69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2118 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2118  integrative genetic element Gsu21, integrase  100 
 
 		 446 aa  934    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3069  integrase family protein  33.74 
 
 		 436 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1783  Phage integrase  33.42 
 
 		 452 aa  226  6e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.552394 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2319  integrase family protein  32.52 
 
 		 493 aa  218  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2377  phage integrase family protein  29.7 
 
 		 397 aa  182  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.101211  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3063  integrase family protein  31.77 
 
 		 257 aa  154  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000494154  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2271  hypothetical protein  34.39 
 
 		 337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000219474  hitchhiker  0.000127881 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0746  phage integrase family protein  23.94 
 
 		 384 aa  81.6  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  23.47 
 
 		 401 aa  73.2  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4084  integrase family protein  28.98 
 
 		 356 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  22.82 
 
 		 411 aa  69.7  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  23.08 
 
 		 391 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  22.62 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  22.25 
 
 		 433 aa  67  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  21.64 
 
 		 471 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  21.19 
 
 		 435 aa  61.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  26.46 
 
 		 396 aa  59.3  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  22.55 
 
 		 403 aa  59.3  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  20.43 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  21.97 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24051  hypothetical protein  26.63 
 
 		 368 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01322  integrase  36.76 
 
 		 411 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  36.76 
 
 		 398 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01332  hypothetical protein  36.76 
 
 		 411 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2298  integrase family protein  36.76 
 
 		 411 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000253071  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  32.22 
 
 		 407 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  36.76 
 
 		 431 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  36.76 
 
 		 426 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2315  integrase family protein  32.86 
 
 		 255 aa  53.5  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  24.65 
 
 		 402 aa  53.5  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  22.19 
 
 		 386 aa  53.5  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  23.95 
 
 		 401 aa  53.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2393  phage integrase family site specific recombinase  33.71 
 
 		 412 aa  52.8  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.682709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4324  integrase family protein  24.32 
 
 		 396 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  26.84 
 
 		 390 aa  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  31.71 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  0.0000530695 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  22.1 
 
 		 365 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  20.93 
 
 		 388 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2497  integrase family protein  25.57 
 
 		 384 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.355652 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  24.22 
 
 		 422 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  29.59 
 
 		 407 aa  51.6  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  23.62 
 
 		 402 aa  51.6  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  19.76 
 
 		 370 aa  51.2  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01948  integrase  31.94 
 
 		 411 aa  50.1  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  28.72 
 
 		 428 aa  48.9  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2141  hypothetical protein  30.49 
 
 		 140 aa  49.3  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.256341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02901  hypothetical protein  24.08 
 
 		 354 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.338381 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  31.33 
 
 		 430 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  31.33 
 
 		 446 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  31.33 
 
 		 446 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1985  phage integrase family protein  22.25 
 
 		 469 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  25 
 
 		 422 aa  48.5  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  22.82 
 
 		 389 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  21.66 
 
 		 391 aa  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1356  phage integrase  27.27 
 
 		 388 aa  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000418117  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  22.67 
 
 		 387 aa  46.6  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  21.47 
 
 		 435 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  23.1 
 
 		 381 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  26.47 
 
 		 392 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  23.39 
 
 		 392 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2621  integrase family protein  26.28 
 
 		 382 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000432273  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  22.94 
 
 		 414 aa  45.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2093  integrase family protein  23.24 
 
 		 385 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.379176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  25.88 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3161  integrase family protein  26.03 
 
 		 403 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3235  Phage integrase  24.72 
 
 		 395 aa  43.9  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4448  phage integrase family protein  21.14 
 
 		 424 aa  43.5  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1590  phage integrase family protein  26.17 
 
 		 198 aa  43.1  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  23.67 
 
 		 443 aa  43.1  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>