More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I3274 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 159 aa  327  5.0000000000000004e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  83.02 
 
 		 172 aa  274  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3903  phage integrase family site specific recombinase  86.08 
 
 		 99 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.823274  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  46.5 
 
 		 402 aa  132  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  45.45 
 
 		 367 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  45.7 
 
 		 421 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  41.72 
 
 		 404 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  43.05 
 
 		 412 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  46.05 
 
 		 429 aa  120  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  43.42 
 
 		 353 aa  118  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  39.33 
 
 		 401 aa  114  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  37.11 
 
 		 387 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  37.11 
 
 		 387 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  36.71 
 
 		 387 aa  104  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  36.71 
 
 		 387 aa  104  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1092  phage integrase  40.88 
 
 		 276 aa  104  5e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00970061  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2002  phage integrase  39.86 
 
 		 188 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  41.96 
 
 		 384 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  42.2 
 
 		 378 aa  102  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  40.71 
 
 		 354 aa  101  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  40.71 
 
 		 354 aa  101  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0770  phage integrase family protein  38.99 
 
 		 387 aa  100  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17567  normal  0.038003 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  40.54 
 
 		 384 aa  100  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  37.18 
 
 		 400 aa  99.8  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  40.41 
 
 		 251 aa  99.8  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  37.01 
 
 		 388 aa  99.4  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  38.67 
 
 		 393 aa  98.6  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  37.01 
 
 		 386 aa  97.4  7e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1136  phage integrase family protein  35.8 
 
 		 513 aa  97.1  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  33.95 
 
 		 324 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  40 
 
 		 359 aa  95.9  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  38.04 
 
 		 349 aa  94.4  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  39.02 
 
 		 275 aa  94  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  34.16 
 
 		 387 aa  93.6  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  0.00000000819042 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  39.31 
 
 		 379 aa  93.2  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  39.58 
 
 		 398 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0776  phage integrase  35.22 
 
 		 334 aa  92.4  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.0322595 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0996  phage integrase family protein  36.36 
 
 		 387 aa  92.8  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294682 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  40.27 
 
 		 482 aa  91.7  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0165  integrase family protein  35.81 
 
 		 369 aa  90.9  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  39.04 
 
 		 415 aa  90.9  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  40.27 
 
 		 396 aa  90.5  9e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  39.33 
 
 		 392 aa  89.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3005  phage integrase family site specific recombinase  36.91 
 
 		 369 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1532  phage integrase family site specific recombinase  36.91 
 
 		 369 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  32.56 
 
 		 390 aa  89.4  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3070  prophage DLP12 integrase  36.91 
 
 		 369 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3128  integrase family protein  36.31 
 
 		 384 aa  89.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  35.66 
 
 		 337 aa  89.4  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3300  phage integrase family site specific recombinase  36.91 
 
 		 369 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248425  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  33.55 
 
 		 334 aa  89  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  36.36 
 
 		 354 aa  87.8  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  34.25 
 
 		 341 aa  87.8  5e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  38.31 
 
 		 397 aa  87.8  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  34.19 
 
 		 338 aa  86.7  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1111  phage integrase family protein  35.42 
 
 		 329 aa  87  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  35.42 
 
 		 412 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2564  phage integrase family protein  36.48 
 
 		 417 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.326638  hitchhiker  0.000921348 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0089  phage integrase family protein  38.89 
 
 		 400 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  37.42 
 
 		 434 aa  85.1  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  33.71 
 
 		 377 aa  85.1  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  37.5 
 
 		 407 aa  85.1  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  35.63 
 
 		 431 aa  84.7  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  35.62 
 
 		 310 aa  84.7  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3047  phage integrase  36.94 
 
 		 381 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.182322  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 		 298 aa  84  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  31.58 
 
 		 370 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3971  integrase family protein  34.97 
 
 		 340 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  29.94 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0447  phage integrase  36.94 
 
 		 381 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0926  phage integrase family protein  36.94 
 
 		 381 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0526  phage integrase family protein  40 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0707528  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  35.1 
 
 		 314 aa  82  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3658  putative bacteriophage integrase  33.55 
 
 		 444 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  34.84 
 
 		 381 aa  80.9  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6626  putative prophage integrase  34.05 
 
 		 386 aa  80.5  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351385 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0495  integrase family protein  36.36 
 
 		 328 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  33.9 
 
 		 391 aa  80.1  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0710  Integrase protein  35.62 
 
 		 343 aa  79  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  32.26 
 
 		 451 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  34.27 
 
 		 414 aa  79  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  32.26 
 
 		 451 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3598  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.16 
 
 		 317 aa  79.7  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  32.26 
 
 		 451 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2567  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.73 
 
 		 313 aa  78.6  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0045  phage integrase family site specific recombinase  32.43 
 
 		 456 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.869382  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  34.57 
 
 		 372 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  31.68 
 
 		 310 aa  78.2  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1439  integrase family protein  33.1 
 
 		 317 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.110569  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  32.69 
 
 		 290 aa  77.8  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3891  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.16 
 
 		 317 aa  77.4  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.125291  decreased coverage  0.00274094 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  33.11 
 
 		 222 aa  77.4  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1560  tyrosine recombinase XerD  32.32 
 
 		 331 aa  77.4  0.00000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.736869  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3949  site-specific recombinase, phage integrase family  33.79 
 
 		 347 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0244166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  29.17 
 
 		 369 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  37.58 
 
 		 347 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  36.88 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  33.13 
 
 		 378 aa  76.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  32.3 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  37.58 
 
 		 347 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>