More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6303 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  100 
 
 
416 aa  853    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  35.73 
 
 
477 aa  234  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  33.25 
 
 
400 aa  202  9e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  31.61 
 
 
390 aa  195  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  35.56 
 
 
377 aa  195  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  34.12 
 
 
379 aa  193  6e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  34.06 
 
 
363 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  33.49 
 
 
422 aa  180  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  33.94 
 
 
377 aa  180  4.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  32.79 
 
 
378 aa  179  5.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  32.39 
 
 
414 aa  177  4e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  30.13 
 
 
392 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  32.72 
 
 
431 aa  171  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  29.2 
 
 
391 aa  169  7e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  33.86 
 
 
379 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  33.86 
 
 
379 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  32.24 
 
 
422 aa  167  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  30.7 
 
 
426 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  31.66 
 
 
371 aa  162  9e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.82 
 
 
374 aa  160  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.82 
 
 
374 aa  160  6e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4274  phage integrase  30.83 
 
 
407 aa  157  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  29.84 
 
 
381 aa  156  7e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  30.55 
 
 
325 aa  152  8e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  32.8 
 
 
402 aa  151  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0172  integrase family protein  30.22 
 
 
437 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398776  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  29.67 
 
 
383 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  29.8 
 
 
416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  29.95 
 
 
463 aa  147  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  29.41 
 
 
305 aa  144  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  30.49 
 
 
378 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0407  phage integrase  29.89 
 
 
503 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  26.81 
 
 
370 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  31.95 
 
 
357 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  31.11 
 
 
386 aa  139  1e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7037  hypothetical protein  27.74 
 
 
387 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  24.73 
 
 
369 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  29.02 
 
 
387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  32.37 
 
 
374 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  24.73 
 
 
369 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  27.18 
 
 
381 aa  134  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  27.18 
 
 
381 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  30.19 
 
 
368 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  31.03 
 
 
404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  28.84 
 
 
389 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  25.74 
 
 
435 aa  127  3e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  25.96 
 
 
369 aa  127  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0644  integrase family protein  30.36 
 
 
406 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  26.26 
 
 
370 aa  124  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6718  integrase family protein  29.15 
 
 
656 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  25.46 
 
 
386 aa  121  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  25.21 
 
 
373 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6721  integrase family protein  29.78 
 
 
494 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.917048  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  29.19 
 
 
385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.63 
 
 
376 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.63 
 
 
376 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  30.72 
 
 
367 aa  117  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  25.88 
 
 
376 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  25.33 
 
 
392 aa  114  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  28.21 
 
 
487 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  29.28 
 
 
383 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  26.95 
 
 
376 aa  113  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  29.36 
 
 
506 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  24.81 
 
 
423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  30.64 
 
 
387 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  31.56 
 
 
378 aa  110  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8572  DNA binding domain protein, excisionase family  26.28 
 
 
507 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167813  normal  0.0589685 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  28.75 
 
 
370 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  25.06 
 
 
388 aa  108  3e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  29.53 
 
 
409 aa  107  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  26.34 
 
 
443 aa  107  6e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  26.39 
 
 
384 aa  105  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3350  integrase  25.09 
 
 
308 aa  102  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00359362  decreased coverage  0.00980373 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  28.52 
 
 
471 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  27.81 
 
 
376 aa  100  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0768  integrase family protein  30.14 
 
 
397 aa  100  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1451  integrase family protein  29.93 
 
 
371 aa  100  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  28.19 
 
 
471 aa  100  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  27.68 
 
 
391 aa  100  6e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  23.77 
 
 
388 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  27.94 
 
 
209 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3464  integrase family protein  27.99 
 
 
377 aa  97.8  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  31.27 
 
 
365 aa  97.1  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2625  phage integrase family protein  25.77 
 
 
409 aa  96.3  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0300817  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1294  integrase family protein  28.18 
 
 
393 aa  96.3  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3350  phage integrase  26.39 
 
 
508 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.292325  normal  0.0949526 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3388  phage integrase  26.39 
 
 
508 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1118  integrase family protein  30.1 
 
 
384 aa  94.4  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.868732  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  29.08 
 
 
403 aa  94.4  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  28.61 
 
 
385 aa  94.4  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  30.36 
 
 
407 aa  93.2  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  22.97 
 
 
451 aa  92.4  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  30.56 
 
 
397 aa  92  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  25.89 
 
 
376 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  24.7 
 
 
413 aa  90.9  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3446  integrase family protein  26.88 
 
 
492 aa  90.5  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3499  integrase family protein  30.4 
 
 
368 aa  90.1  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000340769  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1419  integrase family protein  32.75 
 
 
390 aa  89  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.447287  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  31.03 
 
 
370 aa  89.4  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0926  integrase family protein  29.66 
 
 
438 aa  89  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>