More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2564 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2564  phage integrase family protein  100 
 
 		 417 aa  862    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.326638  hitchhiker  0.000921348 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  48.65 
 
 		 415 aa  381  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  49.61 
 
 		 398 aa  344  2e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  46.63 
 
 		 381 aa  324  1e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  33.83 
 
 		 392 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0089  phage integrase family protein  37.8 
 
 		 400 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  35.02 
 
 		 397 aa  140  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  43.62 
 
 		 404 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  33.61 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  26.38 
 
 		 407 aa  99.8  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0526  phage integrase family protein  39.01 
 
 		 189 aa  98.6  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0707528  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  30.3 
 
 		 367 aa  97.8  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2954  integrase family protein  27.03 
 
 		 409 aa  96.7  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  30.31 
 
 		 400 aa  93.6  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  27.04 
 
 		 379 aa  92.8  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  38.19 
 
 		 412 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  36.48 
 
 		 159 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1808  phage integrase family site specific recombinase  29.21 
 
 		 352 aa  85.1  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.595703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  28.06 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  25.06 
 
 		 372 aa  84  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  38.46 
 
 		 429 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  34.27 
 
 		 421 aa  82  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0776  phage integrase  29.02 
 
 		 334 aa  81.3  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.0322595 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  28.57 
 
 		 338 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  22.86 
 
 		 368 aa  79.3  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  34.78 
 
 		 353 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1092  phage integrase  31.82 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00970061  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 393 aa  76.3  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0770  phage integrase family protein  34.38 
 
 		 387 aa  75.9  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17567  normal  0.038003 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  28.72 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  33.9 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  29.03 
 
 		 334 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  31.31 
 
 		 396 aa  73.9  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3128  integrase family protein  32.75 
 
 		 384 aa  73.9  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  31.82 
 
 		 482 aa  73.6  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  29.75 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  27.68 
 
 		 356 aa  73.2  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  26.56 
 
 		 354 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  26.56 
 
 		 354 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2865  site-specific recombinase XerD-like  24.24 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.11888  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3047  phage integrase  27.93 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.182322  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1556  site-specific recombinase, phage integrase family  30.04 
 
 		 331 aa  72  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  34.19 
 
 		 172 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0447  phage integrase  27.93 
 
 		 381 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0926  phage integrase family protein  27.93 
 
 		 381 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1271  integrase family protein  30.04 
 
 		 331 aa  72  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.828065  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  25.39 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  27.71 
 
 		 375 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3424  integrase family protein  36.42 
 
 		 437 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.728899 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  27.94 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  26.74 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  25.55 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1585  site-specific recombinase XerD-like  36.91 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.264485  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1462  Phage integrase  30.27 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  29.13 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  26.52 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  25.75 
 
 		 357 aa  69.7  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  34.69 
 
 		 401 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  30.17 
 
 		 374 aa  69.3  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  28.05 
 
 		 334 aa  69.3  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  26.78 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  22.9 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0962  integrase family protein  35.66 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000586623  decreased coverage  0.000000000358592 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  29.32 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  27.34 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0614  integrase family protein  27.83 
 
 		 476 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  25.55 
 
 		 370 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  26.85 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1136  phage integrase family protein  27.88 
 
 		 513 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  33.57 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  27.76 
 
 		 397 aa  67  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  26.69 
 
 		 295 aa  67  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  28.38 
 
 		 386 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  25.83 
 
 		 387 aa  67  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  0.00000000819042 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  26.19 
 
 		 391 aa  67  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  32.49 
 
 		 413 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  27.36 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  26.62 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  25.5 
 
 		 420 aa  66.6  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  33.33 
 
 		 434 aa  66.6  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  25.9 
 
 		 378 aa  66.2  0.0000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  30.61 
 
 		 324 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1721  phage integrase family protein  26.5 
 
 		 332 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.108351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3805  integrase  26.19 
 
 		 332 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239705  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  29.52 
 
 		 359 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3498  integrase family protein  22.73 
 
 		 486 aa  65.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1491  integrase family protein  33.14 
 
 		 273 aa  65.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.10711  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  31.64 
 
 		 354 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  26.79 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0108  shufflon-specific DNA recombinase  29.71 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  31.28 
 
 		 351 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2649  phage integrase family protein  25.68 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.833719 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1722  hypothetical protein  26.18 
 
 		 339 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0241  Phage integrase  26.23 
 
 		 377 aa  64.7  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  26.14 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  25.96 
 
 		 463 aa  64.7  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1111  phage integrase family protein  25.66 
 
 		 329 aa  64.7  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  29.79 
 
 		 411 aa  64.3  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  28.37 
 
 		 354 aa  64.3  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3980  phage integrase family protein  27.68 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356268  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>