58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4275 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4275  phage integrase  100 
 
 		 393 aa  818    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0146194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  24.65 
 
 		 454 aa  87.8  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  22.7 
 
 		 391 aa  69.7  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  24.15 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  29.41 
 
 		 386 aa  58.2  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  22.09 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  24.58 
 
 		 403 aa  54.7  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  21.61 
 
 		 392 aa  51.2  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  25.93 
 
 		 338 aa  50.8  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  24.81 
 
 		 377 aa  50.1  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  22.99 
 
 		 388 aa  49.7  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  23.91 
 
 		 400 aa  48.9  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  24.64 
 
 		 401 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1366  integrase family protein  33.33 
 
 		 447 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.571831 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  22.25 
 
 		 390 aa  48.1  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  27.68 
 
 		 431 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.31 
 
 		 298 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0524  integrase family protein  26.25 
 
 		 407 aa  48.9  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.236803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0746  phage integrase family protein  23.81 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  23.12 
 
 		 404 aa  47.8  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  24.79 
 
 		 404 aa  47  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  23.88 
 
 		 369 aa  47  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  23.84 
 
 		 435 aa  46.6  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  23.91 
 
 		 301 aa  46.6  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2147  phage integrase family protein  27.33 
 
 		 367 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3476  integrase family protein  29.75 
 
 		 174 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  24.14 
 
 		 477 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  23.46 
 
 		 369 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0042  phage integrase family protein  22.05 
 
 		 630 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1750  phage integrase family protein  22.05 
 
 		 630 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00214495  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1716  phage integrase family protein  22.05 
 
 		 630 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1346  Tn554, transposase B  22.05 
 
 		 630 aa  46.2  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2507  transposase B  22.05 
 
 		 630 aa  46.2  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1633  phage integrase  26.55 
 
 		 362 aa  45.8  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.4 
 
 		 298 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 392 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  29.48 
 
 		 378 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4448  phage integrase family protein  24.2 
 
 		 424 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322677  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1223  Tn554, transposase B  22.05 
 
 		 630 aa  46.2  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.559956  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0042  phage integrase family protein  22.05 
 
 		 630 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3923  hypothetical protein  26.38 
 
 		 403 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1749  integrase family protein  25.51 
 
 		 434 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000110171  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  21.02 
 
 		 374 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  21.02 
 
 		 374 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.27 
 
 		 298 aa  44.3  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  28.41 
 
 		 392 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  24.31 
 
 		 422 aa  43.9  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  26.83 
 
 		 370 aa  43.9  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  23.9 
 
 		 471 aa  43.9  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  25.98 
 
 		 414 aa  43.9  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  25.95 
 
 		 303 aa  43.9  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646575 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  24.31 
 
 		 402 aa  43.5  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.65 
 
 		 298 aa  43.5  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2073  integrase family protein  26.15 
 
 		 451 aa  43.5  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.087873  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  25.19 
 
 		 391 aa  43.5  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  25.08 
 
 		 311 aa  43.5  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  21.79 
 
 		 368 aa  43.1  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  23.31 
 
 		 398 aa  43.1  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>