More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05002 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05002  integrase  100 
 
 		 345 aa  723    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1079  integrase  47.71 
 
 		 343 aa  330  3e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1340  phage integrase family protein  45.95 
 
 		 339 aa  309  5.9999999999999995e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.755571  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00832  hypothetical protein  44.8 
 
 		 338 aa  305  6e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0428035  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0909  phage integrase family site specific recombinase  44.8 
 
 		 343 aa  305  7e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046478  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2795  integrase family protein  44.8 
 
 		 350 aa  305  9.000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0861235  normal  0.105042 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2882  phage integrase  46.7 
 
 		 341 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.948794  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3066  phage integrase  46.7 
 
 		 341 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3152  integrase family protein  45.27 
 
 		 352 aa  300  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3514  phage integrase family protein  45.98 
 
 		 336 aa  297  2e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123025  normal  0.0375273 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3507  phage integrase family protein  44.86 
 
 		 345 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000014558 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2951  phage integrase  43.14 
 
 		 336 aa  272  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.339524  hitchhiker  3.4545800000000002e-18 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00815  integrase for prophage  43.57 
 
 		 314 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0720843  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1008  phage integrase  39.31 
 
 		 347 aa  252  7e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5040  prophage CP-933T integrase  39 
 
 		 371 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.530892  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2649  integrase family protein  42.78 
 
 		 333 aa  251  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.413706  hitchhiker  0.000000656425 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2307  integrase family protein  42.09 
 
 		 335 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.109793  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2622  integrase family protein  39.19 
 
 		 335 aa  238  8e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.647869  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0716  integrase  37.88 
 
 		 394 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0882  integrase family protein  42.63 
 
 		 313 aa  236  5.0000000000000005e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0269  integrase family protein  37.18 
 
 		 405 aa  235  9e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48880  putative bacteriophage integrase  37.57 
 
 		 338 aa  235  9e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000942528  hitchhiker  0.000000101575 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4348  site-specific recombinase, phage integrase family  36.73 
 
 		 326 aa  232  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.175546  hitchhiker  0.00000000567763 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4307  phage integrase family site specific recombinase  37.1 
 
 		 326 aa  228  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0756066  hitchhiker  0.00146275 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3848  integrase family protein  36.92 
 
 		 327 aa  227  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250043  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2932  integrase family protein  37.32 
 
 		 318 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2110  phage integrase family protein  37.57 
 
 		 335 aa  219  6e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717737  hitchhiker  0.00928356 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5364  integrase  38.66 
 
 		 332 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0981  phage integrase family site specific recombinase  34.68 
 
 		 331 aa  210  3e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.896677  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2810  integrase  34.2 
 
 		 336 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1917  integrase  34.4 
 
 		 375 aa  207  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3066  integrase  36.15 
 
 		 337 aa  202  5e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0315896  hitchhiker  0.000000103666 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0900  phage integrase family site specific recombinase  35.91 
 
 		 334 aa  197  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.198351  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53570  putative integrase  37.05 
 
 		 258 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000326616  decreased coverage  0.0000890956 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0092  Fels-2 prophage protein  41.34 
 
 		 191 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000678287  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1314  phage integrase  47.32 
 
 		 121 aa  108  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188949  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1313  putative integrase  34.78 
 
 		 172 aa  97.4  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0718359  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63440  bacteriophage integrase  42.61 
 
 		 126 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3056  integrase family protein  53.68 
 
 		 164 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0372474 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  30.04 
 
 		 367 aa  92  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  25.27 
 
 		 337 aa  87.8  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  25.88 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2705  integrase family protein  26.13 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.800791  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  25.7 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0772  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.5 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0370  phage integrase family protein  27.16 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2692  tyrosine recombinase XerD  24.15 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.457784  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0401  integrase family protein  26.67 
 
 		 304 aa  67  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.966282 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0684  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.18 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.631001  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  20.97 
 
 		 429 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  27.78 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  23.71 
 
 		 401 aa  64.7  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0677  integrase family protein  28.4 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.92563 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7575  tyrosine recombinase XerD subunit  28.24 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.440547  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  24.23 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646575 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1991  metallo-beta-lactamase family protein  25.54 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  23.5 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  27.97 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4502  integrase family protein  25.69 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3891  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.82 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.125291  decreased coverage  0.00274094 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2735  tyrosine recombinase XerD  28.31 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.206607 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0401  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.81 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.145415 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  24.32 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0523  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.43 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3665  integrase family protein  25.1 
 
 		 313 aa  62.4  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211751 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0669  phage integrase family protein  29.11 
 
 		 343 aa  62  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2512  tyrosine recombinase XerD  29.01 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234856 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  25.32 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2440  tyrosine recombinase XerD  27.06 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3835  tyrosine recombinase XerC  26.05 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.955587  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0488  tyrosine recombinase XerD  27.81 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3598  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.76 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0319  tyrosine recombinase XerD  24.9 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.944891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  29.35 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3449  tyrosine recombinase XerD  23.74 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0530  tyrosine recombinase XerD  25.82 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.931339  normal  0.0955198 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  24.16 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0292  tyrosine recombinase XerD  24.9 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  31.01 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2244  phage integrase family protein  22.49 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.16735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0805  tyrosine recombinase XerD  24.4 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0752  phage integrase family site specific recombinase  27.75 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.232674  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0537  tyrosine recombinase XerD subunit  32.89 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5304  site-specific recombinase, phage integrase family  25.86 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  24.02 
 
 		 354 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  25.23 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2381  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.48 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  24.02 
 
 		 354 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1439  integrase family protein  27.16 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.110569  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1196  tyrosine recombinase XerD  26.39 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0670859  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1457  integrase family protein  25.17 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3524  tyrosine recombinase XerD  23.74 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0393  tyrosine recombinase XerD  27.81 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543195  normal  0.555297 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3643  tyrosine recombinase XerD  23.74 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3228  tyrosine recombinase XerD  25.1 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.302685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  27.93 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  24.78 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0843  tyrosine recombinase XerD  23.74 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  26.97 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>