More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0165 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0165  integrase family protein  100 
 
 		 369 aa  748    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1532  phage integrase family site specific recombinase  71.11 
 
 		 369 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3005  phage integrase family site specific recombinase  71.11 
 
 		 369 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3070  prophage DLP12 integrase  71.11 
 
 		 369 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3300  phage integrase family site specific recombinase  71.11 
 
 		 369 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248425  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  46.92 
 
 		 349 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  42.38 
 
 		 338 aa  260  3e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  40.87 
 
 		 341 aa  249  6e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  41.85 
 
 		 387 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  0.00000000819042 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  40.56 
 
 		 386 aa  248  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0770  phage integrase family protein  41.71 
 
 		 387 aa  246  4e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17567  normal  0.038003 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3128  integrase family protein  38.67 
 
 		 384 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  38.59 
 
 		 387 aa  243  3e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  38.59 
 
 		 387 aa  243  3e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  38.32 
 
 		 387 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  38.32 
 
 		 387 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0996  phage integrase family protein  37.18 
 
 		 387 aa  231  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294682 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1092  phage integrase  43.77 
 
 		 276 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00970061  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  45.9 
 
 		 324 aa  200  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3904  phage integrase family site specific recombinase  71.82 
 
 		 122 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.908319  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  29.18 
 
 		 354 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  29.18 
 
 		 354 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0710  Integrase protein  32.67 
 
 		 343 aa  122  9e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  35.68 
 
 		 353 aa  113  6e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6626  putative prophage integrase  27.92 
 
 		 386 aa  110  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351385 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  30.97 
 
 		 429 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  33.19 
 
 		 251 aa  100  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  28.52 
 
 		 404 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  30.77 
 
 		 421 aa  96.3  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 367 aa  93.6  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  28.57 
 
 		 401 aa  93.6  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  35 
 
 		 172 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  34.46 
 
 		 359 aa  91.3  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  35.81 
 
 		 159 aa  90.9  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  33.48 
 
 		 375 aa  90.9  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3047  phage integrase  26.49 
 
 		 381 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.182322  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  31.77 
 
 		 374 aa  90.5  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  31.9 
 
 		 374 aa  89.4  9e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0401  phage integrase family protein  34.83 
 
 		 332 aa  88.6  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1546  prophage DLP12 integrase  50 
 
 		 128 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1723  prophage DLP12 integrase  50 
 
 		 128 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.241784  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  30.32 
 
 		 337 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2002  phage integrase  38.67 
 
 		 188 aa  89  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4065  integrase family protein  25.84 
 
 		 394 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.438471  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  34.46 
 
 		 412 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1525  phage integrase family site specific recombinase  57.14 
 
 		 132 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0447  phage integrase  26.17 
 
 		 381 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0926  phage integrase family protein  26.17 
 
 		 381 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  32.31 
 
 		 413 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0639  integrase family protein  32.24 
 
 		 374 aa  85.5  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  30.53 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  33.51 
 
 		 347 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  33.51 
 
 		 347 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  37.02 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4388  integrase family protein  27.86 
 
 		 399 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.754595  normal  0.599822 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  32.82 
 
 		 351 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  38.33 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  29.78 
 
 		 402 aa  79.7  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  32.97 
 
 		 351 aa  79.3  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  36.21 
 
 		 356 aa  78.6  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0495  integrase family protein  30.97 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  24.41 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  33.89 
 
 		 372 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  30.84 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  30.95 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  29.35 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2622  integrase family protein  33.04 
 
 		 335 aa  75.5  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.647869  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3473  integrase family protein  25.38 
 
 		 392 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115261 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2312  hypothetical protein  22.67 
 
 		 364 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  32.54 
 
 		 275 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1808  phage integrase family site specific recombinase  28.69 
 
 		 352 aa  74.7  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.595703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2649  integrase family protein  29.39 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.413706  hitchhiker  0.000000656425 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0807  phage integrase family protein  30.86 
 
 		 323 aa  73.9  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0108  shufflon-specific DNA recombinase  30.88 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  33.71 
 
 		 407 aa  73.6  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  29.65 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3921  phage integrase family protein  28.83 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470105  hitchhiker  0.00183347 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0397  shufflon-specific DNA recombinase  27.81 
 
 		 353 aa  72.8  0.000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.759416  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2307  integrase family protein  28.47 
 
 		 335 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.109793  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  27.76 
 
 		 380 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  32.99 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0194  phage integrase  26.88 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334318  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2297  integrative genetic element Ppu40, integrase  28.7 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20500  Phage integrase  26.05 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2244  phage integrase family protein  30.84 
 
 		 348 aa  69.7  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.16735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2998  hypothetical protein  30.93 
 
 		 212 aa  68.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3805  integrase  31.98 
 
 		 332 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239705  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  29.38 
 
 		 338 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  27.64 
 
 		 295 aa  67  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1721  phage integrase family protein  31.53 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.108351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0335  phage integrase family protein  27.42 
 
 		 356 aa  67.4  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  29.82 
 
 		 379 aa  67  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3654  Phage integrase  28.15 
 
 		 340 aa  67  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000207497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0255  phage integrase  29.06 
 
 		 430 aa  67  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01212  site-specific recombinase, resolvase family protein  26.57 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3039  phage integrase  31.69 
 
 		 339 aa  67  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3980  phage integrase family protein  27.48 
 
 		 365 aa  66.6  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6962  integrase family protein  28.42 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3903  phage integrase family site specific recombinase  45.07 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.823274  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3658  putative bacteriophage integrase  28.77 
 
 		 444 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>