More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01948 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01948  integrase  100 
 
 		 411 aa  858    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2298  integrase family protein  41.46 
 
 		 411 aa  301  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000253071  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01322  integrase  41.22 
 
 		 411 aa  300  3e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01332  hypothetical protein  41.22 
 
 		 411 aa  300  3e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  40.44 
 
 		 446 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  40.19 
 
 		 446 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  40.19 
 
 		 430 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  38.74 
 
 		 426 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  38.5 
 
 		 431 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  39.27 
 
 		 428 aa  279  8e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  0.0000530695 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  37.14 
 
 		 428 aa  274  2.0000000000000002e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2393  phage integrase family site specific recombinase  36.64 
 
 		 412 aa  261  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.682709  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  37.8 
 
 		 398 aa  258  2e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1181  integrase family protein  35.77 
 
 		 417 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588038 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2315  integrase family protein  43.14 
 
 		 255 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  33.82 
 
 		 401 aa  206  7e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  33.82 
 
 		 402 aa  205  1e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1356  phage integrase  31.25 
 
 		 388 aa  172  6.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000418117  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1958  integrase family protein  28.57 
 
 		 431 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00797743  normal  0.0944215 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2000  integrase family protein  29.4 
 
 		 430 aa  160  5e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000276307  normal  0.758982 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1951  phage integrase family protein  29.4 
 
 		 430 aa  160  5e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000646207  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  29.12 
 
 		 375 aa  136  7.000000000000001e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  28.03 
 
 		 411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  27.72 
 
 		 412 aa  127  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  26.79 
 
 		 392 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  26.53 
 
 		 392 aa  123  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06819  integrase  32.93 
 
 		 341 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  28.78 
 
 		 396 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  26.37 
 
 		 401 aa  117  5e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  26.88 
 
 		 471 aa  116  7.999999999999999e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  26.28 
 
 		 391 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03202  phage integrase  33.2 
 
 		 292 aa  114  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000402051  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2465  putative pore-forming cytotoxin integrase  30.38 
 
 		 381 aa  114  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.135007 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  26.59 
 
 		 356 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  26.97 
 
 		 407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  27.16 
 
 		 386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  28.25 
 
 		 435 aa  111  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  27.03 
 
 		 433 aa  110  5e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  28.33 
 
 		 403 aa  108  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2325  phage integrase family protein  27.38 
 
 		 403 aa  107  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.633234  hitchhiker  0.0000214757 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  26.54 
 
 		 414 aa  107  5e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  25.8 
 
 		 397 aa  106  9e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  26.39 
 
 		 407 aa  106  9e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0479  phage integrase  29.62 
 
 		 357 aa  96.7  7e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00687154  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1996  bacteriophage integrase family protein  32.4 
 
 		 190 aa  95.5  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0601499  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5560  integrase family protein  28.34 
 
 		 273 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  25.77 
 
 		 391 aa  90.5  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  32.54 
 
 		 276 aa  90.5  5e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  23.77 
 
 		 393 aa  89.7  7e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  23.08 
 
 		 369 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  23.48 
 
 		 369 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  27.34 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  28.96 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  25.19 
 
 		 383 aa  84  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  23.56 
 
 		 384 aa  82.4  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1927  phage integrase family protein  25.55 
 
 		 424 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  23.26 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  23.97 
 
 		 363 aa  80.5  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  22.19 
 
 		 371 aa  79  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  28.85 
 
 		 379 aa  79  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  26.63 
 
 		 392 aa  78.6  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  27 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  23.49 
 
 		 369 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  26.59 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1995  integrase family protein  26.48 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  25.81 
 
 		 338 aa  77  0.0000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  23.7 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.33 
 
 		 374 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.33 
 
 		 374 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  26.44 
 
 		 377 aa  75.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  32.43 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0746  phage integrase family protein  25.38 
 
 		 384 aa  74.7  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2141  hypothetical protein  41.67 
 
 		 140 aa  73.9  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.256341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  26.05 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  22.1 
 
 		 392 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1932  integrase/recombinase, phage associated  24.6 
 
 		 379 aa  72.8  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.706433  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  26.39 
 
 		 388 aa  71.6  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1986  phage integrase family site specific recombinase  25.4 
 
 		 375 aa  70.9  0.00000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  23.92 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  23.01 
 
 		 388 aa  70.9  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7637  integrase family protein  24.3 
 
 		 425 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  22.73 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  22.73 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  24.03 
 
 		 389 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  22.46 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0800  Phage integrase  24.73 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1419  integrase family protein  25.52 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.447287  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  23.71 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  26.73 
 
 		 381 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3069  integrase family protein  21.46 
 
 		 436 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  23.35 
 
 		 402 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  21.51 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  21.04 
 
 		 362 aa  67  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  23.92 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  31.16 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  26.36 
 
 		 275 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0135  bacteriophage-related integrase  21.54 
 
 		 385 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.566608  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  23.77 
 
 		 383 aa  66.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1993  phage integrase family site specific recombinase  29.24 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  25.55 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>