More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0926 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 
354 aa  713    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  30.81 
 
 
369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1885  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  30.56 
 
 
356 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  30.17 
 
 
369 aa  126  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  29.24 
 
 
369 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  27.67 
 
 
381 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  28.72 
 
 
390 aa  116  6e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.69 
 
 
374 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.69 
 
 
374 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  27.35 
 
 
373 aa  113  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  25 
 
 
371 aa  112  8.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  27.81 
 
 
376 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  25.96 
 
 
391 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  26.32 
 
 
370 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  29.23 
 
 
325 aa  104  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  28.32 
 
 
391 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.1 
 
 
376 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.1 
 
 
376 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  25.79 
 
 
386 aa  100  4e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  25.09 
 
 
477 aa  99.8  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  25.67 
 
 
378 aa  96.7  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2723  integrase family protein  30.03 
 
 
313 aa  95.9  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  25.99 
 
 
414 aa  95.9  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  27.86 
 
 
379 aa  94.4  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  26.23 
 
 
392 aa  94.4  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  23.94 
 
 
385 aa  94  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  27.79 
 
 
381 aa  93.2  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03170  site-specific recombinase XerD  27.7 
 
 
307 aa  92.4  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000220198 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  28.15 
 
 
392 aa  92  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3952  integrase family protein  30.58 
 
 
310 aa  91.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  26.56 
 
 
385 aa  91.3  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  27.98 
 
 
376 aa  90.9  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  24.63 
 
 
387 aa  90.9  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  27.52 
 
 
381 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  24.59 
 
 
395 aa  90.5  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  26.1 
 
 
388 aa  90.1  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  25.88 
 
 
368 aa  89.4  9e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  26.99 
 
 
384 aa  89  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  25.56 
 
 
379 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  25.56 
 
 
379 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  27.09 
 
 
353 aa  88.2  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  26.39 
 
 
370 aa  88.6  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  27.13 
 
 
383 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0926  integrase family protein  25.19 
 
 
438 aa  88.6  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1956  Integrase  29.12 
 
 
312 aa  87.4  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  22.85 
 
 
404 aa  87  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  26.52 
 
 
389 aa  87  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0555  phage integrase  30 
 
 
308 aa  86.7  6e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0470289  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  26.65 
 
 
423 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  26 
 
 
435 aa  84.7  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1993  phage integrase family site specific recombinase  28.57 
 
 
373 aa  84.7  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  27.84 
 
 
383 aa  85.1  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  23.94 
 
 
359 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1462  Phage integrase  25.48 
 
 
387 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3350  integrase  32.94 
 
 
308 aa  84.3  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00359362  decreased coverage  0.00980373 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  26.72 
 
 
380 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  24.59 
 
 
377 aa  83.6  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1386  integrase family protein  30.2 
 
 
344 aa  83.6  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.114707  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  23.19 
 
 
368 aa  83.6  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0864  phage integrase family protein  27.22 
 
 
349 aa  82.8  0.000000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0352184  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0848  phage integrase family protein  27.22 
 
 
349 aa  82.8  0.000000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  31.49 
 
 
390 aa  82.8  0.000000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  25.96 
 
 
367 aa  82  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  22.55 
 
 
377 aa  81.6  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  27.61 
 
 
381 aa  81.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  25.07 
 
 
367 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3933  integrase family protein  28.18 
 
 
344 aa  80.9  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00343242  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  22.89 
 
 
363 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  22.43 
 
 
416 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  23.91 
 
 
391 aa  80.5  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  26.15 
 
 
454 aa  80.5  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  24.76 
 
 
392 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  23.96 
 
 
400 aa  79  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  30.53 
 
 
378 aa  79  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  22.22 
 
 
383 aa  79  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  25.36 
 
 
386 aa  78.2  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  25.83 
 
 
443 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  28.12 
 
 
506 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0776  phage integrase  26.59 
 
 
334 aa  78.6  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.0322595 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  25.14 
 
 
387 aa  77.8  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  23.28 
 
 
347 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  23.12 
 
 
351 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1096  integrase  28.53 
 
 
374 aa  77.4  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.077251  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  23.28 
 
 
347 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  27.65 
 
 
376 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913824  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  24.76 
 
 
392 aa  77  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  28.25 
 
 
284 aa  76.6  0.0000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  24.57 
 
 
365 aa  76.6  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  22.96 
 
 
357 aa  76.6  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  27.21 
 
 
393 aa  76.3  0.0000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  26.05 
 
 
388 aa  76.3  0.0000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19160  site-specific recombinase XerD  23.34 
 
 
356 aa  75.5  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  0.148917 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1417  integrase  25.32 
 
 
415 aa  75.9  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.542507  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4520  phage integrase family protein  25.75 
 
 
400 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167996  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1986  phage integrase family site specific recombinase  25.14 
 
 
375 aa  75.1  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  25.79 
 
 
337 aa  74.7  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  25.66 
 
 
338 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  25.48 
 
 
407 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1691  phage integrase family protein  25.38 
 
 
402 aa  74.3  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1932  integrase/recombinase, phage associated  24.93 
 
 
379 aa  74.3  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.706433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>