More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0604 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  100 
 
 
404 aa  818    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0121  integrase family protein  41.33 
 
 
422 aa  283  5.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534504  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2073  integrase family protein  36.58 
 
 
451 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.087873  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  35.73 
 
 
378 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  32.12 
 
 
395 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0924  integrase family protein  34.22 
 
 
399 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2927  phage integrase family protein  31.62 
 
 
391 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6364  integrase family protein  32.22 
 
 
398 aa  171  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  32.13 
 
 
383 aa  157  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  32.15 
 
 
394 aa  144  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0563  phage integrase family protein  30.94 
 
 
361 aa  138  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  32 
 
 
365 aa  133  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  28.75 
 
 
407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4828  phage integrase  30.89 
 
 
433 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281268  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  30.96 
 
 
368 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  27.57 
 
 
390 aa  122  9e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  29.51 
 
 
397 aa  122  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  29.75 
 
 
370 aa  122  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.9 
 
 
374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.9 
 
 
374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4448  phage integrase family protein  28.09 
 
 
424 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322677  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0058  phage integrase family protein  30.03 
 
 
395 aa  116  7.999999999999999e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251229  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  29.82 
 
 
391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  24.6 
 
 
381 aa  113  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  27.86 
 
 
363 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  29.36 
 
 
414 aa  113  8.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1419  integrase family protein  27.97 
 
 
390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.447287  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  26.19 
 
 
400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  27.87 
 
 
370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  27.22 
 
 
389 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  25.71 
 
 
383 aa  106  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  30.61 
 
 
377 aa  105  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  24.16 
 
 
392 aa  104  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  24.64 
 
 
369 aa  104  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  26.59 
 
 
370 aa  104  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0014  integrase family protein  30.89 
 
 
367 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  28.09 
 
 
378 aa  103  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  25 
 
 
369 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  24.59 
 
 
391 aa  103  8e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  26.68 
 
 
379 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23910  site-specific recombinase XerD  28.02 
 
 
402 aa  102  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.075478  normal  0.15395 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  24.64 
 
 
369 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  27.88 
 
 
380 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  25 
 
 
325 aa  102  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  27.67 
 
 
384 aa  99  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  27.03 
 
 
378 aa  98.2  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  27.49 
 
 
377 aa  97.4  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  26.11 
 
 
368 aa  97.1  5e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  27.65 
 
 
387 aa  96.3  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  24.07 
 
 
386 aa  94.7  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  27.65 
 
 
379 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  27.65 
 
 
379 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  25.37 
 
 
407 aa  94  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  28.89 
 
 
357 aa  94  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  22.96 
 
 
393 aa  94.4  4e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  25.58 
 
 
451 aa  93.6  5e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0039  integrase family protein  25.37 
 
 
451 aa  92.8  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  26.73 
 
 
305 aa  92.4  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.42 
 
 
376 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5293  integrase family protein  29.77 
 
 
399 aa  91.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.42 
 
 
376 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  26.86 
 
 
383 aa  91.3  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  28.25 
 
 
391 aa  90.5  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  25.78 
 
 
385 aa  89  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  23.08 
 
 
392 aa  88.2  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  26.78 
 
 
387 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  27.18 
 
 
477 aa  87  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  22.85 
 
 
354 aa  87  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  24.12 
 
 
376 aa  87  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913824  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  22.35 
 
 
388 aa  86.3  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  24.26 
 
 
435 aa  85.5  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  26.74 
 
 
370 aa  84.7  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  22.89 
 
 
381 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2218  phage integrase family protein  27.08 
 
 
388 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  23.87 
 
 
376 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3499  integrase family protein  28.37 
 
 
368 aa  83.6  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000340769  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  25.14 
 
 
386 aa  83.2  0.000000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  27.5 
 
 
404 aa  83.2  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  28.52 
 
 
454 aa  82.8  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2508  phage integrase family protein  30.63 
 
 
385 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3323  integrase family protein  28.04 
 
 
373 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0882  phage integrase family protein  26.62 
 
 
414 aa  81.6  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.520245  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  25.22 
 
 
367 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  23.84 
 
 
398 aa  81.6  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  23.18 
 
 
381 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  21.66 
 
 
376 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  20.11 
 
 
413 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  26.01 
 
 
463 aa  77.8  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  21.23 
 
 
373 aa  77.4  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2060  hypothetical protein  53.95 
 
 
115 aa  77  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.352695  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0915  Tn916, transposase  24.38 
 
 
405 aa  76.6  0.0000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12675  phiRv2 prophage integrase  28.98 
 
 
375 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000114455  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2465  putative pore-forming cytotoxin integrase  24.57 
 
 
381 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.135007 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  25.2 
 
 
402 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  27.78 
 
 
396 aa  75.1  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  22.8 
 
 
391 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  26.49 
 
 
403 aa  75.1  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  26.33 
 
 
416 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  23.66 
 
 
376 aa  74.3  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1885  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  22.86 
 
 
356 aa  73.9  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>