More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0709 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  100 
 
 
386 aa  806    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  32.13 
 
 
381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  32.1 
 
 
374 aa  186  9e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  32.1 
 
 
374 aa  186  9e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  31.19 
 
 
370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  31.54 
 
 
383 aa  167  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  30.93 
 
 
390 aa  163  5.0000000000000005e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  30 
 
 
373 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  30.08 
 
 
392 aa  155  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  28.99 
 
 
368 aa  155  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  28.76 
 
 
414 aa  152  7e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  29.12 
 
 
383 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  26.53 
 
 
385 aa  145  1e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  29.89 
 
 
369 aa  144  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  28.08 
 
 
379 aa  144  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  28.64 
 
 
370 aa  143  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  28.72 
 
 
386 aa  142  8e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  30.08 
 
 
369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  27.81 
 
 
435 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  31 
 
 
305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  26.86 
 
 
378 aa  133  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  28.21 
 
 
389 aa  133  6e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  27.6 
 
 
388 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  27.56 
 
 
391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  27.57 
 
 
392 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  29.26 
 
 
369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  28.92 
 
 
325 aa  130  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  30.35 
 
 
381 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  30.35 
 
 
381 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  26.08 
 
 
463 aa  127  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  25.89 
 
 
363 aa  127  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  26.3 
 
 
377 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  27.03 
 
 
377 aa  125  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  26.02 
 
 
400 aa  125  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  25.27 
 
 
477 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  25.46 
 
 
416 aa  121  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  27.97 
 
 
443 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  25.87 
 
 
409 aa  117  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  27.19 
 
 
391 aa  115  8.999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  24.72 
 
 
402 aa  113  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  26 
 
 
387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  27.18 
 
 
403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  23.74 
 
 
422 aa  109  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  24.62 
 
 
378 aa  109  7.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  38.89 
 
 
209 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  24.35 
 
 
378 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  25.51 
 
 
376 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  25.55 
 
 
451 aa  106  6e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.74 
 
 
376 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.74 
 
 
376 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  23.46 
 
 
422 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  25.34 
 
 
413 aa  104  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  26.25 
 
 
376 aa  104  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  28.71 
 
 
367 aa  103  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  36.2 
 
 
393 aa  103  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  35.93 
 
 
442 aa  103  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  27.51 
 
 
388 aa  102  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  26.05 
 
 
391 aa  100  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  25.79 
 
 
354 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  26.03 
 
 
376 aa  99.8  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1096  integrase  28.53 
 
 
374 aa  99.8  7e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.077251  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  27.63 
 
 
393 aa  98.2  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  26.18 
 
 
370 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  23.9 
 
 
426 aa  97.1  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  28.46 
 
 
506 aa  96.7  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  24.07 
 
 
404 aa  94.7  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  24.35 
 
 
379 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  25.79 
 
 
454 aa  94.4  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  24.35 
 
 
379 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  25 
 
 
387 aa  94  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3446  integrase family protein  32.04 
 
 
492 aa  93.2  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  23.06 
 
 
416 aa  91.7  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  24.32 
 
 
443 aa  90.1  5e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  29.05 
 
 
431 aa  89.7  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  25.76 
 
 
471 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3464  integrase family protein  34.3 
 
 
377 aa  88.2  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  23.86 
 
 
357 aa  87.8  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15860  site-specific recombinase XerD  22.39 
 
 
398 aa  87.4  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0008266  hitchhiker  0.0000733221 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  25.42 
 
 
471 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  30.85 
 
 
487 aa  87.4  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1691  phage integrase family protein  27.94 
 
 
402 aa  86.7  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08320  site-specific recombinase XerD  31.09 
 
 
460 aa  86.7  6e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6721  integrase family protein  24.31 
 
 
494 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.917048  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0926  integrase family protein  25.78 
 
 
438 aa  85.5  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  25.64 
 
 
404 aa  85.9  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  24.17 
 
 
398 aa  85.5  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4540  transposase A  34.88 
 
 
361 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1039  phage integrase family protein  26.04 
 
 
401 aa  85.1  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.1908  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3350  integrase  32.78 
 
 
308 aa  85.1  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00359362  decreased coverage  0.00980373 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  26.26 
 
 
378 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1020  phage integrase family protein  26.04 
 
 
401 aa  85.1  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.085573  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0058  phage integrase family protein  23.72 
 
 
395 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251229  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  24.35 
 
 
393 aa  81.6  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0172  integrase family protein  23.94 
 
 
437 aa  80.5  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398776  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0304  phage integrase family protein  24.15 
 
 
401 aa  80.9  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0311  phage integrase family protein  24.15 
 
 
401 aa  80.9  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6718  integrase family protein  24.4 
 
 
656 aa  80.9  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  21.66 
 
 
380 aa  79.7  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2505  integrase family protein  29.84 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.355532 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  22.68 
 
 
423 aa  79  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>