212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_02901 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_02901  hypothetical protein  100 
 
 		 354 aa  722    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.338381 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24051  hypothetical protein  58.13 
 
 		 368 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4084  integrase family protein  28.52 
 
 		 356 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2497  integrase family protein  24.79 
 
 		 384 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.355652 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2093  integrase family protein  25 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.379176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  34.52 
 
 		 414 aa  77  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  30.3 
 
 		 356 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  30.04 
 
 		 477 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  31.67 
 
 		 375 aa  70.5  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  25.45 
 
 		 414 aa  70.1  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  29.5 
 
 		 412 aa  69.3  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  28.28 
 
 		 353 aa  68.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  27.39 
 
 		 391 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  27.87 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  24.5 
 
 		 401 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  28.63 
 
 		 435 aa  65.1  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  30.27 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0145  integrase family protein  21.02 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0766756 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  27.31 
 
 		 396 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  28.65 
 
 		 407 aa  63.9  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  24.17 
 
 		 402 aa  63.5  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  31.38 
 
 		 390 aa  63.2  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  29.95 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.11 
 
 		 374 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.11 
 
 		 374 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  29.12 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  29.11 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  30.54 
 
 		 368 aa  61.6  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  30.32 
 
 		 377 aa  60.8  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  26.97 
 
 		 407 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2605  integrase family protein  25.23 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0311051  normal  0.282598 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  27.04 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  24.75 
 
 		 398 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  27.14 
 
 		 338 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  24.02 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  24.75 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  24.75 
 
 		 426 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  24.02 
 
 		 446 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  24.02 
 
 		 446 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3235  Phage integrase  23.08 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  28.08 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  25.13 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  27.27 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0108  shufflon-specific DNA recombinase  24.56 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  29.02 
 
 		 381 aa  57  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0479  phage integrase  25.4 
 
 		 357 aa  56.2  0.0000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00687154  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1783  Phage integrase  29.07 
 
 		 452 aa  55.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.552394 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3943  integrase family protein  33.33 
 
 		 433 aa  55.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0746  phage integrase family protein  29.21 
 
 		 384 aa  55.8  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  26.37 
 
 		 367 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2393  phage integrase family site specific recombinase  25.99 
 
 		 412 aa  54.7  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.682709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  29.59 
 
 		 371 aa  55.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  29.38 
 
 		 320 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  25.62 
 
 		 330 aa  55.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  27.78 
 
 		 422 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  23.89 
 
 		 428 aa  54.7  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  25.2 
 
 		 308 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  23.4 
 
 		 392 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0565  phage integrase family protein  27.01 
 
 		 459 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0807  phage integrase family protein  27.68 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  24.72 
 
 		 386 aa  54.3  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  26 
 
 		 381 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  26.67 
 
 		 400 aa  54.3  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  28.14 
 
 		 422 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  30.06 
 
 		 275 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  23.4 
 
 		 392 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  30.12 
 
 		 381 aa  54.3  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  29.03 
 
 		 363 aa  54.7  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  29.55 
 
 		 209 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0691  hypothetical protein  28.98 
 
 		 454 aa  53.9  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.116997 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4373  integrase family protein  24.88 
 
 		 226 aa  53.9  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  28.28 
 
 		 338 aa  53.9  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  30.99 
 
 		 393 aa  53.9  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  28.14 
 
 		 402 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  25.81 
 
 		 370 aa  53.9  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0078  integrase family protein  31.11 
 
 		 456 aa  53.1  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144212  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1986  phage integrase family site specific recombinase  25.68 
 
 		 375 aa  52.4  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  24.91 
 
 		 356 aa  52.4  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0498  phage integrase family protein  29.02 
 
 		 390 aa  52.4  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000218969  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  28.19 
 
 		 433 aa  52.4  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  28.12 
 
 		 463 aa  52.8  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  28.14 
 
 		 379 aa  52.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0546  integrase family protein  24.56 
 
 		 403 aa  52  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.849888  hitchhiker  0.000145945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6841  integrase family protein  28.98 
 
 		 492 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3921  phage integrase family protein  25.79 
 
 		 327 aa  52.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470105  hitchhiker  0.00183347 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  25.33 
 
 		 386 aa  52  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01322  integrase  26.5 
 
 		 411 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2298  integrase family protein  26.5 
 
 		 411 aa  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000253071  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01332  hypothetical protein  26.5 
 
 		 411 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6364  integrase family protein  26 
 
 		 398 aa  51.2  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  27.18 
 
 		 471 aa  51.2  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  31.21 
 
 		 387 aa  51.2  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  26.79 
 
 		 334 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  28.11 
 
 		 385 aa  51.2  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  23.9 
 
 		 428 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  0.0000530695 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0800  Phage integrase  24.71 
 
 		 369 aa  50.8  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1864  integrase family protein  26.69 
 
 		 429 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  29.35 
 
 		 370 aa  50.8  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  27.27 
 
 		 347 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2621  integrase family protein  23.35 
 
 		 382 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000432273  normal  0.433776 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>