More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3980 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3980  phage integrase family protein  100 
 
 
365 aa  748    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356268  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1111  phage integrase family protein  36.88 
 
 
329 aa  151  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30334  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  29 
 
 
367 aa  123  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  29.53 
 
 
359 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  27.2 
 
 
413 aa  105  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  27.47 
 
 
397 aa  97.1  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  30.71 
 
 
386 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  29.39 
 
 
374 aa  90.9  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1722  hypothetical protein  28.36 
 
 
339 aa  89.7  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  27.31 
 
 
337 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  30.47 
 
 
330 aa  88.2  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  28.25 
 
 
347 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  28.25 
 
 
347 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  29.47 
 
 
402 aa  87.4  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  29.01 
 
 
374 aa  87.4  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  32.37 
 
 
334 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3039  phage integrase  29.58 
 
 
339 aa  86.7  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  29.13 
 
 
251 aa  86.7  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  27.93 
 
 
351 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1092  phage integrase  28.05 
 
 
276 aa  84.7  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00970061  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  25.86 
 
 
387 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  25.86 
 
 
387 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4388  integrase family protein  31.33 
 
 
399 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.754595  normal  0.599822 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1522  phage integrase family site specific recombinase  27.16 
 
 
339 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  27.43 
 
 
351 aa  83.6  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0108  shufflon-specific DNA recombinase  29.73 
 
 
395 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  29.02 
 
 
353 aa  81.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  30.88 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  27 
 
 
324 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  29.69 
 
 
375 aa  80.1  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1487  phage integrase family protein  32.58 
 
 
342 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.115706  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  28.85 
 
 
410 aa  79.7  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3300  phage integrase family site specific recombinase  29.65 
 
 
369 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248425  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3005  phage integrase family site specific recombinase  29.65 
 
 
369 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3070  prophage DLP12 integrase  29.65 
 
 
369 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1532  phage integrase family site specific recombinase  29.65 
 
 
369 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2460  integrase family protein  30.98 
 
 
415 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  24.81 
 
 
387 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  24.81 
 
 
387 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  28.69 
 
 
380 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  27.65 
 
 
387 aa  76.6  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  0.00000000819042 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  31.78 
 
 
346 aa  76.6  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  26.04 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3921  phage integrase family protein  26.38 
 
 
327 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470105  hitchhiker  0.00183347 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3153  hypothetical protein  59.02 
 
 
101 aa  74.7  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0639  integrase family protein  26.69 
 
 
374 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0996  phage integrase family protein  24.79 
 
 
387 aa  75.1  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000294682 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  27.65 
 
 
275 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1808  phage integrase family site specific recombinase  30.6 
 
 
352 aa  73.9  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.595703  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  25.17 
 
 
379 aa  73.9  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  26.67 
 
 
354 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  26.67 
 
 
354 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4065  integrase family protein  32.35 
 
 
394 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.438471  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  26.07 
 
 
390 aa  73.6  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  25.86 
 
 
403 aa  73.2  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  23.39 
 
 
370 aa  72.8  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3971  integrase family protein  24.85 
 
 
340 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164476  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3278  phage integrase family site specific recombinase  38.03 
 
 
146 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  27.41 
 
 
349 aa  72.8  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1244  phage integrase family protein  25.25 
 
 
399 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.797454  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  33.78 
 
 
286 aa  71.2  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  25.79 
 
 
354 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1864  integrase family protein  28.83 
 
 
429 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0969  integrase family protein  24.78 
 
 
348 aa  70.5  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.23183  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2847  phage integrase  27.9 
 
 
366 aa  70.1  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  27.31 
 
 
338 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0770  phage integrase family protein  27.86 
 
 
387 aa  69.3  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17567  normal  0.038003 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  26.43 
 
 
398 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  34.18 
 
 
159 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  27.69 
 
 
451 aa  68.9  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  32.1 
 
 
172 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  30.7 
 
 
356 aa  68.2  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1633  phage integrase  25.79 
 
 
362 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  28.27 
 
 
393 aa  68.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3949  site-specific recombinase, phage integrase family  23.38 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0244166  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  24.86 
 
 
411 aa  67.8  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  25.81 
 
 
406 aa  67.4  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  29.84 
 
 
349 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  24.29 
 
 
337 aa  67  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0401  phage integrase family protein  27.1 
 
 
332 aa  66.6  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0165  integrase family protein  27.48 
 
 
369 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0495  integrase family protein  27.5 
 
 
328 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701129  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  26.12 
 
 
387 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0081  integrase family protein  30.86 
 
 
189 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  27.31 
 
 
444 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4162  integrase family protein  28.16 
 
 
396 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2240  Phage integrase  35.86 
 
 
406 aa  65.5  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  24.31 
 
 
400 aa  65.1  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2782  phage integrase family protein  30.05 
 
 
356 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507501  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1807  integrase family protein  24.7 
 
 
278 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.73649  hitchhiker  0.0000891918 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  24.46 
 
 
397 aa  65.1  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  30.99 
 
 
384 aa  64.7  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  33.07 
 
 
384 aa  64.7  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3045  phage integrase  24.83 
 
 
415 aa  64.3  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.172973 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0776  phage integrase  23.84 
 
 
334 aa  64.3  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.0322595 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2601  integrase family protein  24.83 
 
 
399 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3540  integrase family protein  25.99 
 
 
399 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2745  integrase family protein  24.83 
 
 
415 aa  64.3  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.99512  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2564  phage integrase family protein  27.68 
 
 
417 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.326638  hitchhiker  0.000921348 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3128  integrase family protein  23.44 
 
 
384 aa  63.9  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>