More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0883 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 
435 aa  905    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  46.49 
 
 
385 aa  355  1e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  44.44 
 
 
368 aa  328  9e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  42.11 
 
 
386 aa  300  3e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  38.36 
 
 
383 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  38.22 
 
 
390 aa  265  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  37.63 
 
 
370 aa  256  5e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  37.86 
 
 
381 aa  252  9.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  37.7 
 
 
374 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  37.7 
 
 
374 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  36.15 
 
 
369 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  35.53 
 
 
369 aa  237  4e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  36.55 
 
 
373 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  35.36 
 
 
369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  37.76 
 
 
383 aa  232  8.000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  33.59 
 
 
378 aa  227  3e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  34.96 
 
 
392 aa  215  9.999999999999999e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  34.46 
 
 
370 aa  208  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  36.34 
 
 
377 aa  203  5e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  32.29 
 
 
379 aa  202  8e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  35.06 
 
 
414 aa  201  3e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  33.24 
 
 
378 aa  196  7e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  31.7 
 
 
400 aa  194  4e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  30.65 
 
 
389 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  31.36 
 
 
392 aa  191  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  36.91 
 
 
305 aa  191  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  32.73 
 
 
363 aa  188  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  33.76 
 
 
370 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  33.77 
 
 
477 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  31.89 
 
 
391 aa  186  6e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  35.49 
 
 
325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  32.97 
 
 
391 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  33.16 
 
 
377 aa  182  8.000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  33 
 
 
426 aa  182  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  30.32 
 
 
463 aa  177  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  31.87 
 
 
387 aa  176  7e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  31.42 
 
 
413 aa  176  8e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  31.66 
 
 
381 aa  167  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  30.87 
 
 
381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  32.43 
 
 
391 aa  162  9e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  28.42 
 
 
376 aa  162  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  32.07 
 
 
388 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  30.4 
 
 
409 aa  159  8e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  30.52 
 
 
403 aa  157  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  30.73 
 
 
404 aa  155  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  28.34 
 
 
443 aa  154  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  28.82 
 
 
451 aa  152  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  31.7 
 
 
357 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  28.18 
 
 
422 aa  142  8e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  29.06 
 
 
402 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  27.37 
 
 
371 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  31.94 
 
 
506 aa  139  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  27.49 
 
 
431 aa  138  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  28.46 
 
 
374 aa  137  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  25.93 
 
 
443 aa  136  9e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  27.81 
 
 
386 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  29.69 
 
 
378 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  27.86 
 
 
422 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  32.72 
 
 
487 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  24.94 
 
 
442 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  28.33 
 
 
384 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  39.36 
 
 
209 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  28.53 
 
 
379 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  28.53 
 
 
379 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  25.74 
 
 
416 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0644  integrase family protein  25.71 
 
 
406 aa  127  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  28.46 
 
 
398 aa  124  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.79 
 
 
376 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.79 
 
 
376 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  30.46 
 
 
388 aa  124  4e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  29.17 
 
 
393 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  29.2 
 
 
365 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  31.49 
 
 
385 aa  120  6e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  26.53 
 
 
376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  27.3 
 
 
367 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  27.85 
 
 
387 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  26.94 
 
 
376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913824  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  29.49 
 
 
416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  24.34 
 
 
376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  26.45 
 
 
423 aa  113  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  26.46 
 
 
393 aa  113  7.000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  26.01 
 
 
454 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  29.79 
 
 
471 aa  111  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  26.78 
 
 
407 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  29.79 
 
 
471 aa  110  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  30.16 
 
 
397 aa  110  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1096  integrase  27.59 
 
 
374 aa  109  7.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.077251  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  28.13 
 
 
362 aa  109  9.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0424  phage integrase  26.2 
 
 
374 aa  108  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.743387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2337  hypothetical protein  58.24 
 
 
120 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2157  hypothetical protein  58.24 
 
 
120 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00218836  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2095  phage integrase  58.24 
 
 
120 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000441723  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2312  hypothetical protein  58.24 
 
 
120 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.430324  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  28.89 
 
 
387 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  24.75 
 
 
393 aa  107  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03080  site-specific recombinase XerC  24.16 
 
 
381 aa  105  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0299404  hitchhiker  1.02879e-24 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0878  phage integrase  31.2 
 
 
429 aa  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  22.54 
 
 
383 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  26.43 
 
 
407 aa  103  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6721  integrase family protein  26.38 
 
 
494 aa  103  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.917048  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>