More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2783 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  100 
 
 
367 aa  743    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  32.57 
 
 
370 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  31.79 
 
 
370 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  33.14 
 
 
378 aa  152  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  33.97 
 
 
377 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  33.24 
 
 
390 aa  150  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  32.53 
 
 
379 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  33.04 
 
 
374 aa  142  7e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  33.04 
 
 
374 aa  142  7e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  29.86 
 
 
369 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  30.53 
 
 
391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  33.45 
 
 
325 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  29.89 
 
 
369 aa  139  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  29.83 
 
 
414 aa  139  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  29.74 
 
 
391 aa  138  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  29.6 
 
 
369 aa  138  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  29.35 
 
 
363 aa  138  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  31.63 
 
 
378 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  31.09 
 
 
381 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  29.48 
 
 
400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  29.68 
 
 
383 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  28.57 
 
 
387 aa  134  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  29.11 
 
 
413 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  29.7 
 
 
385 aa  132  9e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  29.23 
 
 
386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  26.13 
 
 
388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  26.33 
 
 
389 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  31.97 
 
 
381 aa  127  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  33.46 
 
 
379 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  33.46 
 
 
379 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  29.19 
 
 
374 aa  127  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1885  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  27.07 
 
 
356 aa  126  5e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  31.61 
 
 
381 aa  126  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1096  integrase  31.21 
 
 
374 aa  126  6e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.077251  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  29.06 
 
 
368 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  26.65 
 
 
387 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  30.56 
 
 
377 aa  123  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  28.78 
 
 
373 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  30.9 
 
 
383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2625  phage integrase family protein  26.82 
 
 
409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0300817  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  29.33 
 
 
385 aa  120  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  27.3 
 
 
435 aa  118  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  28.38 
 
 
391 aa  118  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  30.7 
 
 
409 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  30.72 
 
 
416 aa  117  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  27.44 
 
 
487 aa  116  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  29.24 
 
 
378 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  27.15 
 
 
388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  28.61 
 
 
392 aa  108  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.21 
 
 
376 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.21 
 
 
376 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  26.02 
 
 
392 aa  108  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  27.15 
 
 
477 aa  106  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  27.65 
 
 
376 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  28.92 
 
 
404 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  27.47 
 
 
403 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  25.66 
 
 
463 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1986  phage integrase family site specific recombinase  26.29 
 
 
375 aa  103  4e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  26.9 
 
 
423 aa  103  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  28.71 
 
 
386 aa  103  5e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  26.42 
 
 
362 aa  101  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3952  integrase family protein  30.72 
 
 
310 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2060  phage integrase family protein  26.38 
 
 
345 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00257719  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0555  phage integrase  29.74 
 
 
308 aa  100  4e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0470289  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2097  phage integrase family protein  26.38 
 
 
345 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0806496  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  28.79 
 
 
506 aa  99.8  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  34.22 
 
 
209 aa  99.4  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  24.02 
 
 
384 aa  99.4  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2723  integrase family protein  30.03 
 
 
313 aa  99  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  23.78 
 
 
451 aa  99  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  25.5 
 
 
357 aa  99  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  25.15 
 
 
370 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  23.37 
 
 
393 aa  98.6  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  26.29 
 
 
416 aa  97.1  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03170  site-specific recombinase XerD  30.29 
 
 
307 aa  95.5  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000220198 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  25.66 
 
 
376 aa  94  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  28 
 
 
305 aa  94.4  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1932  integrase/recombinase, phage associated  24.93 
 
 
379 aa  92.4  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.706433  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1956  Integrase  28.52 
 
 
312 aa  92.4  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  27.57 
 
 
295 aa  91.3  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  27.57 
 
 
295 aa  91.3  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  28.62 
 
 
454 aa  90.9  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  22.55 
 
 
393 aa  90.1  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  24.44 
 
 
376 aa  90.1  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913824  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  30.19 
 
 
398 aa  89.7  7e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0864  phage integrase family protein  25.76 
 
 
349 aa  89  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0352184  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0848  phage integrase family protein  25.76 
 
 
349 aa  89  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0058  phage integrase family protein  24.8 
 
 
395 aa  88.6  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251229  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2505  integrase family protein  33.15 
 
 
201 aa  89.4  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.355532 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  26.1 
 
 
392 aa  88.2  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  24.94 
 
 
443 aa  88.2  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1247  phage integrase family site specific recombinase  24.56 
 
 
399 aa  86.7  5e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.357571  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  29.34 
 
 
353 aa  86.7  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19160  site-specific recombinase XerD  23.66 
 
 
356 aa  85.5  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  0.148917 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  27.09 
 
 
295 aa  84.7  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  29.2 
 
 
431 aa  84  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  26.52 
 
 
471 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0172  integrase family protein  26.79 
 
 
437 aa  83.6  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398776  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  25.56 
 
 
376 aa  83.6  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  26.52 
 
 
471 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.522283 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>