More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3879 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  100 
 
 		 349 aa  698    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0886  phage-related integrase  65.31 
 
 		 349 aa  414  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  55.65 
 
 		 360 aa  360  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  54.71 
 
 		 373 aa  353  2e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3344  phage integrase family protein  55.06 
 
 		 360 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563509  normal  0.0469601 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  44.77 
 
 		 346 aa  271  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6293  integrase family protein  45.56 
 
 		 344 aa  252  7e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2475  integrase family protein  40.48 
 
 		 345 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1177  integrase family protein  42.54 
 
 		 383 aa  225  7e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2771  phage-related integrase  38.72 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0966  phage integrase family site specific recombinase  36.95 
 
 		 341 aa  188  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.832131  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3025  integrase family protein  31.81 
 
 		 351 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282849  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0136  putative integrase for prophage CP-933U  36.1 
 
 		 277 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.872281  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2929  integrase family protein  32.11 
 
 		 351 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2653  integrase family protein  28.31 
 
 		 421 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534879  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1150  phage integrase family site specific recombinase  29.18 
 
 		 341 aa  108  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000198353  hitchhiker  0.0000000000000625111 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2817  site-specific recombinase, phage integrase family  29.18 
 
 		 359 aa  104  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000101654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2301  integrase protein  27.64 
 
 		 329 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.054386  hitchhiker  1.04073e-17 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1966  integrase family protein  31.06 
 
 		 353 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2355  phage integrase family site specific recombinase  29.41 
 
 		 334 aa  92.8  8e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6147  Integrase  26.73 
 
 		 344 aa  89.4  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2519  integrase family protein  31.93 
 
 		 346 aa  89  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2257  phage integrase family site specific recombinase  26.21 
 
 		 342 aa  89  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1129  site-specific recombinase, phage integrase family  27.93 
 
 		 339 aa  86.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3601e-24 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0988  integrase family protein  28.91 
 
 		 370 aa  85.9  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1328  phage integrase  27.46 
 
 		 333 aa  84.7  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.478819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1016  phage integrase family protein  25.75 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3384  phage integrase family protein  26.52 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000032973  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2865  phage integrase  28.23 
 
 		 370 aa  83.6  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.520837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3509  integrase family protein  26.52 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.167819  hitchhiker  0.00517521 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2250  phage integrase family site specific recombinase  27.2 
 
 		 338 aa  82.8  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.150880000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0970  integrase family protein  27.22 
 
 		 367 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605472  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  26.48 
 
 		 335 aa  82.4  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  28.57 
 
 		 325 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0617  phage integrase  26.67 
 
 		 383 aa  81.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.342043  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4758  integrase family protein  28.33 
 
 		 405 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1951  phage-related integrase  29.33 
 
 		 343 aa  79.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.242299  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6744  putative phage integrase  27.59 
 
 		 382 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1931  hypothetical protein  25.7 
 
 		 388 aa  76.6  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00772625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0275  phage integrase  30.1 
 
 		 359 aa  76.6  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0362718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1741  Phage integrase  25.91 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  27.15 
 
 		 353 aa  73.9  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4875  integrase family protein  30.99 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446933  hitchhiker  0.00171454 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  27.98 
 
 		 326 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  34.52 
 
 		 330 aa  72  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1790  phage integrase family protein  24.21 
 
 		 361 aa  70.9  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0999654  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0812  integrase family protein  29.25 
 
 		 385 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.427445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0995  phage integrase family protein  24.37 
 
 		 324 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0268254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3588  phage integrase  36.07 
 
 		 197 aa  69.3  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.385994 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4708  integrase family protein  35.11 
 
 		 342 aa  68.9  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.014031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3493  integrase  29.57 
 
 		 571 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0969  integrase family protein  25.57 
 
 		 426 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  29.75 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7358  integrase family protein  29.22 
 
 		 344 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210613  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  29.75 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0495  integrase family protein  35.2 
 
 		 328 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2419  phage integrase family protein  25.81 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1375  phage integrase family protein  27.57 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  34.31 
 
 		 338 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2847  phage integrase  36.02 
 
 		 366 aa  67.4  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  29.57 
 
 		 334 aa  67  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3949  site-specific recombinase, phage integrase family  27.51 
 
 		 347 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0244166  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3980  phage integrase family protein  29.84 
 
 		 365 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  31.25 
 
 		 251 aa  67  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  34.87 
 
 		 222 aa  67  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2857  phage integrase  25.68 
 
 		 359 aa  67  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  35.42 
 
 		 380 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  26.69 
 
 		 369 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2161  phage integrase family protein  27.89 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0108  shufflon-specific DNA recombinase  31.18 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  30.93 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0401  phage integrase family protein  29.36 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  35.04 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0398  shufflon-specific DNA recombinase  25.85 
 
 		 356 aa  65.1  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  26.84 
 
 		 369 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  34.13 
 
 		 375 aa  63.9  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1968  integrase/recombinase  31.31 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0676  phage integrase family protein  31.31 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2889  lambda integrase  25.51 
 
 		 356 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  normal  0.0727877 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 367 aa  63.5  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0800  phage integrase family protein  25.51 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.501928  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0877  phage integrase family protein  25.51 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  26.22 
 
 		 451 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  25.57 
 
 		 337 aa  62  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04371  hypothetical protein  31.54 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1111  phage integrase family protein  31.21 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  32.5 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1692  phage integrase  29.49 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.50677 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3971  integrase family protein  30.99 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  31.9 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2846  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  26.42 
 
 		 344 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  25.78 
 
 		 451 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1808  phage integrase family site specific recombinase  28.3 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.595703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  28.63 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3039  phage integrase  36.92 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0325  phage integrase  26.43 
 
 		 389 aa  60.5  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.701127  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  25.78 
 
 		 451 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0045  phage integrase family site specific recombinase  25.33 
 
 		 456 aa  60.1  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.869382  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  27.71 
 
 		 431 aa  60.1  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0619  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>