More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1487 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1487  phage integrase family protein  100 
 
 		 342 aa  705    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.115706  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2782  phage integrase family protein  68.53 
 
 		 356 aa  509  1e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0222  integrase family protein  50.88 
 
 		 343 aa  350  3e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.948796  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2236  integrase family protein  43.19 
 
 		 340 aa  309  5e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0483412  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0776  phage integrase  31.61 
 
 		 334 aa  85.1  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.0322595 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3980  phage integrase family protein  32.58 
 
 		 365 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1271  integrase family protein  30.88 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.828065  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1556  site-specific recombinase, phage integrase family  30.88 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  26.88 
 
 		 353 aa  77.4  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  25.38 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  24.52 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0880  phage integrase family protein  25.97 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0027577 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  27.57 
 
 		 367 aa  74.3  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  24.59 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  25.62 
 
 		 393 aa  73.9  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0135  bacteriophage-related integrase  24.36 
 
 		 385 aa  72.8  0.000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.566608  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  29.59 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  26.94 
 
 		 377 aa  72.8  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  28.27 
 
 		 402 aa  72.8  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  21.93 
 
 		 385 aa  72  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  29.66 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  33.7 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  25.14 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  25.87 
 
 		 378 aa  72  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  25.89 
 
 		 393 aa  71.2  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  27.91 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  25.83 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  28.33 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  26.48 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  25.43 
 
 		 477 aa  70.1  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2283  phage integrase family protein  33.17 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  28.37 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0358  integrase family protein  26.21 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  27.24 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  26.05 
 
 		 371 aa  69.7  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2157  phage integrase  26.67 
 
 		 363 aa  69.7  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0421336  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  24.39 
 
 		 337 aa  69.3  0.00000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.73 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  27.71 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1096  integrase  22.85 
 
 		 374 aa  68.9  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.077251  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  27.36 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.14 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.14 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  26.69 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3474  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.36 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  25.93 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  27.43 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1777  tyrosine recombinase XerD  24.31 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4219  phage integrase family protein  27.05 
 
 		 463 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  25.23 
 
 		 337 aa  67  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.73 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.73 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.73 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.73 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.73 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  26.01 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  24.44 
 
 		 414 aa  66.2  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  26.83 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  28.83 
 
 		 370 aa  65.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  29.49 
 
 		 310 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  23.98 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  27.2 
 
 		 354 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  25 
 
 		 379 aa  64.7  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0966  integrase family protein  23.27 
 
 		 346 aa  64.7  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1633  phage integrase  27.4 
 
 		 362 aa  65.1  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  26.89 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  26.45 
 
 		 354 aa  65.1  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2063  tyrosine recombinase XerD  24.51 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  27.31 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  27.2 
 
 		 354 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0840  integrase family protein  23.05 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.774041 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  26.61 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2276  tyrosine recombinase XerD  26.35 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235275  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  33.33 
 
 		 172 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3805  integrase  24.73 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239705  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  26.09 
 
 		 409 aa  63.9  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  22.83 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  26.42 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011733  PCC7424_5613  hypothetical protein  25.43 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  27.67 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  27.33 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  28.97 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  25 
 
 		 388 aa  63.5  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  24.44 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  25.2 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  32.67 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  34.38 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  24.89 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  28.29 
 
 		 454 aa  63.5  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  26.73 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  26.91 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  25.2 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  27.6 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.9 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.9 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2022  tyrosine recombinase XerD subunit  28.4 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  26.89 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  25.58 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4151  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.6 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  27.54 
 
 		 415 aa  63.2  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>