92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_3923 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3923  hypothetical protein  100 
 
 
403 aa  818    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4219  phage integrase family protein  47.7 
 
 
463 aa  280  4e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  27.36 
 
 
414 aa  69.3  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0609  hypothetical protein  37.61 
 
 
316 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  26.81 
 
 
395 aa  62.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  24.34 
 
 
325 aa  61.6  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  25 
 
 
398 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  23.88 
 
 
370 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  24.79 
 
 
380 aa  62  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  26.27 
 
 
397 aa  60.5  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  23.62 
 
 
390 aa  59.7  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  21.66 
 
 
384 aa  58.5  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  26.24 
 
 
412 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  29.27 
 
 
378 aa  57.4  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  27.4 
 
 
385 aa  57.8  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1386  integrase family protein  21.19 
 
 
344 aa  57  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.114707  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3493  integrase family protein  25.11 
 
 
409 aa  56.6  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.247982  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  25.81 
 
 
428 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  0.0000530695 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1569  integrase family protein  31.44 
 
 
422 aa  55.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  24.53 
 
 
435 aa  53.9  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  29.17 
 
 
431 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  26.95 
 
 
407 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  27.75 
 
 
477 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  26.94 
 
 
349 aa  52.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  25.09 
 
 
338 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  23.58 
 
 
354 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  23.58 
 
 
354 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2954  integrase family protein  23.64 
 
 
409 aa  51.6  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1378  integrase family protein  24.81 
 
 
416 aa  50.8  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.545263  hitchhiker  0.00000000645491 
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  24.37 
 
 
386 aa  50.8  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  24.46 
 
 
379 aa  50.8  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  21.7 
 
 
363 aa  50.4  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  28.14 
 
 
377 aa  50.4  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  25 
 
 
383 aa  50.1  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  25.08 
 
 
387 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1527  integrase family protein  23.89 
 
 
357 aa  49.7  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.115316 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0089  phage integrase family protein  24.15 
 
 
400 aa  49.7  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  20 
 
 
374 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  23.93 
 
 
377 aa  48.9  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2240  Phage integrase  26.38 
 
 
406 aa  49.3  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  20 
 
 
374 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  24.24 
 
 
391 aa  48.5  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  23.41 
 
 
369 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1462  Phage integrase  27.34 
 
 
387 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  21.04 
 
 
392 aa  48.5  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  25.95 
 
 
338 aa  48.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0746  phage integrase family protein  28.23 
 
 
384 aa  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05002  integrase  27.69 
 
 
345 aa  47.8  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3013  phage integrase family site specific recombinase  24.92 
 
 
419 aa  47.4  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  28.64 
 
 
334 aa  47.4  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  27.18 
 
 
431 aa  47  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  26.17 
 
 
426 aa  47  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  27.18 
 
 
398 aa  47  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0121  integrase family protein  27.8 
 
 
422 aa  46.6  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534504  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  22.79 
 
 
392 aa  46.6  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  25.73 
 
 
393 aa  46.6  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6923  integrase family protein  27.16 
 
 
430 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3323  integrase family protein  23.33 
 
 
373 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3933  integrase family protein  30.26 
 
 
344 aa  45.8  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00343242  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  22.16 
 
 
369 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2315  integrase family protein  24.79 
 
 
255 aa  46.2  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  27.18 
 
 
428 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  26.45 
 
 
374 aa  45.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4275  phage integrase  26.38 
 
 
393 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0146194  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0966  integrase family protein  21.54 
 
 
346 aa  45.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  23.31 
 
 
381 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  22.76 
 
 
446 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  22.76 
 
 
446 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  22.45 
 
 
369 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2649  integrase family protein  27.73 
 
 
333 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.413706  hitchhiker  0.000000656425 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  24.24 
 
 
385 aa  44.7  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  23.62 
 
 
368 aa  44.7  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  22.76 
 
 
430 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1115  integrase family protein  30.83 
 
 
365 aa  44.3  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3873  integrase family protein  24.07 
 
 
439 aa  43.9  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00124247  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2564  phage integrase family protein  22.29 
 
 
417 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.326638  hitchhiker  0.000921348 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  23.2 
 
 
276 aa  43.9  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  35.29 
 
 
443 aa  43.9  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  23.36 
 
 
383 aa  43.5  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  28.19 
 
 
412 aa  43.5  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0926  integrase family protein  27.89 
 
 
438 aa  43.9  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3848  integrase family protein  27.87 
 
 
327 aa  43.5  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250043  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  28.97 
 
 
275 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  22.87 
 
 
413 aa  43.1  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  21.68 
 
 
362 aa  43.1  0.008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  30.83 
 
 
407 aa  43.1  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  23.1 
 
 
378 aa  43.1  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2002  phage integrase  33.33 
 
 
188 aa  43.1  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3499  integrase family protein  23.04 
 
 
368 aa  43.1  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000340769  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  19.3 
 
 
376 aa  42.7  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1808  phage integrase family site specific recombinase  28.12 
 
 
352 aa  42.7  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.595703  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  19.3 
 
 
376 aa  42.7  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>