More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1136 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_1136  phage integrase family protein  100 
 
 		 513 aa  1062    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  33.12 
 
 		 404 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  33.66 
 
 		 412 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  28.74 
 
 		 429 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  28.57 
 
 		 401 aa  136  9e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  27.42 
 
 		 421 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3424  integrase family protein  27.59 
 
 		 437 aa  106  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.728899 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  35.8 
 
 		 159 aa  97.1  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  33.73 
 
 		 172 aa  92.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2002  phage integrase  29.89 
 
 		 188 aa  91.3  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3658  putative bacteriophage integrase  26.97 
 
 		 444 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  24.71 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  34.55 
 
 		 397 aa  82  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  24.62 
 
 		 367 aa  81.6  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  23.9 
 
 		 386 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1727  phage integrase  29.32 
 
 		 267 aa  79  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  28.57 
 
 		 334 aa  79  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  31.94 
 
 		 402 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  29.95 
 
 		 379 aa  75.1  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0526  phage integrase family protein  32.45 
 
 		 189 aa  75.1  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0707528  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  24.62 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  29.73 
 
 		 400 aa  73.2  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  31.36 
 
 		 392 aa  72.8  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  23.9 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  29.62 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  29.3 
 
 		 354 aa  70.5  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  29.3 
 
 		 354 aa  70.5  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04122  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.7 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  27.45 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  26.57 
 
 		 384 aa  69.3  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  29.79 
 
 		 359 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  30.67 
 
 		 393 aa  69.3  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2564  phage integrase family protein  27.88 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.326638  hitchhiker  0.000921348 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  29.89 
 
 		 338 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  28.57 
 
 		 384 aa  67.8  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  22.79 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  22.1 
 
 		 353 aa  66.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  27.75 
 
 		 477 aa  66.6  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  25 
 
 		 414 aa  65.5  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0770  phage integrase family protein  27.88 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17567  normal  0.038003 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  27.68 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0736  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.21 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0825  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.21 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104756  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  26.06 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0996  phage integrase family protein  25.75 
 
 		 387 aa  63.2  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294682 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  24.26 
 
 		 370 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0318  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.33 
 
 		 300 aa  62  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  21.55 
 
 		 310 aa  62  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1092  phage integrase  28.66 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00970061  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0165  integrase family protein  26.54 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  28.28 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1360  integrase/recombinase  26.92 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6099899999999998e-31 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  26.99 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3903  phage integrase family site specific recombinase  41.89 
 
 		 99 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.823274  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6962  integrase family protein  34.16 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  26.67 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  26.75 
 
 		 482 aa  60.5  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  23.94 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  24.26 
 
 		 334 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1637  integrase  28.4 
 
 		 174 aa  60.1  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0912  integrase/recombinase  29.94 
 
 		 304 aa  60.1  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0261382  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1914  integrase/recombinase  29.94 
 
 		 304 aa  60.1  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00100079  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2797  phage integrase family protein  24.56 
 
 		 451 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  26.32 
 
 		 330 aa  60.1  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  27.67 
 
 		 387 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  0.00000000819042 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3796  phage integrase family protein  29.94 
 
 		 304 aa  60.1  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  22.73 
 
 		 354 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  34.04 
 
 		 451 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  34.04 
 
 		 451 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  34.04 
 
 		 451 aa  58.5  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  27.97 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  26.37 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1565  phage integrase  27.4 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.314527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  20.58 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  26.37 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  27.33 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0045  phage integrase family site specific recombinase  34.88 
 
 		 456 aa  57.8  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.869382  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  25.99 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  41.79 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  25.79 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  25.56 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3062  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.16 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2236  integrase family protein  25.98 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0483412  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  24.29 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  21.78 
 
 		 451 aa  57  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1532  phage integrase family site specific recombinase  27.96 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4231  integrase/recombinase  27.74 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000145909  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3005  phage integrase family site specific recombinase  27.96 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3070  prophage DLP12 integrase  27.96 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3128  integrase family protein  23.81 
 
 		 384 aa  56.6  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3300  phage integrase family site specific recombinase  27.96 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248425  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  21.81 
 
 		 378 aa  56.6  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  25.16 
 
 		 324 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  25.14 
 
 		 377 aa  56.6  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2283  phage integrase family protein  35.29 
 
 		 331 aa  56.6  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  24.24 
 
 		 387 aa  56.6  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  22.34 
 
 		 387 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  24.47 
 
 		 392 aa  56.2  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1695  phage integrase family protein  28.82 
 
 		 296 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.363626  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3921  phage integrase family protein  22.37 
 
 		 327 aa  55.5  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470105  hitchhiker  0.00183347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>