More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1133 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  100 
 
 
454 aa  934    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  34.34 
 
 
365 aa  127  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  29.97 
 
 
325 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  29.53 
 
 
390 aa  119  7.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  30.53 
 
 
393 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  28.73 
 
 
377 aa  114  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  26.4 
 
 
381 aa  114  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  28.44 
 
 
384 aa  113  8.000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  26.01 
 
 
435 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  26.61 
 
 
369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  26.33 
 
 
369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  28.27 
 
 
370 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  26.98 
 
 
398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  29.84 
 
 
368 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  27.96 
 
 
400 aa  107  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  27.65 
 
 
363 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  28.27 
 
 
378 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  28.53 
 
 
386 aa  104  4e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  30.77 
 
 
379 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  30.77 
 
 
379 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  29.14 
 
 
397 aa  103  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  27.9 
 
 
370 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  26.84 
 
 
388 aa  102  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  31.5 
 
 
471 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  26.61 
 
 
378 aa  102  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  27.53 
 
 
392 aa  102  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  28.23 
 
 
377 aa  101  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  24.65 
 
 
369 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  27.6 
 
 
376 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  27.6 
 
 
376 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3350  integrase  26.19 
 
 
308 aa  100  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00359362  decreased coverage  0.00980373 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  27 
 
 
379 aa  99.8  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  26.14 
 
 
391 aa  99.4  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  27.48 
 
 
393 aa  99  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  28.57 
 
 
391 aa  97.8  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  27.15 
 
 
362 aa  97.4  5e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  26.91 
 
 
443 aa  97.1  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  27.34 
 
 
376 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  27.33 
 
 
374 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  26.8 
 
 
411 aa  95.9  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  27.33 
 
 
374 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  28.24 
 
 
357 aa  95.9  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  27.18 
 
 
435 aa  95.1  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  28.43 
 
 
414 aa  95.5  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  27.37 
 
 
385 aa  95.5  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  26.82 
 
 
392 aa  95.1  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  26.81 
 
 
371 aa  95.5  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  27.6 
 
 
376 aa  95.5  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  29.33 
 
 
477 aa  94.7  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  25.79 
 
 
386 aa  94.4  4e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  25.57 
 
 
305 aa  94.4  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  27.72 
 
 
383 aa  93.6  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  27.03 
 
 
397 aa  93.6  7e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  25.91 
 
 
392 aa  92.8  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  27.33 
 
 
393 aa  92.4  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  26.3 
 
 
404 aa  91.7  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  25.93 
 
 
433 aa  91.7  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  24.11 
 
 
391 aa  91.3  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  25.55 
 
 
392 aa  91.3  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  28.62 
 
 
367 aa  90.9  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  28.78 
 
 
386 aa  90.1  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  28.02 
 
 
401 aa  90.1  7e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5293  integrase family protein  28.93 
 
 
399 aa  89.7  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  25.84 
 
 
373 aa  89.4  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  25.77 
 
 
380 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  26.13 
 
 
381 aa  88.6  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7037  hypothetical protein  25.23 
 
 
387 aa  88.2  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4275  phage integrase  24.65 
 
 
393 aa  87.8  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0146194  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23910  site-specific recombinase XerD  28.17 
 
 
402 aa  87.4  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.075478  normal  0.15395 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  27.3 
 
 
385 aa  87.4  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  23.42 
 
 
431 aa  87  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  25.54 
 
 
388 aa  87  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  27.01 
 
 
407 aa  87  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  25.17 
 
 
407 aa  87  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  28.06 
 
 
368 aa  86.7  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  25.77 
 
 
443 aa  85.9  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  26.19 
 
 
422 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  24 
 
 
414 aa  85.9  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2797  phage integrase family protein  28.3 
 
 
451 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  26.37 
 
 
416 aa  85.9  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  29.3 
 
 
378 aa  85.1  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  27.3 
 
 
394 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  28 
 
 
359 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  27.48 
 
 
370 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  25.16 
 
 
407 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  23.96 
 
 
391 aa  85.1  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  30.37 
 
 
370 aa  84.7  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  25.44 
 
 
381 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  26.92 
 
 
413 aa  85.1  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  28.77 
 
 
378 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  26.8 
 
 
392 aa  84.7  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  25.44 
 
 
423 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  27.21 
 
 
402 aa  84.3  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  26.03 
 
 
388 aa  84  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  26.41 
 
 
338 aa  84  0.000000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  30.47 
 
 
396 aa  83.6  0.000000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  25.96 
 
 
451 aa  83.2  0.000000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  26.82 
 
 
383 aa  82.8  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0653  integrase family protein  27.57 
 
 
282 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.319783  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  28.52 
 
 
404 aa  82.8  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>