More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00445 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_00445  tyrosine type site-specific recombinase  100 
 
 		 405 aa  831    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.459489  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6168  integrase family protein  28.64 
 
 		 411 aa  155  9e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1729  hypothetical protein  26.11 
 
 		 404 aa  152  1e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000763037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1953  integrase family protein  26.29 
 
 		 405 aa  146  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247559  normal  0.500213 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1462  Tn5520-like integrase (transfer factor)  27.43 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.174557  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11843  putative transposase  24.39 
 
 		 416 aa  114  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.383494  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2366  integrase family protein  26.98 
 
 		 415 aa  112  9e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3099  integrase family protein  26.68 
 
 		 441 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.979662 
 
 
-
 
NC_002950  PG1113  integrase  25.56 
 
 		 407 aa  102  8e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0819  integrase  21.41 
 
 		 409 aa  95.5  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1454  integrase  21.41 
 
 		 409 aa  95.5  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03935  integrase  24.75 
 
 		 406 aa  92.4  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.439206  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5173  integrase family protein  23.57 
 
 		 411 aa  91.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54702 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2069  phage integrase family protein  28.47 
 
 		 419 aa  90.9  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0530977  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5219  integrase family protein  24.5 
 
 		 406 aa  88.2  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.759008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0974  integrase family protein  24.54 
 
 		 430 aa  88.2  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0711773  normal  0.0223597 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1316  integrase/recombinase  25 
 
 		 306 aa  87.4  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.718184  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0820  integrase  24.05 
 
 		 400 aa  85.1  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1453  integrase  24.05 
 
 		 400 aa  85.1  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0145  integrase family protein  22.62 
 
 		 411 aa  85.1  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.468231  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1283  phage integrase family protein  27.24 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000135681  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5531  integrase family protein  23.7 
 
 		 461 aa  82.8  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000725821  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1360  integrase/recombinase  24.58 
 
 		 306 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6099899999999998e-31 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4202  integrase family protein  23.85 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1600  phage integrase family protein  23.99 
 
 		 404 aa  80.5  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  22.15 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4000  phage integrase family protein  23.76 
 
 		 389 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4262  integrase family protein  23.77 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0952  integrase family protein  24.21 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571908  normal  0.0199815 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1995  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.86 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004441  site-specific recombinase XerD  24.21 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0669  phage integrase family protein  27.92 
 
 		 343 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4345  phage integrase family protein  23.75 
 
 		 435 aa  71.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2705  phage integrase family protein  25.65 
 
 		 386 aa  70.5  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248695  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0890  integrase family protein  22.43 
 
 		 436 aa  70.1  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.304857  normal  0.483711 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00956  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.16 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  24.5 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1435  integrase  23.85 
 
 		 408 aa  69.3  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.102507 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3300  tyrosine recombinase XerD  22.11 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02726  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.47 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0798  tyrosine recombinase XerD  23.47 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.966972  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3027  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.47 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3220  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.47 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02689  hypothetical protein  23.47 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.364794  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3053  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.47 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6437  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.81 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.798094 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4185  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.47 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  24.69 
 
 		 407 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3314  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.47 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0347  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.81 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0173  tyrosine recombinase XerD  21.5 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.861385  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.48 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  21.82 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1173  phage integrase family site specific recombinase  25.86 
 
 		 354 aa  67  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  21.23 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3133  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.75 
 
 		 306 aa  67  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  23.53 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0074  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.46 
 
 		 307 aa  67  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1227  integrase family protein  23.74 
 
 		 305 aa  67  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.842173  decreased coverage  0.000216705 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3592  phage integrase family protein  26.27 
 
 		 419 aa  67  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2996  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.75 
 
 		 306 aa  67  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0374572 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0539  integrase family protein  22.88 
 
 		 436 aa  66.6  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.19804 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0815  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.47 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.624778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  21.43 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0292  tyrosine recombinase XerD  21.65 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.17 
 
 		 299 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3082  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.4 
 
 		 306 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.633641  normal  0.120316 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  27.22 
 
 		 296 aa  65.9  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6131  integrase family protein  22.44 
 
 		 305 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.17 
 
 		 299 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  21.88 
 
 		 307 aa  66.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2473  site-specific tyrosine recombinase XerC  20.83 
 
 		 306 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3087  site-specific tyrosine recombinase XerC  20.83 
 
 		 306 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3426  tyrosine recombinase XerD  22.03 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  25.85 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3104  site-specific tyrosine recombinase XerC  20.49 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3281  integrase family protein  23.68 
 
 		 372 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.739809 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5117  tyrosine recombinase XerD  20.95 
 
 		 327 aa  65.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.83 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.83 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0211  integrase family protein  24.71 
 
 		 384 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000967186 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  24.55 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  21.18 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  26.83 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0195  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.68 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0950  integrase/recombinase XerD  22.26 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3428  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.68 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3258  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.68 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.706598  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1313  tyrosine recombinase XerD  21.67 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2920  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.68 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.510567  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  20.2 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2169  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.68 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.126979  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  22.99 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3331  tyrosine recombinase XerD  21.24 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.47 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4151  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.78 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3228  tyrosine recombinase XerD  21.24 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.302685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  21.18 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0838  integrase  24.31 
 
 		 432 aa  62.4  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.116388 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.36 
 
 		 310 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>