More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1179 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  100 
 
 
387 aa  790    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  39.44 
 
 
363 aa  265  1e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  36.67 
 
 
390 aa  252  7e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  39.07 
 
 
379 aa  248  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  36.36 
 
 
378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  35.73 
 
 
374 aa  227  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  35.73 
 
 
374 aa  227  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  31.5 
 
 
369 aa  224  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  31.23 
 
 
369 aa  223  6e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  38.75 
 
 
414 aa  221  9.999999999999999e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  32.81 
 
 
369 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  33.94 
 
 
370 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  36.14 
 
 
368 aa  216  4e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  33.92 
 
 
400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  34.04 
 
 
381 aa  212  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  35.08 
 
 
357 aa  209  6e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  37.63 
 
 
377 aa  207  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  33.61 
 
 
383 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  33.16 
 
 
391 aa  206  6e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  35.93 
 
 
374 aa  205  9e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  34.38 
 
 
370 aa  205  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  33.16 
 
 
477 aa  199  9e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  33.76 
 
 
386 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  34.57 
 
 
422 aa  196  5.000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  33.85 
 
 
377 aa  196  6e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  36.14 
 
 
378 aa  196  8.000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  34.48 
 
 
422 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  32.24 
 
 
392 aa  194  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  32.69 
 
 
389 aa  194  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  32.69 
 
 
373 aa  191  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  31.08 
 
 
388 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  34.11 
 
 
383 aa  188  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  33.52 
 
 
463 aa  187  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  35.17 
 
 
385 aa  188  2e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  33.44 
 
 
325 aa  187  4e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  32.8 
 
 
431 aa  179  7e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  32.49 
 
 
404 aa  178  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  34.41 
 
 
402 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  34.49 
 
 
416 aa  177  3e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  31.87 
 
 
435 aa  176  6e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  33.81 
 
 
409 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  29.46 
 
 
413 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  30.2 
 
 
442 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  33.16 
 
 
379 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  33.16 
 
 
379 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  34.81 
 
 
305 aa  171  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  30 
 
 
392 aa  171  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  30.85 
 
 
393 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  35.21 
 
 
391 aa  168  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  28.62 
 
 
378 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6718  integrase family protein  31.12 
 
 
656 aa  151  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  29.41 
 
 
371 aa  149  7e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  29.81 
 
 
391 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6721  integrase family protein  29.23 
 
 
494 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.917048  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  33.33 
 
 
487 aa  143  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0172  integrase family protein  28.71 
 
 
437 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398776  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  29.51 
 
 
426 aa  139  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  28.99 
 
 
384 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  30.93 
 
 
403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0644  integrase family protein  28.22 
 
 
406 aa  136  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  29.02 
 
 
416 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  28.57 
 
 
367 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8572  DNA binding domain protein, excisionase family  27.41 
 
 
507 aa  133  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167813  normal  0.0589685 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  27.57 
 
 
506 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  31.22 
 
 
385 aa  132  7.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  28.28 
 
 
370 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  34.29 
 
 
471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  34.29 
 
 
471 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.94 
 
 
376 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.94 
 
 
376 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  27.74 
 
 
381 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  27.42 
 
 
381 aa  127  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  27.35 
 
 
376 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  27.11 
 
 
443 aa  126  6e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3446  integrase family protein  29.18 
 
 
492 aa  125  9e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3464  integrase family protein  30.41 
 
 
377 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  28.25 
 
 
387 aa  124  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  26.27 
 
 
376 aa  123  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  27.89 
 
 
451 aa  119  9e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0407  phage integrase  26.61 
 
 
503 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  28.45 
 
 
376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2505  integrase family protein  36.79 
 
 
201 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.355532 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4274  phage integrase  27.32 
 
 
407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  26 
 
 
386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  25.45 
 
 
398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3350  phage integrase  27.59 
 
 
508 aa  108  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.292325  normal  0.0949526 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3388  phage integrase  27.59 
 
 
508 aa  108  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0424  phage integrase  26.24 
 
 
374 aa  105  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.743387  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  30.42 
 
 
365 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0993  phage integrase family protein  43.36 
 
 
121 aa  104  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  30.97 
 
 
397 aa  103  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  26.04 
 
 
393 aa  102  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  24.06 
 
 
376 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913824  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  27.49 
 
 
393 aa  101  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  25.3 
 
 
388 aa  101  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7037  hypothetical protein  26.39 
 
 
387 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  31.72 
 
 
209 aa  99.8  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2625  phage integrase family protein  24.87 
 
 
409 aa  99.8  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0300817  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0939  integrase family protein  26.82 
 
 
357 aa  98.2  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0828563 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03080  site-specific recombinase XerC  27.53 
 
 
381 aa  97.1  4e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0299404  hitchhiker  1.02879e-24 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>