263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4065 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4065  integrase family protein  100 
 
 		 394 aa  795    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.438471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4388  integrase family protein  75.94 
 
 		 399 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.754595  normal  0.599822 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  34.66 
 
 		 354 aa  151  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  34.66 
 
 		 354 aa  151  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  26.84 
 
 		 349 aa  96.7  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  28.16 
 
 		 341 aa  89.7  8e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0165  integrase family protein  25.84 
 
 		 369 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3005  phage integrase family site specific recombinase  27.89 
 
 		 369 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3300  phage integrase family site specific recombinase  27.89 
 
 		 369 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248425  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1532  phage integrase family site specific recombinase  27.89 
 
 		 369 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3070  prophage DLP12 integrase  27.89 
 
 		 369 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  29.41 
 
 		 367 aa  87.4  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  27.92 
 
 		 338 aa  84  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  25.78 
 
 		 404 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  24.26 
 
 		 401 aa  77.4  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  27.08 
 
 		 429 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  25.26 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3980  phage integrase family protein  32.35 
 
 		 365 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  25.66 
 
 		 359 aa  73.2  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  25.57 
 
 		 387 aa  73.2  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  0.00000000819042 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  27.01 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0969  integrase family protein  26.83 
 
 		 348 aa  70.1  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.23183  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  28.57 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  23.29 
 
 		 421 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  26.35 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1092  phage integrase  28.4 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00970061  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  26.36 
 
 		 387 aa  67  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  25.5 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  26.1 
 
 		 434 aa  66.6  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  26.07 
 
 		 387 aa  66.2  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  29.94 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0354  phage integrase family site specific recombinase  23.68 
 
 		 355 aa  66.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1927  phage integrase family protein  23.96 
 
 		 424 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0770  phage integrase family protein  31.82 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17567  normal  0.038003 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1808  phage integrase family site specific recombinase  26.43 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.595703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3658  putative bacteriophage integrase  27.94 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1111  phage integrase family protein  23.91 
 
 		 329 aa  64.3  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  27.49 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  29.13 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  30.52 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  26.9 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  30.52 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3128  integrase family protein  29.41 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  29.89 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  27.27 
 
 		 415 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0776  phage integrase  23.83 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.0322595 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0996  phage integrase family protein  30.07 
 
 		 387 aa  62  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294682 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  26.53 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  24.58 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  30.46 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0710  Integrase protein  25.53 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1208  phage integrase  26.59 
 
 		 476 aa  60.8  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0745  phage integrase family protein  26.25 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.107824 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  27.53 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  21.97 
 
 		 370 aa  60.1  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1721  phage integrase family protein  26.32 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.108351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3678  integrase family protein  27.56 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  27.4 
 
 		 379 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  27.4 
 
 		 379 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  27.39 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6626  putative prophage integrase  25.63 
 
 		 386 aa  59.7  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351385 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  26.05 
 
 		 403 aa  58.9  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4490  phage integrase family protein  21.75 
 
 		 365 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6537  normal  0.0343494 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  25.6 
 
 		 251 aa  59.3  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5550  phage integrase family protein  21.75 
 
 		 365 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  26.64 
 
 		 393 aa  59.7  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  29.79 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  27.82 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  27.69 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2312  hypothetical protein  27.73 
 
 		 364 aa  58.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0805  phage integrase family protein  24.91 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.431807 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3586  phage integrase family protein  24.53 
 
 		 355 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3805  integrase  25.66 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239705  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0798  integrase family protein  24.44 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000196141 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  30.52 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0773  phage integrase family protein  24.44 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  24.13 
 
 		 301 aa  57  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  21.36 
 
 		 325 aa  57  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  29.45 
 
 		 347 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  29.45 
 
 		 347 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2489  putative integrase protein  26.69 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  26.58 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2612  phage integrase family protein  25.81 
 
 		 443 aa  55.8  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  26.62 
 
 		 402 aa  55.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  23.71 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  29.81 
 
 		 380 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  27.3 
 
 		 391 aa  55.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3039  phage integrase  31.4 
 
 		 339 aa  55.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4162  integrase family protein  29.65 
 
 		 396 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  25.94 
 
 		 330 aa  55.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2021  phage integrase family protein  27.13 
 
 		 418 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.713949  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3493  integrase family protein  26.43 
 
 		 409 aa  55.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.247982  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  24.72 
 
 		 414 aa  55.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  21.52 
 
 		 400 aa  54.3  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1262  integrase family protein  27.17 
 
 		 418 aa  54.3  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  28.75 
 
 		 384 aa  54.3  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1795  Integrase  27.24 
 
 		 407 aa  53.5  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2460  integrase family protein  30.15 
 
 		 415 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1386  integrase family protein  22.53 
 
 		 344 aa  53.1  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.114707  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  32.41 
 
 		 380 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>