More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2069 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2069  phage integrase family protein  100 
 
 		 419 aa  865    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0530977  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3592  phage integrase family protein  35.76 
 
 		 419 aa  188  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2633  phage integrase family protein  35.47 
 
 		 419 aa  179  7e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1600  phage integrase family protein  32.34 
 
 		 404 aa  161  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3281  integrase family protein  31 
 
 		 372 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.739809 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2705  phage integrase family protein  35.32 
 
 		 386 aa  160  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248695  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0211  integrase family protein  31.94 
 
 		 384 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000967186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5336  integrase family protein  30.67 
 
 		 378 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_002950  PG0874  mobilizable transposon, int protein  28.37 
 
 		 367 aa  147  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0746163 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0676  integrase family protein  29.33 
 
 		 390 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4000  phage integrase family protein  32.97 
 
 		 389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1173  phage integrase family site specific recombinase  31.55 
 
 		 354 aa  140  3e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4262  integrase family protein  30.8 
 
 		 379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0616  integrase family protein  26.87 
 
 		 394 aa  122  8e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5219  integrase family protein  29.72 
 
 		 406 aa  106  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.759008  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11843  putative transposase  31.17 
 
 		 416 aa  102  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.383494  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2366  integrase family protein  27.27 
 
 		 415 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4202  integrase family protein  29.08 
 
 		 406 aa  97.4  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0952  integrase family protein  28.06 
 
 		 412 aa  97.1  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571908  normal  0.0199815 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0145  integrase family protein  27.3 
 
 		 411 aa  94.7  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.468231  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00445  tyrosine type site-specific recombinase  28.47 
 
 		 405 aa  90.9  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.459489  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4345  phage integrase family protein  25.98 
 
 		 435 aa  89  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0819  integrase  22.8 
 
 		 409 aa  83.6  0.000000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1454  integrase  22.8 
 
 		 409 aa  83.6  0.000000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0974  integrase family protein  28.11 
 
 		 430 aa  76.6  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0711773  normal  0.0223597 
 
 
-
 
NC_002950  PG1113  integrase  28.41 
 
 		 407 aa  75.9  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  27.27 
 
 		 290 aa  76.3  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0820  integrase  30 
 
 		 400 aa  75.5  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1453  integrase  30 
 
 		 400 aa  75.5  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  31 
 
 		 343 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  31 
 
 		 343 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6168  integrase family protein  27.96 
 
 		 411 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  30.13 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  30.87 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1902  phage integrase  31.6 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0890  integrase family protein  29.28 
 
 		 436 aa  69.7  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.304857  normal  0.483711 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2484  phage integrase  27.2 
 
 		 304 aa  69.3  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72317  normal  0.0269236 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 319 aa  69.3  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1611  tyrosine recombinase  24.4 
 
 		 308 aa  68.9  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3248  integrase family protein  28.74 
 
 		 437 aa  69.7  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.79 
 
 		 303 aa  68.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.279091  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4009  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.79 
 
 		 303 aa  68.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2271  phage integrase family protein  25.3 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0543  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.79 
 
 		 303 aa  68.9  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  25.91 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0497  tyrosine recombinase XerC  27.52 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.237269  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0184  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.27 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.72736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3973  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.556004  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  27.2 
 
 		 416 aa  67.8  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  25.16 
 
 		 367 aa  67.8  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2276  tyrosine recombinase XerD  29.03 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235275  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  25.09 
 
 		 378 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  30.87 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0358  integrase family protein  26.01 
 
 		 287 aa  67  0.0000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  24.02 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004441  site-specific recombinase XerD  29.48 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  27.57 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  26.83 
 
 		 293 aa  66.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2544  tyrosine recombinase XerC  30.56 
 
 		 318 aa  65.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.774585  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  26.79 
 
 		 275 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4164  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.85 
 
 		 311 aa  65.9  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.154418  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  25.48 
 
 		 311 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00956  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.08 
 
 		 305 aa  66.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1481  phage integrase family protein  25.42 
 
 		 311 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0281722  normal  0.205606 
 
 
-
 
NC_002950  PG0838  integrase  25.33 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.116388 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.64 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.182372  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  27.15 
 
 		 414 aa  65.5  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1462  Tn5520-like integrase (transfer factor)  26.92 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.174557  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1299  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.49 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2815  integrase/recombinase XerD  24.89 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1556  site-specific recombinase, phage integrase family  24.77 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0724  integrase family protein  26.64 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.971464 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  25.52 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1279  phage integrase family protein  25.62 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0644752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3697  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.65 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0234  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.78 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2440  tyrosine recombinase XerD  26.69 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5501  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.3 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1271  integrase family protein  24.77 
 
 		 331 aa  62.4  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.828065  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.88 
 
 		 299 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  28.66 
 
 		 404 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.88 
 
 		 299 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  27.51 
 
 		 306 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1428  phage integrase  25.95 
 
 		 317 aa  62.8  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.473602  normal  0.0585003 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0539  integrase family protein  28.8 
 
 		 436 aa  62.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.19804 
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1891  phage integrase family protein  25.59 
 
 		 278 aa  63.2  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0907  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.12 
 
 		 307 aa  62  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1435  integrase  25.85 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.102507 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0861  integrase/recombinase XerC  32.42 
 
 		 304 aa  62.4  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.88 
 
 		 299 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.88 
 
 		 299 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0537  tyrosine recombinase XerD subunit  28.84 
 
 		 302 aa  62  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  25.2 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0325  tyrosine recombinase XerC  28.77 
 
 		 297 aa  62  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.88 
 
 		 299 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1634  integrase family protein  43.04 
 
 		 354 aa  62  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.280587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5117  tyrosine recombinase XerD  28.98 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4277  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.89 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.88 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4229  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.89 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>