More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2786 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  100 
 
 
471 aa  942    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  99.36 
 
 
471 aa  937    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3269  phage integrase family protein  43.38 
 
 
465 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3437  integrase family protein  42.51 
 
 
458 aa  299  7e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494815  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  36.86 
 
 
377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  35.02 
 
 
369 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  34.6 
 
 
369 aa  156  8e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  34.18 
 
 
369 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  38.58 
 
 
305 aa  155  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  39.33 
 
 
477 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  33.08 
 
 
325 aa  147  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  36.18 
 
 
390 aa  147  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  38.1 
 
 
379 aa  147  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  34.13 
 
 
392 aa  146  9e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  38.79 
 
 
377 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  35.47 
 
 
378 aa  140  7e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  32.08 
 
 
374 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  32.08 
 
 
374 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  36.67 
 
 
414 aa  135  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  29.15 
 
 
442 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  32.3 
 
 
400 aa  132  9e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  38.68 
 
 
379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  38.68 
 
 
379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  34.29 
 
 
387 aa  132  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  34.91 
 
 
363 aa  131  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  32.23 
 
 
391 aa  130  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  28.8 
 
 
393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  33.63 
 
 
370 aa  128  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  28.03 
 
 
463 aa  127  5e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  32.79 
 
 
386 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  35.6 
 
 
385 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  33.77 
 
 
431 aa  119  7.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  29.5 
 
 
378 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  31.6 
 
 
381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  26.61 
 
 
506 aa  117  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  32.19 
 
 
368 aa  116  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  27.24 
 
 
389 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  35.34 
 
 
422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  31.36 
 
 
370 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  29.5 
 
 
413 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  35.65 
 
 
487 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  34.45 
 
 
404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  35.34 
 
 
402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  34.65 
 
 
383 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  29.79 
 
 
435 aa  111  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  35.78 
 
 
422 aa  111  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  32.36 
 
 
391 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  31.36 
 
 
388 aa  110  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6718  integrase family protein  28.12 
 
 
656 aa  110  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  32.47 
 
 
383 aa  110  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  28.64 
 
 
403 aa  109  9.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  33.86 
 
 
426 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4274  phage integrase  33.04 
 
 
407 aa  107  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  32.4 
 
 
416 aa  107  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  35.91 
 
 
409 aa  107  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  30.77 
 
 
378 aa  106  9e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  34.91 
 
 
371 aa  106  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  26.41 
 
 
373 aa  104  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  29.1 
 
 
392 aa  103  8e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  28.27 
 
 
416 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  34.17 
 
 
376 aa  100  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  28.77 
 
 
370 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0644  integrase family protein  33.47 
 
 
406 aa  96.7  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  26.4 
 
 
376 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6721  integrase family protein  31.71 
 
 
494 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.917048  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  27.2 
 
 
376 aa  94.4  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.83 
 
 
376 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.83 
 
 
376 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  28.14 
 
 
391 aa  90.9  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  27.85 
 
 
376 aa  90.5  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913824  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2625  phage integrase family protein  24.11 
 
 
409 aa  90.1  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0300817  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3464  integrase family protein  28.8 
 
 
377 aa  89.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0172  integrase family protein  31.88 
 
 
437 aa  89  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398776  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  25.42 
 
 
386 aa  87.8  4e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0878  phage integrase  35.76 
 
 
429 aa  87.4  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  26.77 
 
 
451 aa  86.7  8e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19160  site-specific recombinase XerD  30 
 
 
356 aa  86.7  9e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  0.148917 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  27.2 
 
 
393 aa  86.3  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  26.12 
 
 
385 aa  85.9  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2505  integrase family protein  36.18 
 
 
201 aa  85.9  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.355532 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3446  integrase family protein  35.56 
 
 
492 aa  84.3  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  26.81 
 
 
393 aa  84.3  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0407  phage integrase  30.37 
 
 
503 aa  84  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  26.52 
 
 
367 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  28.74 
 
 
393 aa  82  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  28.2 
 
 
387 aa  81.6  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  29.08 
 
 
454 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  26.33 
 
 
443 aa  80.5  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8572  DNA binding domain protein, excisionase family  30.45 
 
 
507 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167813  normal  0.0589685 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  30.63 
 
 
381 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0121  integrase family protein  29.07 
 
 
422 aa  78.2  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534504  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  30 
 
 
381 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  32.02 
 
 
357 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0424  phage integrase  28 
 
 
374 aa  77.8  0.0000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.743387  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  25.94 
 
 
398 aa  77.8  0.0000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  31.49 
 
 
374 aa  77  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  30 
 
 
209 aa  77  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0926  integrase family protein  33.33 
 
 
438 aa  76.6  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1885  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  26.55 
 
 
356 aa  74.7  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03080  site-specific recombinase XerC  28.33 
 
 
381 aa  74.7  0.000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0299404  hitchhiker  1.02879e-24 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>