225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1927 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_1927  phage integrase family protein  100 
 
 		 424 aa  879    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1951  phage integrase family protein  30.61 
 
 		 430 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000646207  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2000  integrase family protein  30.61 
 
 		 430 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000276307  normal  0.758982 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1958  integrase family protein  27.41 
 
 		 431 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00797743  normal  0.0944215 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2465  putative pore-forming cytotoxin integrase  26.35 
 
 		 381 aa  107  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.135007 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  24.41 
 
 		 433 aa  104  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06819  integrase  27.3 
 
 		 341 aa  103  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01322  integrase  26.28 
 
 		 411 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2298  integrase family protein  26.28 
 
 		 411 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000253071  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01332  hypothetical protein  26.28 
 
 		 411 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  24.56 
 
 		 426 aa  83.2  0.000000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1356  phage integrase  32.96 
 
 		 388 aa  82.8  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000418117  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  24.27 
 
 		 398 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01948  integrase  25.55 
 
 		 411 aa  82  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  24.27 
 
 		 431 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  22.4 
 
 		 411 aa  78.2  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  21.71 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  24.58 
 
 		 435 aa  77.4  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4388  integrase family protein  25.81 
 
 		 399 aa  77  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.754595  normal  0.599822 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  24.09 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  26.91 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.49 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.49 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  25.48 
 
 		 393 aa  73.9  0.000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  24.31 
 
 		 428 aa  73.6  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  0.0000530695 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  22.7 
 
 		 446 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  22.7 
 
 		 446 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  22.28 
 
 		 370 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2393  phage integrase family site specific recombinase  21.47 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.682709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  22.85 
 
 		 430 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  23.66 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  26.72 
 
 		 402 aa  67.4  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1189  integrase family protein  27.54 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203109  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  21.92 
 
 		 386 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  25.91 
 
 		 401 aa  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2797  phage integrase family protein  24.41 
 
 		 451 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4065  integrase family protein  23.96 
 
 		 394 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.438471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2325  phage integrase family protein  30.86 
 
 		 403 aa  64.7  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.633234  hitchhiker  0.0000214757 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  22.22 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3648  phage integrase family protein  19.83 
 
 		 503 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.215294  normal  0.165741 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  22.19 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  22.98 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  24.63 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  24.57 
 
 		 387 aa  62.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  26.9 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  25.39 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3108  integrase family protein  23.61 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512092  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0222  integrase family protein  28.35 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.948796  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  25 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_012917  PC1_2315  integrase family protein  28.04 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1996  bacteriophage integrase family protein  25.29 
 
 		 190 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0601499  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  24.27 
 
 		 369 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  22.49 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  23.86 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  26.32 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  23.44 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1297  phage integrase family protein  27.59 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1936  integrase family protein  22.48 
 
 		 391 aa  57  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.642431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  26.55 
 
 		 370 aa  57  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  24.54 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2625  phage integrase family protein  24.6 
 
 		 409 aa  57  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0300817  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1462  Phage integrase  23.88 
 
 		 387 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  24.54 
 
 		 442 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  25.13 
 
 		 392 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0574  integrase family protein  26.65 
 
 		 295 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  25.19 
 
 		 379 aa  55.8  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  25.13 
 
 		 392 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  24.59 
 
 		 397 aa  56.2  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0479  phage integrase  24.85 
 
 		 357 aa  55.5  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00687154  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1181  integrase family protein  21.59 
 
 		 417 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588038 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0517  integrase family protein  26.47 
 
 		 335 aa  53.9  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19160  site-specific recombinase XerD  29.21 
 
 		 356 aa  53.9  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  0.148917 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1096  integrase  23.05 
 
 		 374 aa  53.5  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.077251  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  23.95 
 
 		 471 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  22.58 
 
 		 443 aa  53.5  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2649  phage integrase family protein  21.02 
 
 		 381 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.833719 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  22.19 
 
 		 402 aa  53.1  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  21.91 
 
 		 407 aa  53.1  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  23.95 
 
 		 471 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2018  integrase family protein  24.41 
 
 		 452 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  21.93 
 
 		 390 aa  52.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2069  phage integrase family protein  24.1 
 
 		 419 aa  52.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0530977  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.55 
 
 		 298 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  24.19 
 
 		 401 aa  52.8  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  22.6 
 
 		 407 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1386  integrase family protein  25.13 
 
 		 344 aa  52.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.114707  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  25.44 
 
 		 325 aa  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  25.37 
 
 		 379 aa  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  22.63 
 
 		 404 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  23.61 
 
 		 383 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  22.31 
 
 		 396 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  22.87 
 
 		 400 aa  51.6  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0232  integrase/recombinase, putative  24.74 
 
 		 347 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000342454  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  25.15 
 
 		 389 aa  51.6  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0189  integrase/recombinase, putative  24.74 
 
 		 347 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122412  hitchhiker  3.7857800000000004e-44 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1487  phage integrase family protein  21.07 
 
 		 342 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.115706  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0746  phage integrase family protein  27.81 
 
 		 384 aa  51.6  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.27 
 
 		 298 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  24.86 
 
 		 378 aa  50.8  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  20.86 
 
 		 378 aa  51.2  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>