More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1556 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1556  site-specific recombinase, phage integrase family  100 
 
 		 331 aa  675    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1271  integrase family protein  99.7 
 
 		 331 aa  673    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.828065  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2283  phage integrase family protein  49.54 
 
 		 331 aa  323  4e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  32.8 
 
 		 367 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  30.8 
 
 		 402 aa  93.6  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  30.13 
 
 		 334 aa  92  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1465  integrase family protein  28.25 
 
 		 334 aa  89.7  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.890522 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  26.69 
 
 		 337 aa  89.4  7e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  35.71 
 
 		 393 aa  88.2  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1909  integrase family protein  31.7 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.838759  hitchhiker  0.00000212902 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  29.03 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  30.34 
 
 		 400 aa  80.1  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  30.53 
 
 		 411 aa  79.3  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  31.09 
 
 		 397 aa  79.3  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  33.47 
 
 		 365 aa  79  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  30.7 
 
 		 379 aa  79.3  0.00000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1487  phage integrase family protein  30.88 
 
 		 342 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.115706  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2633  phage integrase family protein  28.9 
 
 		 419 aa  76.6  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0981  phage integrase family site specific recombinase  27.82 
 
 		 331 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.896677  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  29.86 
 
 		 354 aa  75.9  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  29.22 
 
 		 353 aa  75.9  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2782  phage integrase family protein  32.06 
 
 		 356 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  31.54 
 
 		 159 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3592  phage integrase family protein  26.22 
 
 		 419 aa  74.7  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  30.26 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  34.32 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  29.17 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  34.32 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  34.09 
 
 		 392 aa  73.6  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1633  phage integrase  31.53 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1646  integrase family protein  31.95 
 
 		 330 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  27.2 
 
 		 506 aa  73.2  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0716  integrase  30.86 
 
 		 394 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0772  phage integrase  26.91 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7637  integrase family protein  30.35 
 
 		 425 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2564  phage integrase family protein  30.04 
 
 		 417 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.326638  hitchhiker  0.000921348 
 
 
-
 
NC_004310  BR0636  phage integrase family site specific recombinase  30.19 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2622  integrase family protein  27.88 
 
 		 335 aa  71.2  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.647869  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  26.75 
 
 		 401 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1208  phage integrase  28.63 
 
 		 476 aa  71.6  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2810  integrase  28.22 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0631  phage integrase family site specific recombinase  30.19 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  29.26 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3066  integrase  33.18 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0315896  hitchhiker  0.000000103666 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  29.72 
 
 		 463 aa  70.5  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  25.82 
 
 		 421 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  29 
 
 		 338 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  27.36 
 
 		 413 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  32.16 
 
 		 407 aa  70.1  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2236  integrase family protein  30.2 
 
 		 340 aa  70.1  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0483412  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  31.54 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  29.91 
 
 		 381 aa  70.1  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  31.86 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  29.34 
 
 		 384 aa  69.3  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3514  phage integrase family protein  33.12 
 
 		 336 aa  68.9  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123025  normal  0.0375273 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  29.27 
 
 		 349 aa  68.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53570  putative integrase  31.8 
 
 		 258 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000326616  decreased coverage  0.0000890956 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4448  phage integrase family protein  31.6 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2582  integrase  30.88 
 
 		 349 aa  67.8  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000812443  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  23.13 
 
 		 429 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  27.13 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  27.7 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3039  phage integrase  33.14 
 
 		 339 aa  67.4  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0026  Phage integrase  27.31 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  29.67 
 
 		 370 aa  67.4  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  29.51 
 
 		 378 aa  67.8  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  26.38 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4162  integrase family protein  29.15 
 
 		 396 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2649  integrase family protein  27.39 
 
 		 333 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.413706  hitchhiker  0.000000656425 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  29.41 
 
 		 404 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0669  phage integrase family protein  31.55 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  25.15 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  33.08 
 
 		 356 aa  66.6  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  33.33 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  28.87 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  38.52 
 
 		 396 aa  66.2  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  31.25 
 
 		 415 aa  65.9  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0966  phage integrase family site specific recombinase  26.17 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.832131  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2157  phage integrase  28.5 
 
 		 363 aa  65.1  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0421336  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3193  integrase family protein  36.89 
 
 		 365 aa  65.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1001  integrase family protein  31.28 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  33.81 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  38.06 
 
 		 482 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  30 
 
 		 388 aa  65.1  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3658  putative bacteriophage integrase  33.33 
 
 		 444 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  24.71 
 
 		 379 aa  64.3  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1807  integrase family protein  34.62 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.73649  hitchhiker  0.0000891918 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  27.45 
 
 		 384 aa  64.7  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3507  phage integrase family protein  35.71 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000014558 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  31.41 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  26.69 
 
 		 378 aa  64.3  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  23.24 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2069  phage integrase family protein  24.77 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0530977  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  27.23 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2194  integrase family protein  26.69 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  27.35 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0401  phage integrase family protein  28.99 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0710  Integrase protein  27.62 
 
 		 343 aa  63.5  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1008  phage integrase  28.65 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0108  shufflon-specific DNA recombinase  28.82 
 
 		 395 aa  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>