77 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.682709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2325  phage integrase family protein  23.62 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.633234  hitchhiker  0.0000214757 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  25.45 
 
 		 396 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  25.35 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  21.12 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  23.72 
 
 		 393 aa  58.5  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  24.01 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  22.8 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  24.54 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1691  phage integrase family protein  25.95 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  26.13 
 
 		 371 aa  57  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  23.53 
 
 		 359 aa  57  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  21.12 
 
 		 426 aa  56.6  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  21.85 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  22.79 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03202  phage integrase  23.65 
 
 		 292 aa  56.2  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000402051  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01948  integrase  22.03 
 
 		 411 aa  56.2  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  23.15 
 
 		 369 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1419  integrase family protein  24.9 
 
 		 390 aa  56.2  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.447287  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  29.09 
 
 		 423 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4274  phage integrase  22.15 
 
 		 407 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  22.19 
 
 		 378 aa  55.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02901  hypothetical protein  29.07 
 
 		 354 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.338381 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4084  integrase family protein  26.75 
 
 		 356 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  22.6 
 
 		 407 aa  55.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  22.84 
 
 		 356 aa  55.1  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  22.3 
 
 		 354 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  22.3 
 
 		 354 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2465  putative pore-forming cytotoxin integrase  24.63 
 
 		 381 aa  54.7  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.135007 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24051  hypothetical protein  27.72 
 
 		 368 aa  54.3  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03390  hypothetical protein  26.47 
 
 		 169 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000152663  unclonable  2.59325e-22 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  24.48 
 
 		 443 aa  53.1  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  20.77 
 
 		 402 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  32.79 
 
 		 398 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4448  phage integrase family protein  21.91 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2141  hypothetical protein  35.48 
 
 		 140 aa  52  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.256341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  21.84 
 
 		 368 aa  52  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  21.27 
 
 		 422 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0924  integrase family protein  21.18 
 
 		 399 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0524  integrase family protein  25.58 
 
 		 407 aa  51.6  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.236803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  24.68 
 
 		 392 aa  50.8  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  22.94 
 
 		 290 aa  50.4  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  21.08 
 
 		 414 aa  50.4  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>