More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0831 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  100 
 
 
378 aa  750    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  56.52 
 
 
391 aa  390  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  38.64 
 
 
370 aa  262  6e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  33.33 
 
 
369 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  39.95 
 
 
368 aa  242  9e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  37.93 
 
 
374 aa  242  9e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  37.93 
 
 
374 aa  242  9e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  33.07 
 
 
369 aa  239  5e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  36.96 
 
 
385 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  38.26 
 
 
390 aa  233  6e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  33.24 
 
 
369 aa  232  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  33.59 
 
 
435 aa  227  2e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  35.05 
 
 
381 aa  224  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  38.66 
 
 
383 aa  223  6e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  34.83 
 
 
370 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  34.11 
 
 
383 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  32.55 
 
 
373 aa  203  3e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  35.26 
 
 
386 aa  196  7e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  36.14 
 
 
387 aa  196  7e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  33.15 
 
 
363 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  31.9 
 
 
325 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  36.36 
 
 
414 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  34.33 
 
 
463 aa  171  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  38.53 
 
 
377 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  35.57 
 
 
378 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  31.94 
 
 
400 aa  168  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  35.62 
 
 
379 aa  169  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  35.45 
 
 
377 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  33.42 
 
 
374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  32.74 
 
 
392 aa  164  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  31.13 
 
 
392 aa  162  7e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  35.36 
 
 
477 aa  160  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  28.5 
 
 
391 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  35.05 
 
 
305 aa  157  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  27.3 
 
 
389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  33.14 
 
 
367 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  33.24 
 
 
357 aa  149  7e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  36.57 
 
 
379 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  36.57 
 
 
379 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  30.54 
 
 
403 aa  144  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  32.64 
 
 
404 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  31.23 
 
 
409 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  31.12 
 
 
376 aa  137  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  27.15 
 
 
376 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  27.15 
 
 
376 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  28.46 
 
 
391 aa  134  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  26.75 
 
 
393 aa  133  5e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  25.44 
 
 
413 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  27.69 
 
 
384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  26.7 
 
 
388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  30.86 
 
 
398 aa  130  3e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  26.54 
 
 
376 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  33.33 
 
 
393 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  33.33 
 
 
442 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  26.28 
 
 
388 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  31.51 
 
 
426 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  25.73 
 
 
376 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  28.02 
 
 
443 aa  125  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  28.8 
 
 
381 aa  123  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  29.11 
 
 
381 aa  123  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  27.85 
 
 
392 aa  122  7e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  25.19 
 
 
451 aa  122  7e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  29.24 
 
 
383 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  25.98 
 
 
393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  30.97 
 
 
416 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  40.51 
 
 
487 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0563  phage integrase family protein  31.52 
 
 
361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  23.53 
 
 
370 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  34.32 
 
 
431 aa  113  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  43.02 
 
 
172 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  24.66 
 
 
378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6721  integrase family protein  25.28 
 
 
494 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.917048  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  33.33 
 
 
443 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0993  phage integrase family protein  49.12 
 
 
121 aa  110  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  31.56 
 
 
416 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  24.62 
 
 
386 aa  109  7.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0432  integrase family protein  31.83 
 
 
392 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  28.46 
 
 
387 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2157  hypothetical protein  50.51 
 
 
120 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00218836  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2095  phage integrase  50.51 
 
 
120 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000441723  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2312  hypothetical protein  50.51 
 
 
120 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.430324  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2337  hypothetical protein  50.51 
 
 
120 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1020  phage integrase family protein  23.14 
 
 
401 aa  107  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.085573  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1039  phage integrase family protein  23.14 
 
 
401 aa  107  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.1908  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  30.77 
 
 
471 aa  106  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  29.94 
 
 
385 aa  107  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  32.54 
 
 
209 aa  106  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  30.77 
 
 
471 aa  106  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6718  integrase family protein  28.68 
 
 
656 aa  106  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2625  phage integrase family protein  25.96 
 
 
409 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0300817  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0878  phage integrase  39.02 
 
 
429 aa  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  28.37 
 
 
422 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  28.09 
 
 
404 aa  103  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  27.37 
 
 
371 aa  103  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  22.77 
 
 
376 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913824  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  29.04 
 
 
422 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  42.2 
 
 
159 aa  102  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  33.7 
 
 
275 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  28.89 
 
 
402 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  30.56 
 
 
402 aa  100  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>