More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1281 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  100 
 
 		 429 aa  875    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  47.67 
 
 		 421 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  46.84 
 
 		 404 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  42.09 
 
 		 412 aa  296  7e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  35.7 
 
 		 401 aa  257  3e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3424  integrase family protein  35.14 
 
 		 437 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.728899 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3658  putative bacteriophage integrase  33.49 
 
 		 444 aa  222  9e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1997  site specific recombinase  42.91 
 
 		 279 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151252 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2002  phage integrase  57.05 
 
 		 188 aa  176  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  37.35 
 
 		 367 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  36 
 
 		 251 aa  142  9e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  37.3 
 
 		 353 aa  141  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1136  phage integrase family protein  28.74 
 
 		 513 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  28.74 
 
 		 388 aa  136  9e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  35.25 
 
 		 359 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  45.22 
 
 		 172 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0996  phage integrase family protein  27.25 
 
 		 387 aa  120  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294682 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  46.05 
 
 		 159 aa  120  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  32.48 
 
 		 275 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  34.3 
 
 		 397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  27.21 
 
 		 400 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3128  integrase family protein  30.62 
 
 		 384 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  28.14 
 
 		 393 aa  110  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0165  integrase family protein  30.97 
 
 		 369 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0789  phage integrase family protein  27.6 
 
 		 444 aa  108  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  29.46 
 
 		 354 aa  107  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  29.46 
 
 		 354 aa  107  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  28.68 
 
 		 386 aa  107  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  27.91 
 
 		 434 aa  107  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1092  phage integrase  31.28 
 
 		 276 aa  107  5e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00970061  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  28.79 
 
 		 397 aa  106  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  27.66 
 
 		 411 aa  106  9e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0770  phage integrase family protein  29.31 
 
 		 387 aa  104  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17567  normal  0.038003 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  29.36 
 
 		 338 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  29.6 
 
 		 349 aa  104  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  30.49 
 
 		 341 aa  103  5e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  29.53 
 
 		 324 aa  103  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  28.78 
 
 		 387 aa  103  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  0.00000000819042 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  43.66 
 
 		 381 aa  101  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  29.18 
 
 		 387 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  29.18 
 
 		 387 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  29.92 
 
 		 402 aa  97.4  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3300  phage integrase family site specific recombinase  28.29 
 
 		 369 aa  96.7  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248425  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3005  phage integrase family site specific recombinase  28.29 
 
 		 369 aa  96.7  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1532  phage integrase family site specific recombinase  28.29 
 
 		 369 aa  96.7  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3070  prophage DLP12 integrase  28.29 
 
 		 369 aa  96.7  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  28.87 
 
 		 337 aa  96.3  9e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  27.45 
 
 		 387 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  25.88 
 
 		 451 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  28.99 
 
 		 390 aa  95.1  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  29.53 
 
 		 378 aa  95.5  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25 
 
 		 374 aa  94.7  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25 
 
 		 374 aa  94.7  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  28.24 
 
 		 387 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  27.63 
 
 		 354 aa  94  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  30.31 
 
 		 334 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  29.58 
 
 		 375 aa  94  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0639  integrase family protein  31.27 
 
 		 374 aa  93.6  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  25.52 
 
 		 451 aa  93.6  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  25.42 
 
 		 369 aa  93.2  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  30.23 
 
 		 338 aa  92.4  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  39.86 
 
 		 392 aa  92.4  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  25.72 
 
 		 387 aa  92.4  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  29.45 
 
 		 347 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  29.45 
 
 		 347 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  25.47 
 
 		 467 aa  91.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  25.65 
 
 		 451 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0495  integrase family protein  29.75 
 
 		 328 aa  91.3  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  29.18 
 
 		 380 aa  91.3  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0045  phage integrase family site specific recombinase  25.91 
 
 		 456 aa  90.9  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.869382  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  28.04 
 
 		 374 aa  90.9  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  23.53 
 
 		 369 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  30.43 
 
 		 330 aa  90.5  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  28.04 
 
 		 374 aa  90.5  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  33.06 
 
 		 334 aa  90.1  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53570  putative integrase  29.34 
 
 		 258 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000326616  decreased coverage  0.0000890956 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  31.21 
 
 		 369 aa  89  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  38.96 
 
 		 407 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3848  integrase family protein  28.32 
 
 		 327 aa  88.6  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250043  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  29.09 
 
 		 351 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0089  phage integrase family protein  38.29 
 
 		 400 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  26.1 
 
 		 370 aa  88.2  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2797  phage integrase family protein  25.07 
 
 		 451 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0669  phage integrase family protein  29.69 
 
 		 343 aa  87.4  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  39.42 
 
 		 415 aa  87  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0526  phage integrase family protein  40.15 
 
 		 189 aa  87  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0707528  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  24.46 
 
 		 396 aa  86.3  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0108  shufflon-specific DNA recombinase  29.75 
 
 		 395 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  29.24 
 
 		 372 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0807  phage integrase family protein  26.73 
 
 		 323 aa  86.3  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  27.91 
 
 		 413 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  24.01 
 
 		 451 aa  85.5  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  25.25 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  28.36 
 
 		 351 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  32.65 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  26.9 
 
 		 482 aa  84.7  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  28.34 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1001  integrase family protein  29.96 
 
 		 333 aa  84  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0517  integrase family protein  27.48 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  23.2 
 
 		 379 aa  83.6  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>